Nature重磅封面专题！三连发！斯坦福大学、华盛顿大学等发布最新参考细胞图谱

胎盘图谱

从妊娠早期开始，胎儿来源的绒毛外滋养层（EVT）侵入子宫并重塑其螺旋动脉，将它们转化为大的扩张血管。已经提出了几种机制来解释EVT如何与母体蜕膜协调以促进有利于螺旋动脉重塑（SAR）的组织微环境。然而，哪些免疫细胞和基质细胞参与这些相互作用以及它如何随着胎龄而演变仍然是一个有争议的问题。

https://www.nature.com/articles/s41586-023-06298-9

7月19日，斯坦福大学的研究人员在《Nature》上发表题为“A spatially resolved timeline of the human maternal–fetal interface”的研究论文，通过对66例胎盘样本的50万个细胞和588条子宫螺旋动脉进行了细胞蛋白质标记和追踪分析，对孕早期的动脉重塑变化做出了迄今为止最详细的描述，除此之外，研究人员还确定了每个阶段存在哪些类型的母体免疫细胞，以及胎盘滋养细胞的确切位置。

子宫内的人类胚胎示意图，浅粉色为妊娠早期母胎界面的子宫螺旋动脉，到妊娠晚期子宫动脉被重塑，融合了胎盘细胞。

肠道图谱

肠道是一个复杂的器官，可促进消化、提取营养、参与免疫监视、维持与微生物群的共生关系并影响整体健康。单个细胞类型的定位、细胞类型发育轨迹和详细的细胞转录程序可能推动了这些功能的差异。

同日（7月19日），斯坦福大学的研究人员在《Nature》上发表题为“Organization of the human intestine at single-cell resolution”的研究论文，构建了人体肠道的第一张单细胞分辨率空间图谱。

https://www.nature.com/articles/s41586-023-05915-x

为了更好地了解这些差异，我们使用多重成像和单核RNA以及来自九个供体的八个不同肠道部位的开放染色质测定评估了单细胞的组织。通过系统分析，我们发现不同肠道区域的细胞组成差异很大，并证明了上皮亚型的复杂性，并发现相同的细胞类型被组织成不同的邻域和社区，突出了肠道中存在的不同免疫生态位。我们还绘制了这些细胞中的基因调控差异，这些差异暗示了调控分化级联反应，并将肠道疾病的遗传性与特定细胞类型联系起来。这些结果描述了该器官的细胞组成，调节和组织的复杂性，并作为了解人类生物学和疾病的重要参考图。

肾脏图谱

了解肾脏疾病依赖于定义细胞类型和状态的复杂性，它们相关的分子谱和组织邻域内的相互作用。

7月19日，华盛顿大学、密歇根大学、加州大学和印第安纳大学的研究人员在《Nature》上发表题为“An atlas of healthy and injured cell states and niches in the human kidney”的研究论文，构建了一个横跨肾脏的皮质髓轴的全面的空间解析健康和受伤单细胞图谱。

https://www.nature.com/articles/s41586-023-05769-3

研究中，我们将多种单细胞和单核测定（>400，000个细胞核或细胞）和空间成像技术应用于健康参考肾脏（45名供体）和患病肾脏（48名患者）。这提供了51种主要细胞类型的高分辨率细胞图谱，其中包括罕见和以前未描述的细胞群。多组学方法提供了跨越整个肾脏的详细转录组谱、调节因子和空间定位。我们还定义了肾单位节段和间质的28种细胞状态，这些状态在肾损伤中发生了改变，包括循环，适应性（成功或适应不良修复），过渡和退行性状态。分子特征允许使用空间转录组学在损伤邻域内定位这些状态，而大规模3D成像分析（约120万个邻域）提供了与主动免疫反应的相应联系。这些分析定义了与损伤时程和生态位相关的生物学途径，包括预测与肾功能下降相关的适应不良状态的上皮修复特征。这种健康和患病人类肾脏的集成多模态空间细胞图谱代表了细胞状态、邻里、结果相关特征和公开可用的交互式可视化的综合基准。（转化医学网360zhyx.com）

参考资料：

https://www.view.sdu.edu.cn/info/1021/181447.htm

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0304383523001374?via%3Dihub

https://www.researchgate.net/publication/371753387

https://www.ejcancer.com/article/S0959-8049(23)00127-2/fulltext

注：本文旨在介绍医学研究进展，不能作为治疗方案参考。如需获得健康指导，请至正规医院就诊。