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专家访谈
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别让你的reads再做布朗运动了 —罗氏RNA序列捕获还原真实不同丰度RNA表达!
2015-05-27
近年来,遗传变异通过表达水平的改变从而影响癌症、糖尿病、心脏病等复杂疾病的发病日益受到研究者的重视。与之相关的全转录组分析也越来越成为研究热点。 常规的RNA测序(RNA-seq)能检测基因的表达丰度,检测未注释的基因,以及由于剪切而形成的复杂的基因亚型。然而由于转录本的表达丰度宽泛的动态范围,小部分高表达的转录本占据了细胞...
盘点RNA序列捕获最新出炉文献(下)
2015-04-07
上周我们一起回顾了3篇关于RNA序列捕获的研究文章,这周我们再来看3篇近期发表的文献: 1.Nat Biotechnol. 2014 Sep;32(9):903-14. doi: 10.1038/nbt.2957. Epub 2014 Aug 24. A comprehensive assessment of RNA-seq accuracy, r...
盘点RNA序列捕获最新出炉文献(上)
2015-03-24
上周末,一篇利用对lncRNA的捕获测序进行癌症研究的文章吸引了大家的眼球。其实这种针对lncRNA的捕获测序,正是利用罗氏NimbleGen最新上市的产品SeqCap RNA序列捕获探针库实现的。SeqCap RNA与传统外显子捕获测序方法几乎完全相同,然而当被捕获的文库从基因组变成了转录组,则可发现许多转录本可变剪切信息以及一些低丰度的转录本。 ...