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腾讯登录西湖欧米 | 突破限制OmniProt深度血液蛋白组新品发布
| 导读 | 西湖欧米 | 突破限制OmniProt深度血液蛋白组新品发布 |
01 血液蛋白质组学研究充满挑战
血液是一种易于获取但又涵盖了大量生物学密码的临床样本。在临床蛋白质组学的逐渐蓬勃发展过程中，研究者利用血液蛋白质组学这一方法在推动疾病特异性生物标志物、疾病发生发展机制等研究中发挥了巨大的作用。
然而，血液蛋白质组学研究充满了挑战性。血液蛋白含量差异大，分布极为不均，高丰度蛋白占据几乎99%以上，追溯早前的研究可发现该领域进展相当有限，如1994-2002年期间血液蛋白质鉴定量仅为200+。直至近几年，血液蛋白质组开始大力发展，其鉴定量目前通常在几百到一千多。
2002年，仅能检测到289种蛋白质[1]
蛋白丰度越低，研究越少[2]
蛋白质组学研究的策略，通常是希望先尽可能发现较多的蛋白，从中挑选出有意义的biomarker后再进行相关的验证工作。
蛋白组学研究策略[3]
因此，亟需解决的第一步，是如何增加血浆中蛋白的检出。2002年，人类血浆蛋白质组计划HPPP(Human Plasma Proteome Project)启动，旨在解决血浆蛋白质组学中的主要挑战如灵敏度和分析深度等。近几年，随着技术发展，血液蛋白质组研究有了较大的进步。
目前HPPP中人血浆肽谱图数量
02 新品发布：OmniProt高深度血液蛋白组来袭
西湖欧米自成立以来，承接了诸多临床血液蛋白质组项目。目前，实测4个batch TMT检测总蛋白鉴定量高至2900+，单Batch蛋白鉴定量平均能达2500+。经团队潜心研发，现正式推出OmniProt深度血液蛋白质组服务，蛋白检出率显著提升！
化学微粒式富集血液中的中低丰度蛋白[4]
团队采用特色化学微粒式富集血液中的中低丰度蛋白，高深度TMT方法进行上机检测，目前，TMT单Batch蛋白鉴定量平均能达2500+，实测4个batch TMT检测总蛋白鉴定量高至2900+。当血液中蛋白含量增加时，我们发现OmniProt带来的中低丰度蛋白含量占比＞95%以上。因此，我们可从中发现更多的差异蛋白。
1 人血液项目升级前 vs 升级后蛋白鉴定数对比
2 OmniProt TMT技术重复相关性＞0.9
3 OmniProt-TMT 批次内和批次间CV的中位数<0.1
4 OmniProt法 不同实验分组的无监督聚类分析优异
5 OmniProt法 数据整体表达及整体聚类优异(未筛选)
OmniProt,带来的不仅仅是血液中蛋白数目的增多，而且更是在疾病探索中作为一个有力的工具，能够发现更多有意义的之前“不被看见”的蛋白。
03 新品尝鲜
新品推出，诚意满满，西湖欧米希望以OmniProt为助推器，尽可能抓住血液中更多的蛋白，为各位老师的研究保驾护航。
04 西湖欧米部分血浆蛋白组客户文章
参考文献：
[1] Anderson NL, Anderson NG. The human plasma proteome: history, character, and diagnostic prospects. Mol Cell Proteomics. 2002 Nov;1(11):845-67.
[2] Ignjatovic V, Geyer PE, Palaniappan KK, et al. Mass Spectrometry-Based Plasma Proteomics: Considerations from Sample Collection to Achieving Translational Data. J Proteome Res. 2019 Dec 6;18(12):4085-4097.
[3] Geyer P E, et al. Revisiting biomarker discovery by plasma proteomics[J]. Molecular systems biology, 2017, 13(9): 942.
[4]Liu Y, Wang J, Xiong Q, et al. Nano-Bio Interactions in Cancer: From Therapeutics Delivery to Early Detection. Acc Chem Res. 2021 Jan 19;54(2):291-301.
西湖欧米临床蛋白组科研服务特色
特色1：微量临床蛋白质组
♦ 专注优化基于PCT设备的微量蛋白组学前处理体系；
♦ 可实现低至0.1mg组织样本的分析，尤其适用于FFPE、穿刺等珍贵样品；
♦ 结合超高灵敏4D-DIA/4D-labelfree技术，适合极微量样本鉴定深度提升；
PCT蛋白组研究流程
特色2：高深度临床蛋白质组
♦ 超高深度TMT（30 Fraction），提供超高质量鉴定深度；
♦ 独家专利Pulse-DIA技术，比常规DIA提升10%-30%鉴定数；
特色3：OmniProt-TMT深度血液蛋白组
♦ 基于原有血液蛋白组TMT性能再次升级；
♦ TMT单batch平均蛋白鉴定数约≥2500；
♦ 中低丰度蛋白占比＞95%；
特色4：ProteomEx空间蛋白组学，解析空间异质性
♦ 特色膨胀水凝胶技术，实现细胞512倍放大；
♦ 实现多种组织样本膨胀以实现精准取样；
♦ 特色胶内酶解技术，高稳定性高重复性；
ProteomEx空间蛋白组研究流程
特色5：高通量宏蛋白组学
♦ 自主创新高通量流程，分析结果快速准确；
♦ 4D-DIA前沿技术平台，更灵敏更多菌群蛋白；
♦ 千人以上队列研究经验，一站式组学分析方案；
宏蛋白组研究流程
关于西湖欧米
西湖欧米由西湖大学特聘研究员郭天南老师创立，致力于以蛋白质组大数据技术创新为驱动力，联合AI多模态大数据分析，助力精准医学和药物研发，已经拥有多项国家专利和计算机软件著作权。西湖欧米目前已与百余家国内外知名高校及科研院所、医院、药企等建立了合作，并在国际顶级期刊Cell、Nature Medicine、Cell Discovery 等发表了多篇高质量蛋白组学研究合作成果。
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