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【Nature子刊】军事医学科学院伯晓晨团队开发新一代深度学习框架,可预测癌症基因模块
2024年7月17日,军事医学科学院伯晓晨团队在期刊《Nature Communications》上发表了题为“CGMega: explainable graph neural network framework with attention mechanisms for cancer gene module dissection”的研究论文。研究结果表明,CGMega可用于剖析癌症基因模块...
多组学视角!清华北大共同发文:揭示一种基于cfRNA用于动态监测癌症状态的方法
11月21日,清华大学和北京大学研究人员共同在期刊《Cell Reports Medicine》上在线发表题为“Cell-free multi-omics analysis reveals potential biomarkers in gastrointestinal cancer patients’ blood”的研究论文,研究人员揭示了结直肠癌和胃腺癌的细胞外核酸景观,使用了包括血浆基...
【Science】约翰霍普金斯大学联合耶鲁:表观遗传学结合数学以诊断及预测癌症
近日,约翰霍普金斯大学和耶鲁大学的研究者在国际顶尖学术期刊《Science》上发表了研究论文。这篇综述论文指出,通过数学建模可以将癌症的表型可塑性与驱动癌症的表观遗传变化联系起来。这种新的表观遗传定量方法可以更好地定义和测量基因功能中的表观遗传学缺陷及其与癌症遗传景观的相互作用,从而更好、更早地诊断癌症并预测其行为。 https://www.science.org/...
【Nature子刊】创新DNA纳米机器人——既可以调节血管又可以检测癌症
这种高度创新的“纳米机器人”能够更仔细地研究在微观水平上所施加机械力,这对于许多生物和病理过程至关重要。该研究发表在《Nature Communications》上,并向我们像这样描述:我们的细胞受到微观施加的机械力,可以触发对参与我们身体正常运作或疾病发展的许多细胞过程都至关重要的生物信号。 https://www.nature.com/articles/s4...
【Nature子刊】评估肿瘤特异性总mRNA水平可预测癌症结果!
德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员开发了一种新方法,他们从患者的肿瘤样本中量化肿瘤特异性的总mRNA水平,这些样本包含癌细胞和非癌细胞。利用这项技术对15种癌症中的6500多名患者的肿瘤进行研究,研究人员证明,癌细胞中较高的mRNA水平与患者存活率降低有关。 这项研究发表在《Nature Biotechnology》上。这种计算方法可以对肿瘤样本中的肿瘤特异性总mRNA水...
【PNAS】一滴血测癌?肺癌或能早发现
肺癌是癌症死亡的主要原因,通常是在生存率极低的晚期才被诊断出来。早期肺癌大多无症状,低剂量螺旋CT成像是目前检测早期肺癌病变的方法,由于成本高和重复筛查的辐射危害,不能作为一种广泛适用于一般人群的筛查检测。 发表在《Proceedings of the National Academy of Sciences 》杂志上的一项新研究为无症状患者“提供一滴血液...
【eLife】红外指纹可以帮助检测癌症?前景光明!
癌症可以在我们体内的许多地方生长,并对我们的健康造成巨大威胁。但是,如果能在早期发现癌细胞的生长,那么成功治愈的机会将更大。有实现这一目标的方法吗?来自慕尼黑大学(LMU)激光物理部的宽带红外诊断(BIRD)研究团队揭示,红外光谱图谱可以用于拾取实体瘤在我们血流中留下的分子痕迹。 检测早期和侵袭性较低的癌性病变对于有效的药物治疗选择至关重要。除了使体内肿瘤组织显影的...
【Nature】智能显微镜载片真的可以检测癌症吗?科学家带你一探究竟!
最近,一项发表在《Nature》杂志一篇题目为“Colorimetric histology using plasmonically active microscope slides”的文章表明:通过在纳米尺度上修改传统显微镜载玻片的表面,生物结构和细胞呈现出一种鲜明的颜色对比,可以用来立即检测疾病。 在过去五年里,项目负责人Brian Abbey教授一直在La...
【Nature子刊】癌细胞“隐身”怎么办?英美科学家利用数学模型预测癌症进化方向和免疫治疗效果
但癌细胞也不是“吃素”的,癌细胞之所以厉害,就是因为它有“隐身”功能,因此,免疫治疗也并不是对所有的癌症患者都有效。盲目进行免疫治疗不仅成本巨大,还可能适得其反,所以预测癌症的进展和免疫治疗的有效性十分重要。 对此,一个英美研究团队建立了一个数学模型,可以确定免疫系统...
【突破】RNA+DNA同时测序,检测癌症组织中的基因融合和碱基突变!
靶向治疗和免疫检查点抑制剂治疗目前已显著改善了肿瘤患者的生存率,而新型疗法的有效运用往往需要依赖于对基因变异的准确检测。当前的研究表明,诸如NTRK(神经营养因子受体酪氨酸激酶)等罕见的融合变异事件能有效地驱动肿瘤发生,并成为多种肿瘤中靶向治疗的靶标。基于DNA检测的大Panel可以覆盖几百个癌基因,是大规模探测突变的强有力工具,但在融合/重排检测方面仍具有一定挑战。靶向二代测序是一种能够综...
