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Advanced Science | 国家癌症中心王成锋团队揭示基因组结构变异与染色质三维结构重塑参与胰腺癌发生发展的机制
绝大多数的胰腺癌是起源于胰管上皮的胰腺导管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma, PDAC),近年来虽然在基础研究和临床诊治领域取得了一些进展,但胰腺癌患者的总体生存始终没有明显改善,突显出全面多维度地认识PDAC发生发展的分子基础已经变得尤为紧迫和必要。经典PDAC发展模型认为特定的遗传基因突变,如KRAS、CDKN2A、TP53和SMAD4等能相继启动和...
【Nature】首次!能模拟组织再生和肿瘤,三维重构类器官完美复刻人体器官
然而,当前的类器官技术具有根本的局限性,它们不能模拟成熟器官的结构,并且缺乏组织内的微环境,以及组织内各种细胞之间关键的相互作用。在癌症等难治性疾病的精确建模过程中,这一限制已被视为主要问题。 为此,韩国的一个研究小组提出了一种新的微型器官概念,称为“类组装体”(assembloid),它可以超越传统的类器官,并在结构和功能...
【新技术】3D肿瘤显微镜可对肿瘤组织进行三维角度分析,简化肿瘤诊断!价格便宜易操作!
目前临床中病理检查主要使用玻片成像技术(WSI),该技术可以扫描整个玻璃安装的H&E染色切片。生成的图像可以使用专门设计的软件进行分析。 该检查的缺点是局部切片,不能完全查看到病理组织的所有情况。由于这种方法的不可逆性,组织已完全用完,因此不再可用于某些分析,例如用于PD-L1的免疫组织化学测试。在PD-...
【新成果】周强工作室首次解析新冠病毒细胞表面受体ACE2的全长三维结构
导读:昨日,西湖大学周强实验室在Science杂志上发表了一篇关于新冠病毒的最新研究成果,首次解析了新冠病毒细胞表面受体ACE2的全长三维结构,以及表面蛋白S受体结合结构域与细胞表面受体ACE2全长蛋白复合物的三维结构。 SARS-CoV-2是一种正链RNA病毒,可引起人类严重的呼吸综合症。产生的冠状病毒病(COVID-19...
与数十位国际大咖面对面!第六届国际三维基因组学研讨会将于10月在北京召开
在基因组学发展中,以“人类基因组计划”和“人类基因组DNA元件百科全书计划”为代表的大规模研究项目,对人类基因组进行了测序,发现了大量的未知基因,尤其是非编码基因,而且发现了超过几十万个不同的基因调控元件。这些基因和调控元件都在三维的细胞核内完成它们的功能。研究表明,细胞核的三维空间结构对基因的表达和调控有着重要的影响。现在,新一代DNA测序技术和染色质交互检测技术的发展,使得...
颜宁2017年首篇《Cell》文章:脂类转运蛋白ABCA1三维结构
颜宁研究组一直以来都在针对胆固醇代谢调控通路进行系统的结构生物学与生物化学研究,在近年开始取得进展。去年其研究组在Cell上发文,报道了人源胆固醇胞内转运蛋白NPC1的冷冻电镜结构,在此基础上,他们又首次解析了人源ABCA1全长蛋白的近原子分辨率冷冻电镜结构,为理解ABCA1作用机制及相关疾病致病机理奠定了重要基础。 人源ABCA1蛋白的结构模型及其介导磷脂外向转运和初生H...
2017疾病特异性模型研究及应用--三维培养、iPSCs与类器官研讨会
会议简介: 主办单位:生物谷 时间:2016年3月3日~4日 会议规模:200人 地点:上海好望角大酒店 会议日程: 会议日程 3月3日 星期四 ...
施一公等在《科学》发文报道酵母剪接体三维结构
2016年12月16日,清华大学生命学院、结构生物学高精尖创新中心施一公教授研究组于《科学》(Science)杂志就剪接体的结构与机理研究再发长文(Research Article),题为《酵母剪接体处于第二步催化激活状态下的结构》(Structure of a Yeast Step II Catalytically Activated Spliceosome),报道了酿酒酵母(Saccharom...
阻断癌症侵袭的路径—科学家们已经捕获侵袭性癌钙穿梭分子的电子衍射图及三维重构
科学家们已经捕捉到与侵袭性癌相关的钙穿梭分子的画面。三维结构可以帮助研究人员开发由钙吸收障碍引起的疾病的新疗法和诊断工具。 Alexander Sobolevsky的实验室在哥伦比亚大学医学中心。该实验室正在研究一个被称为“瞬时受体电位(TRP)”通道的蛋白质家族。在体内,这些蛋白质排列在肠等器官的表面,并形成孔来帮助钙穿过一层致密的脂质和蛋白质的屏障,即细胞膜,到达细胞内部。 ...
