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专家访谈
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双平台，双满分！解码DNA满分通过NCCL 2023年肿瘤体细胞突变高通量测序检测生物信息学分析室间质评
近日，国家卫生健康委临床检验中心（NCCL）公布了2023年全国肿瘤体细胞突变高通量测序检测生物信息学分析室间质量评价结果报告。 解码DNA实验室分别参与了华大BGI和Illumina两个测序平台的生物信息学分析室间质量评价，均以100分的成绩完美通过！此次获得权威机构的认可充分展现了解码DNA强大的多测序平台生物信息学分析能力，证明了解码DNA在操作规范、流程控制、质量监督、技...
81岁院士授课“一座难求”，中国生物信息学研究第一人当之无愧
《生物信息学》“一座难求” 01 在中国科学院大学，如果想去听陈润生院士的《生物信息学》，8:30开始的课，最好刚过6点就去占座。然而，一切的前提是能够“抢”到这门课。线上选课，600个名额“秒空”。学校又连续增补了两次名额，最终扩容到约900人。因此，《生物信息学》开在能容纳上千人的学生礼堂。 陈润生是中国第一个开设《生物信息学》课程的人，在8年里...
【最新日程】西安交大联合晶能生物举办“单细胞多组学技术与生物信息学分析研习班”，诚邀报名！
单细胞测序技术的快速发展，不仅为系统地研究细胞功能动态性、结构多样性及其内在分子机制提供了前所未有的广度和精度，而且将经典细胞生物学、发育生物学、基因组学和计算生物学引入了单细胞层面，促进了从更多维度研究各系统、器官、组织及各主要发育阶段和重要疾病状态下各类细胞的内在规律、相互关系、稳态失衡。同时，单细胞技术及其数据的生物信息学分析也已成为探索生物学底层机制和研究人类复杂疾病的诊断、治疗及预...
【行业动态】生物信息学公司Sema4在C轮融资中融资1.21亿美元
Sema4在7月29日表示，它已经在一轮超额认购的C轮融资中筹集了1.21亿美元，使这家基因检测和数据分析公司的估值超过10亿美元。 Sema4是一家以患者为中心的健康情报公司，其创立的理念是：更多的信息、更深入的分析和更多的参与，改善疾病的诊断、治疗和预防。Sema4从生殖健康和肿瘤学领域开始，致力于通过建立人类健康的动态模型和定...
【新进展】生物信息学家利用RNA测序指导胃癌的个性化药物处方方法
免疫治疗是目前胃癌的最新治疗手段，然而，患者对治疗的反应往往是不可预测的，因此需要针对具体情况制定个性化疗法和药物处方。近日，莫斯科物理技术学院（MIPT）的研究人员首次开发了一种基于肿瘤细胞RNA测序的个性化胃癌治疗技术，给胃癌的治疗带来了新的思路。 这项研究由莫斯科物理技术学院转化基因组生物信息学实验室高级研究员Maxim So...
突破 | 北京希望组(GrandOmics)正式面向全球提供基于PromethION平台的人类基因组重测序及生物信息学服务
2018年6月21日，北京希望组（GrandOmics）顺利通过Oxford Nanopore公司官方质量体系考核，获得PromthION平台DNA测序认证服务供应商资质，这标志着北京希望组成为了全球第二家可以提供高质量PromethION DNA测序服务的公司。北京希望组将充分利用新技术平台的先发优势，正式面向全球提供PromethION人类基因组重测序（SV检测）服务。 ...
百迈客：引领生物信息学产业2.0时代
生命科学与信息科学已经发生了不可割裂的融合。上世纪90年代的人类基因组计划，让我们窥见了生命储存、传递与表达信息的本质属性与无限潜能。随着基因测序技术成本大幅下降、基因数据大量积累，生物信息学产业进入跨越式发展，正在革新我们的医疗技术、重塑普通人的健康。 但变革最大、获益最多的，仍是科研领域。一个面向生命科学工作者的信息服务产业应运而生。作为中国最初一批生物信...
【NGS市场分析】生物信息学人才成“香饽饽”！
3月份，美国美林银行与GenomeWeb网站联合开展的一项研究显示如今的测序市场需求依旧旺盛，NGS设备也正在迈出传统的学术机构，飞入更多的行业。 研究人员对涵盖了生命科学和DNA测序领域的300多位来自科研机构、生物制药以及医疗中心的从业人员进行调查。在这些受访者中，有60%的人自己所在的实验室或研究所拥有NGS系统和核心设备，而7%的受访者表示计划在将来12个月内购买NGS。...
第四届全国计算生物学与生物信息学学术会议 第二轮通知
中国生物工程学会 第四届全国计算生物学与生物信息学学术会议 第二轮通知 高通量测序技术的快速应用与精准医疗研究的快速发展，产生了各种海量组学数据，这不仅对生物医学研究人员提出了新挑战，也对计算分析的软硬件提出了新的挑战。计算生物学与生物信息学是应对这种挑战的最好综合交叉学科，同时也得益于高通量测序技术与计算机技术在生物医学领...
临床精准医疗必须重视的新兴科学：临床生物信息学
由世界最大出版社“施普林格-自然”2016年出版的“临床生物信息学的应用”在短短几个月被下载近万次，引起国际同行的广泛重视和密切关注。该书融临床信息学、医学信息学、遗传信息学、生物信息学和系统生物学为一体，详细和系统地阐述了基因组学、蛋白组学、基因测序、基因表观学、代谢组学、计算机数学、大数据等在临床医学实践中的应用范围、分析条件、数据挖掘、信息说明。该书被认为是实现临床...