日本“一滴血测癌”技术可发现13种癌 准确度99%,明年将启动试验
据日媒报道,日本东芝公司25日宣布,将于2020年对其开发的早期诊断癌症新技术启动实证试验,此项新技术有望能从1滴血中检出13种癌症,且精度达到99%,力争数年内投入实用。 据介绍,此项技术基于东京医科大学及日本国立癌症研究中心的共同研究,通过检查分泌在血液中的名为“微核糖核酸”的分子种类及浓度,能在极早阶段发现乳腺癌、胰腺癌、食道癌、胃癌、大肠癌等13种癌症。该技术投入实用后有望...
通过机器学习预测癌症抗原能否引起免疫反应——新算法助力个性化癌症疫苗研究
近日,北卡罗莱纳大学的研究人员设计并验证了一个新的机器学习算法模型,该模型可以预测特定肿瘤特异性抗原产生免疫反应的能力,有助于克服研制个性化癌症疫苗的重大障碍。 抗原是免疫系统区分正常细胞和癌细胞的标志,而肿瘤新生抗原(Neoantigen)的发现对癌症的诊断、过继性免疫治疗、肿瘤疫苗、个性化治疗起着极其重要的作用。随着高通量测序技术的发展以及国际大型肿瘤基因组...
Cell:突破!新法有望预测癌症类型!
作者:Michael,Zoe 导 读 癌症免疫疗法可提高患者自身免疫系统的作用,使其能够更好地对抗癌细胞,因此这种疗法为一些先前难以治疗的癌症带来了巨大的希望。然而,免疫疗法并不是对每个人都起作用,这其中涉及的具体机制尚不明确。目前,该领域的大多数研究和由此产生的疗法大都集中在CD8 +...
《Science》重磅!新模型可100%预测癌症药物有效性!
在药物进入临床以前,我们都会进行药物的动物实验和临床前研究,但是多数情况下,我们并不能够很好的预测药物在人体中的疗效,即使其在动物实验中取得了很好的效果。 最近,发表在《Science》上面的一篇名为“Patient-derived organoids model treatment response of metastatic gastrointestinal cancers”...
NGS平行多基因检测癌症的可行性分析
早年前,就有Garrett M 1等人在Nature biotechnology上发表了通过Illumina HiSeq2000 高通量平台,建立了多基因NGS检测癌症变异分析的技术流程,并在大规模2000多例肿瘤石蜡包埋组织样本中得到验证,结果提示在76%的肿瘤组织中都检测到了可以进行用药指导的基因变异。 ...
Nat.Commu. | 这些基因可预测癌症转移、患者预期寿命!
近日,美国加州大学圣地亚哥分校生物工程和生物信息学家发现了肿瘤周围环境引发肿瘤细胞迁移行为的具体方式。研究人员发现,当肿瘤细胞过度集中于机体的有限微环境时,这些细胞就会启动一组特定的基因并开始形成类似于血管的结构。 该研究对应文章则发表于最新上线的Nature Communications杂志,名为3D collagen architecture induces a conserve...
葡萄糖溶液检测癌细胞 减少放射性副作用
在磁共振成像(MRI)时,造影剂被用于增强组织结构的成像。虽然它们加强血管和细胞之间的空间的信号,但是并没有达到细胞内部。相比之下,葡萄糖会被细胞吸收,然后在人体细胞内分解。癌症细胞对葡萄糖的需要远远高出正常的细胞,大量的葡萄糖才能够维持肿瘤组织的高速增长,因而,放射性的葡萄糖可以作为一种优良的造影剂,用来显示体内癌细胞的位置。但是具有放射性的造影剂对身体是有副作用的。 脑部肿瘤...
“滴血测癌”夸大其词,确切说法应为监测肿瘤!
前两日,转化医学网公众号发布了一篇《重大突破!一滴血可测癌症 已被批准临床使用》的文章,文章里提到:“清华大学生命科学学院罗永章团队自主研发出了一种专门检测热休克蛋白90α的试剂盒。患者只需取一滴血,即可用于癌症病情监测和治疗效果评价(注:没说一滴血就可以测出癌症)。”网友纷纷表示:“如果这是真的,那是重大喜讯啊!” 对此,浙江省肿瘤医院苏丹教授表示,“一滴血可测癌症”这种说法不...
一张“薄膜”10分钟检测癌细胞
近日,从扬州大学科技处获悉该校化学化工学院成功研制一种新型生物电化学检测芯片,其核心是一款基于聚合物自组装膜制备的生物电化学传感器,它将使癌细胞的检测变得如同血糖仪检查一样简单,为癌症的提早预防提供可能。 目前,国内各大医院常用的体液检测手段是免疫固定电泳法,其检测成本高、设备要求严、检测时间长,让大量的患者失去了治疗疾病的黄金时期。“我们科研团队以患者发病早期血液中会...
什么?尿液也能用来检测癌症?还很准?逗我呢!
这种新方法不同于以前的任何方法,因为他们不仅检测人体组织的DNA变化,同时还检测HPV病毒的DNA,这种病毒可以通过性传播,最终导致各种疾病。这项研究近日发表在《肿瘤预防研究》杂志上,文章作者认为他们这种检测基因标记物的新方法灵敏度更高,在鉴定所谓的CIN2损伤测试中准确率高达90.9%,CIN2损伤指不仅可能发展成为癌症,同时还可能发展成为高度转移性癌症的异常细胞导致的宫...