黄凌博士:低成本,高效率肿瘤类器官三维培养方法
从生命诞生开始,细胞家族就一代接一代的往前跑,而癌细胞就是其中不愿意沿着跑道奔跑的“调皮细胞”。随着近年来负面新闻的越来越多,恐癌情绪挥之不去,大家纷纷担心,下一个会不会就是我?这无疑促使科学家们纷纷也与癌症展开了一场赛跑,希望在更多人患上癌症之前破解体内患癌的奥秘。 然而要真实了解人体内癌细胞是如何发生发展的,就要在手术或尸体解剖过程中分离癌细胞进行分析,不幸的是,大约...
Nature子刊:对抗癌症,试试三维细胞培养技术
恶性肿瘤已成为我国主要致死病因之一,而对肿瘤的早期诊断和有效治疗已成为各国生命科学研究的重点。学术期刊《Nature Medicine》近日刊登论文,介绍使用三维细胞培养技术从胰腺癌症病人组织中扩增和培养原代癌细胞类器官的新成果。该项技术使得研究者有望直接使用病人的组织进行有针对性的研究和快速而经济的个体化的药物测试。 该论文的通讯作者Senthil Muthuswamy...
美院士首次揭示DNA超螺旋的三维结构
最近,美国贝勒医学院的研究人员,使用一种多学科的方法,以前所未有的细节,揭示了超螺旋DNA的三维结构影像图,从而发现它的形状比著名的双螺旋更加动态。相关研究结果发表在最近的《Nature Communications》。 分子病毒学和微生物学系的Lynn Zechiedrich教授和美国科学院院士、生物化学和分子生物学系的W...
Science:中国科学家首次揭示病毒内部三维结构
自人类对疾病认识进入后基因组时代以来,科学家一直试图测定病毒的内部三维结构,这一工作近日被两位中国科学家率先完成。 9月18日,国际顶级学术期刊《Science》杂志发表了一篇题为“冷冻电镜揭示双链RNA病毒内部聚合酶和病毒基因组的非线轴结构”的论文。论文中,两位中国科学家首次将病毒的观察视角从“衣壳”深入到内部,改变了过去认为该类型病毒的内部基因组应呈线轴状排列...
施一公小组在《Science》发两篇论文报道剪接体三维结构
8月21日,清华大学生命科学学院施一公教授研究组在国际顶级期刊《科学》(Science)同时在线发表了两篇背靠背研究长文,题目分别为“3.6埃的酵母剪接体结构”(Structure of a Yeast Spliceosome at 3.6 Angstrom Resolution)和“前体信使RNA剪接的结构基础”(Structural Basis of...
《细胞》发表上海交大三维基因组结构和基因调控研究成果
14日,《细胞》杂志发表了上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学研究中心吴强教授团队题为《通过CRISPR遗传编辑技术反转CTCF位点改变基因组拓扑结构和增强子与启动子功能》的研究论文。该研究阐明了从一维基因组线性DNA元件“组装”成三维基因组立体拓扑结构的自然规律以及其调控基因表达模式的分子机制。 上海交通大学吴强课题组介...
Cell发布突破性基因组研究技术之3-D图像
来自美国麻省大学医学院的研究人员开发出了一项新技术,可以提供真核生物基因组的详细三维(3-D)图像,这有可能帮助科学家们解答一些有关染色质结构的关键问题。在发表于《细胞》(Cell)杂志上的研究论文中,这一称作为Micro-C的新技术使得研究人员能够以核小体分辨率来分析染色体折叠,填补了以往一些技术留下的分辨率缺口。 真核生...
周琪最新文章:生物三维打印的研究进展
三维(3D)打印具有灵活性和精密性的特点, 已在军工、航天等制造行业中发挥重要作用. 随之兴起的生物3D打印在再生医学领域同样具有广泛的应用前景. 生物3D打印是将打印的墨水改成含有活细胞的混合物, 从而构建活体组织器官. 目前生物3D打印更多的是应用于硬组织的仿生重建和新型给药装置的制备, 但具有生物活性、更复杂的组织器官的重建还处于探索阶段. 近期来自中国科学院动物研究所...
Cell:研究人员建立胰腺癌细胞三维培养模型
胰腺癌是最致命的癌症之一,在被确诊后只有6%的病人能存活5年。今天,冷泉港实验室(CSHL)和lustgarte基金会共同宣布了一项新研究成果,即在实验室条件下建立了正常胰腺细胞和胰腺癌细胞生长的模型系统。他们的工作为改变以往的胰腺癌研究方式提供了可能,允许科学家在胰腺癌发展过程中寻找新的药物靶点。 这项研究工作发表在12月30日的...
Nature:首次揭示癌症相关酶类同核小体相互作用的三维结构图
刊登在国际杂志Nature上的一篇研究论文中,来自宾州州立大学的科学家通过研究揭示了和BRCA1乳腺癌蛋白相关的酶类的功能,这项研究首次对这种名为多梳抑制复合物1(PRC1)的酶类蛋白进行了清晰地成像,而多梳抑制复合物1可以调节细胞的发育,而且和许多类型癌症直接相关。 类似于PRC1的酶类可以通过控制细胞中的核小体来开启/关闭基因的表达,核小体是指导机体关键遗传过程酶...
PLoS ONE:心跳紊乱检测有新法 X射线可生成高分辨三维图像
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