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专家访谈
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新的基因组数据库为调控DNA寻找靶基因
最近开展的大型基因组研究计划将有助于疾病的研究。 科学家们多年以来就意识到，基因组并不仅仅只是编码蛋白质的一系列遗传密码。它同时也是一块巨大的“开关板”，充满着可控制基因活性的DNA序列。基因组在调控方面的复杂性极大地阻碍了研究者们对疾病遗传学基础的探索，也阻碍了制药商们去寻找能够针对性地靶向于致病性DNA的药物。然而在过去的几个月里，一些大型的研究团队已经为基因...
Kimmel中心第一个加入GenomeDx的基因组数据共享计划
GenomeDx公司今天宣布推出临床基因组学数据共享计划，Sidney Kimmel癌症中心的Thomas Jefferson大学成为机构第一个合作伙伴。 被称为破译基因组资源信息数据库（Decipher GRID），该计划将允许如Kimmel癌症中心和其它的机构共享广泛的患者参与临床登记与试验新疗法的基因...
华大基因发布基因组数据分析云计算平台BGI Online
2015年4月20日，全球最大的基因组学研发机构华大基因在全球发布一款强大且具高安全性的基因组数据分析云计算平台服务产品 -- BGI Online。BGI Online为新一代测序项目的管理提供一站式解决方案，让用户可以轻松创建和运行复杂的数据分析流程。 现今对海量的新一代测序数据进行分析、存储和共享已成为巨大的挑战。BGI Online旨在为研究者解决面临的时间和成本难题。BGI O...
BioReference:合作共建全球基因组数据公开网络
BioReference Laboratories近日宣布其正式加入全球非盈利健康组织Pistoia联盟(http://www.pistoiaalliance.org/)及全球基因组学与健康联盟(GA4GH)。(http://genomicsandhealth.org/) BioReference作为正式成员加入Pistoia联盟，该联盟共有超过80家...
近1000个自闭症基因组数据向全球开放！
科技日报多伦多1月26日电 （记者冯卫东）由“自闭症之声”（Autism Speaks）资助的史上最大自闭症基因组研究项目发现，自闭症的遗传基础要比之前认为的更复杂，大多数自闭症谱系障碍（ASD）患者的兄弟姐妹拥有不同的自闭症相关基因。 史上最大自闭症基因组研究有重大发现 该项发现被作为封面文章刊载于26日出版的《自然·医学》杂志，...
《转》访孙洪业：收购NextCODE 布局基因组数据分析 “测一遍 读万遍”
《转》访栏目介绍：《转》访是转化医学网的品牌专访栏目，是业内专家、大佬、知名企业智慧交流碰撞的平台，也是促进行业健康发展的重要力量，《转》访致力于打造转化医学领域最知名的专家访谈栏目。 两周前，转化医学网获悉药明康德以6500万美金收购了NextCODE公司，当下立刻电话连线了药明康德基因中心首席运营官孙洪业博士，孙博士正在美国芝加哥出差，但他百忙之中还是抽出时间接...
NIH资助2340万美元促进病原体数据库建立
美国宾夕法尼亚大学和佐治亚大学今天宣布，他们已经收到了来自NIH的总共2340万美元的奖项继续共同发展运营真核病原体基因组学数据库。 该奖项由NIH美国国家过敏症和传染病研究所资助，将支持真核病原体基因组学数据库的核心基础设施购置，该数据中心包含疟原虫等致病真核生物的基因组信息。2014-2015年度该数据库将获得来自NIH的430万美元奖金，并且...
ICGC应用云平台深化开放其癌症基因组数据
国际癌症基因组协会(ICGC)在声明中表示已经选择了Annai系统在1万个ICGC所产生的人类癌症基因组项目中进行数据收集。 ICGC数据都会出现在基于云平台ShareSeq的Annai系统中，该系统将在短期内增加额外功能，支持研究人员联合分析他们自己的研究数据与ICGC数据库中的数据。 根据ICGC的声明，该项举措...
陈润生院士：生物大数据的核心是基因组数据
在2014年9月26日举行的生物大数据战略研讨会上，中国科学院生物物理研究所陈润生院士发表了精彩演讲。他从自己的研究工作出发，探讨了大数据的重要性及其所能带来的创新。其报告内容整理如下： 生物大数据最核心的部分是组学数据，而组学数据中最基础的数据是基因组数据，有了近年的基因组研究才派生出蛋白质组、代谢组、生物网络，也正是因为基因组的研究，才使得生物大数据实实在在地...
国际癌症基因组联盟（ICGC）：公布逾1万个癌症基因组数据
国际癌症基因组联盟（International Cancer Genome Consortium，简称"ICGC"）近日向科研界公布了超过1万个癌症基因组的数据。这些数据能更好地帮助全世界的癌症研究者从基因方面了解癌症，加快对癌症的研究并帮助更多癌症靶向治疗的发展。 安大略癌症研究所所长兼科学总监、国际癌症基因组联盟创始人之一TomHuds...
美国超级计算机XE6：分析240人的全基因组数据只需两天
随着技术的不断革新，基因组测序速度也在快速提升。最近，研究者在美国阿贡国家实验室（Argonne National Laboratory）利用一台型号为Cray XE6的超级电脑——Beagle进行基因测序分析，仅仅需要两天时间就可为240人进行基因组测序分析。 在今年的1月14日，Illumina公司将推出HiSeq X Ten和Next...
Nature网站专栏文章：未来基因组数据泄露不可避免
Steven Brenner是加州大学伯克利分校的遗传学教授。他的实验室主要涉及计算与实验基因组学的四个主要研究方向：可变剪切的基因调控与无义介导的mRNA讲解；利用贝叶斯系统生物学预测蛋白质功能；医学及环境宏基因组学；结构基因组学与蛋白质复合物。Brenner在Nature网站撰写专栏文章，认为随着基因组学的发展，在未来基因组信息的泄露是...
H3与华大基因联合开发、共享基因组数据 助力癌症药物研发
2013年3月21日，一家致力于肿瘤治疗研发的生物制药公司——H3生物医药（H3 Biomedicine）与全球最大的基因组学研究机构——华大基因，联合宣布双方在临床前癌症模型测序及相关基因组数据共享方面达成一致协议。本研究旨在识别及验证可用于药物治疗的潜在靶点——复发性基因突变，这将对整个肿瘤药物研发产业起到至关重要的作用。本着各自在开放式研究方...