VAT1基因特征：首都医科大学为胶质瘤治疗开辟新路径

2025年2月8日，首都医科大学附属北京天坛医院的研究团队在期刊《Heliyon》上发表了题为“A VAT1-related gene signature predicts radioresistance in gliomas”的研究论文。这项研究建立了5种基因特征，可以有效预测接受术后放疗的胶质瘤患者的生存率。免疫抑制性微环境是胶质瘤的一个特征，可能导致放射抵抗。

https://www.cell.com/heliyon/fulltext/S2405-8440(25)00963-6#au6

VAT1与胶质瘤

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定位于细胞质和线粒体的囊泡氨基转运蛋白 1（VAT1）被认为是胶质瘤患者的潜在预后因素。基因肿瘤学注释标明，VAT1具有氧化还原酶活性，可调节线粒体融合。在团队之前的研究中，VAT1的正相关基因在功能上参与了免疫反应、氧化还原过程和缺氧反应。此外，团队曾发现VAT1的表达与一些免疫检查点呈正相关，并在体外实验中得到验证，表明VAT1在胶质瘤中具有免疫抑制功能。鉴于上述原因，团队利用转录数据集筛选出了VAT1相关的耐放疗特征，以全面探讨VAT1与胶质瘤放疗的相互作用，并进一步挖掘其临床价值。

5个基因的功能和蛋白表达

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5个基因的注释表明，其功能主要涉及介导蛋白结合和发挥酶活性。聚类结果显示，5个基因的表达随风险评分、肿瘤分级和IDH状态而变化。从HPA数据库下载的免疫组化结果，显示了4个基因在不同患者中的蛋白表达水平。网站上没有TXNDC12对应的蛋白质信息。蛋白质表达水平分为低、中、高，柱状图显示，高级别胶质瘤（HPA数据库中提到的WHO 3级和4级）患者中特征基因蛋白质高表达水平的比例较大。根据RNA测序数据，等级越高，风险评分越高。

CGGA (A) 和 TCGA (B) 中与风险评分、IDH、肿瘤分级和生存状况相对应的5个基因表达热图。

总结

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1. VAT1相关基因特征：

VAT1高表达与肿瘤免疫抑制微环境的生成有关；

研究建立了与VAT1相关的5个基因特征，用于预测接受放疗的胶质瘤患者的预后；

K-M生存分析和ROC曲线显示，这5个基因对总生存期（OS）有显著影响，风险评分可稳健预测1至5年的OS；

多变量Cox回归分析表明，5个基因特征是独立的预后因素；

高风险评分组的免疫反应更活跃，免疫细胞浸润和免疫检查点表达与风险评分呈正相关，表明存在强烈的免疫抑制效应。

2. 关键基因的功能：

Taxilinα（TXLNA）：高表达预示胶质母细胞瘤（GBM）的不良预后；

DDOST：与胶质瘤的免疫抑制微环境有关；

GNG5：与肿瘤细胞增殖和迁移有关；

TXNDC12：在胶质瘤中高表达，与免疫细胞浸润呈正相关；

ARAP3：在中性粒细胞中高表达，调控整合素失活和中性粒细胞的募集和功能。

3. 临床意义：

高危评分患者可能需要更早、更大剂量的放疗，或放疗与其他策略相结合，以提高治疗效果。

参考资料：

1.Stupp, R. ∙ Taillibert, S. ∙ Kanner, A. ...

Effect of tumor-treating fields plus maintenance temozolomide vs. maintenance temozolomide alone on survival in patients with glioblastoma: a randomized clinical trial

JAMA. 2017; 318:2306-2316

2.Gebhardt, B. ∙ Dobelbower, M. ∙ Ennis, W. ...

Patterns of failure for glioblastoma multiforme following limited-margin radiation and concurrent temozolomide

Radiat Oncol. 2014; 9:130