第三届全国计算生物学与生物信息学学术会议 第一轮通知
高通量测序技术的快速应用，产生了各种海量组学数据，这不仅对生物学研究人员提出了新挑战，也对计算分析的软硬件提出了新的挑战。计算生物学与生物信息学是应对这种挑战的最好综合交叉学科，同时也得益于高通量测序技术的快速发展，因此为加强计算生物学与生物信息学学科的发展和应用，促进专家学者的交流与合作，中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委 员会定于 201...
阿斯利康重金构建生物信息学系统，助力肿瘤个体用药
最近，阿斯利康在抗肿瘤领域可谓动作频繁。今年八月，阿斯利康与日本生物制药公司Sosei集团达成独家授权，获得了开发、生产及商业化腺苷A2A受体拮抗剂HTL-1071及潜在额外A2A受体阻断剂的全球独家权利；与美国的Peregrine Pharmaceuticals公司签订了一项关于PD-L1药物联合疗法的合作协议。而早在今年四月，阿斯利康还就血液肿瘤药物...
阿斯利康同曼彻斯特大学合作投资1770万美元用于进行肿瘤生物信息学的研究
近日，阿斯利康公司同曼彻斯特大学达成合作协议，计划在未来5年里投资1150万英镑（1770万美元）在临床试验中利用生物信息学工具来开发针对肿瘤患者的更为个体化的新型疗法。 需要特别指出的是，这项投资将全力支持曼彻斯特大学的相关研究；据阿斯利康消息显示，这笔资金将会支持一系列计划，比如开发新型的生物信息学系统，用来实时捕捉且整合临床试验安全性、有效性、生物标志物以及药物...
精准医学：肺癌个体化治疗 “牛”团队连发10篇高分SCI
上海市临床生物信息学研究所是上海市卫计委批准的、依托复旦大学中山医院、融临床信、分子组学和生物信息学为一体的临床生物信息学研究发展平台 (www.fuccb.com ; www.fuccb.org )。其中，王向东教授的研究团队主要致力于研究急慢性肺损伤和肺癌致病分子机理、生物标记物、和精准靶向诊治。通过基础研究来解决临床上面临的实际问题，...
专家推荐：经典生物信息学论文
今天的世界大不同，表现在生命科学研究领域，就是一切都开始进入了大数据时代，无论是DNA序列，显微图片，还是质谱数据，研究人员都越来越需要对这些庞大的信息进行收集、整合、处理和诠释。 近期The Scientist杂志联系了几位科学程序员，了解他们所使用的工具是什么，如果是菜鸟需要进行哪些训练等。 自动化与归档 加州大学戴维斯分校的C....
CDC拨款230万用于开发抵御感染性疾病的新一代测序技术及生物信息学技术
上周，美国CDC宣布他们将在2016财年上拨款230万美元用于支持新一代测序技术及生物信息学技术的开发，旨在帮助改善美国感染性疾病疫情爆发的快速先进的检测诊断。 这项资助将通过流行病学及实验室能力的合作协议来进行分配，这项合作协议的任务就是帮助国家和社区解决那些已知和新发现的传染病。 据CDC生物信息学高级顾问Duncan MacCannell表示，特别是来自C...
Bioinformatics：新型的在线生物信息学工具可以有效对多种基因组进行分析
近日，一项发表于国际杂志Bioinformatics上的研究论文中，来自英国的研究者开发了一种新型的生物信息学流水线，其可以针对多个基因组物种进行自动化的引物设计，从而明显缩短了出具报告的时间。 进行基因组学研究的关键一方面就是在育种上进行合适的个体选择，因为这有可能关乎物种的DNA以及其物理特性或表型，同时也可以帮助鉴别优秀特质的DNA区域，比如高产或对疾病耐受等。...
上海市临床生物信息学研究所在中山医院成立
上海市临床生物信息学研究所成立和学术研讨会于12月22日在我院召开。上海市卫生和计划生育委员会科教处张勘处长、复旦大学上海医学院包志宏副院长、我院朱同玉副院长参加会议。会上，张勘处长宣布了上海市卫生和计划生育委员会关于成立“上海市临床生物信息学研究所”的决定和任命。 上海市临床生物信息学研究所挂靠在复旦大学附属中山...
Eagle助力宝洁 实现基因组与生物信息学的跨领域应用
宝洁(P&G)签订了一份为期四年的协议，使用生物信息学软件来帮助其促进包括制药、消费品和生物燃料等新产品的开发。 该公司将使用Eagle Genomics公司的云端安全系统Eaglecore平台整合现有的数据，并对公司现有数据重新进行分析和集成。 Eagle公司CEO Abel Ureta-Vidal博士在声...
NeoGenomics与生物信息学公司合作，将测序技术投入临床应用
生物信息学公司N-of-One今天宣布与NeoGenomics实验室合作共同对癌症基因诊断公司所提供的诊断测试结果进行分析与注释。 根据协议，莱克星顿的N-of-One公司将对NeoGenomics通过基于新一代测序技术的固体肿瘤基因检测得出数据进行分析与注释，对所进行测试中的多种亚型固态肿瘤细胞的常规性和可操作基因组异常进行分析与评估。 NeoGenomics...