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【Nature子刊】qPCR克隆条形码——助力癌症活细胞功能分析!

2022-07-06

来自哈佛医学院的研究团队针对目前单细胞分析方法不容易实现活细胞检索的局限性,开发了基于PCR的定量和下一代测序方法。了解细胞异质性和克隆适应性对癌症研究尤为重要。临床上,肿瘤内多样性与治疗反应、转移能力和患者生存率呈负相关。虽然肿瘤细胞亚群突变谱的差异可能是肿瘤异质性的最佳记录参数,但最终是功能异质性,这是遗传和非遗传异质性来源的结果,影响了疾病进展的过程。一种称为SunCatcher的分子...

【Cell】华人科学家及其团队创建条形码,快速破译癌细胞之间的“聊天”

2021-12-01

自1974年第一个条形码出现在口香糖包装上以来,现在,这个无处不在的条形码系统让制造商、零售商和消费者能够快速有效地识别、定位和追踪产品及材料。近日,期刊《Cell》上发表了一篇研究论文,名为“Deciphering cell signaling networks with massively multiplexed biosensor barcoding”。 ht...

【Cell】冷泉港实验室:DNA“条形码”测序可精准绘制大脑不同区域的远程连接

2020-07-17

  神经科学的一个核心问题是理解活动如何从神经回路产生,这些回路如何从基因产生,以及它们如何驱动动物行为。解决这一问题的一个强有力的方法就是整合来自多种实验模式的信息。在过去的十多年中,高通量方法已经使得基因表达和功能性神经活动能够在个体受试者的全脑范围内进行评估。   近日,冷泉港实验室(CSHL)开发了一种新的方法,利用DNA测序有效地...

Nature子刊:借助“细胞条形码”!追踪乳腺癌转移的秘密!

2019-02-21

早在去年,便有研究人员对三阴性乳腺癌多器官转移过程进行了高分辨率克隆定位。该研究将三阴性乳腺癌初诊时已转移患者治疗前原发乳腺肿瘤移植至小鼠体内,分析肿瘤转移期间的细胞克隆运动过程。各个转移灶可见多克隆播种并且维持低水平的不同亚克隆群。不过,肺、肝、脑转移聚集了高水平的相同亚克隆群,表明该研究结果表明,少见原发肿瘤亚克隆的分子特征,使其能够在人类三阴性乳腺癌动物移...

加拿大开发出DNA条形码融合技术 实验效率可提高10倍

2016-04-28

  据最新一期《分子系统生物学》报道,加拿大研究人员开发出一种新技术,可将DNA(脱氧核糖核酸)条形码拼接在单个细胞内,以同时搜索数以百万计蛋白质对之间的相互作用。   近年来,DNA条形码技术使科学家开展高并行试验(许多不同类型的细胞在同一试管内进行试验)成为可能,而新一代DNA测序技术的发展,进一步提高了对条形码计数和读取结果的...