Foundation Medicine宣布在NCI平台上共享18000个成人癌症病人的基因组信息,助力癌症登月计划
导读 | 如果美国副总统拜登的癌症登月计划真的能使癌症的预防、诊断以及治疗事半功倍,那么这个计划一定不会离开大量的数据支撑。 |
如果美国副总统拜登的癌症登月计划真的能使癌症的预防、诊断以及治疗事半功倍,那么这个计划一定不会离开大量的数据支撑。这便意味着越来越多数据的共享被整个业界所急需,正如在本周的华盛顿癌症登月计划峰会上,肿瘤基因组测序公司Foundation Medicine决定向NCI无偿共享其肿瘤基因组测序数据。
“虽然Foundation向NCI提供的数据库并不包括病人临床用药的应对信息,但是其对于NCI现有数据库的巨大贡献仍然是毋庸置疑的。”NCI癌症基因组学中心主任Louis Staudt表示。数据库的规模越大,基于这个数据库的研究与研发工作便会愈加顺利。“除了使原有数据库的样本量翻了一番之外,这一数据共享还将大大地提高NCI癌症数据库对于癌症发病的解释能力。”Staudt说。
精准医疗的中心思想在于尽可能地应用更多的生物学信息确保疾病的治疗方法与疾病患者及其疾病最为契合。癌症精准医疗的关键问题在于癌症具有超过200种类型以及更多数量的亚型,癌症的类型及其亚型通常根据肿瘤基因组的特定异常获得定义。
“某些类型的癌症只在极少数人身上出现,而针对于这些罕见癌症的靶向药物少之又少。大量的数据可以帮助我们找到导致这些罕见癌症发生的基因变异,并进一步帮助我们开发针对于这些癌症的靶向药物。扩大NCI数据库样本量对于这一工作来说具有巨大的意义。”Staudt说。
Staudt希望Foundation Medicine的数据库共享能够能够激发其他公司的类似举动,这对于癌症基因组研究来说将是一次意义非凡的变革。与此同时,NCI也将继续通过诸如NCI-MATCH等创新临床试验生成自己的新数据。NCI-MATCH项目致力于对大量肿瘤基因组中存在特殊变异的病人进行靶向疗法测试。
“理想状态下,大量的病人测序信息与详细的临床信息都是十分必要的,尤其是关于疾病治疗效果的数据。”美国临床肿瘤学会CEO Clifford Hudis说。“这便意味着临床医生必须改善他们医疗记录的数据输入并通过计算机对这些数据进行充分的处理与分析。”
但是由于病人对隐私保护以及医疗数据共享监管的担忧,将上述多种临床和医疗信息进行综合分析便成为了一个复杂的问题。同时,商业实体很难成为数据共享事业的组成部分。Foundation表示该公司的数据共享行为仅仅是为了加速精准医疗倡议的实施,不带有任何盈利目的。“这个举措或许能使我们短暂地领先于同类竞争者。” Hudis说。
(转化医学网360zhyx.com)
美国副总统拜登
为了使癌症登月计划加速实施,拜登曾要求癌症的研究者与各大学府、企业以及政府机构加强在数据共享方面的合作。如今,测序诊断业大鳄Foundation将与NCI共享其1.8万例肿瘤患者的肿瘤基因组测序数据。这也是首次产业界助力NCI的基因组数据共享计划(Genomic Data Commons)。Genomic Data Commons是一个公共的癌症基因组分析平台和数据库。Foundation所提供的1.8万病例数据使Genomic Data Commons的数据容量短期内得到翻倍,这对于拜登副总统的癌症登月计划甚至奥巴马总统的精准医疗倡议来说都有着极大的影响。这一巨大的变革将促使科研人员更加有效地研究不同癌症中的基因异常,促进新兴癌症疗法的开发。
在此之前,NCI数据库拥有1.45万例肿瘤患者临床测序数据,其中包括这些病人临床用药的应对信息。诸如Genomic Data Commons的大型数据库不但可以帮助研究人员更加深入地认识癌症的本质,而且能够帮助研究人员阐明肿瘤耐药性产生的原因并进一步指导癌症患者的临床用药,从而实现个性化给药以及精准医疗。“虽然Foundation向NCI提供的数据库并不包括病人临床用药的应对信息,但是其对于NCI现有数据库的巨大贡献仍然是毋庸置疑的。”NCI癌症基因组学中心主任Louis Staudt表示。数据库的规模越大,基于这个数据库的研究与研发工作便会愈加顺利。“除了使原有数据库的样本量翻了一番之外,这一数据共享还将大大地提高NCI癌症数据库对于癌症发病的解释能力。”Staudt说。
精准医疗的中心思想在于尽可能地应用更多的生物学信息确保疾病的治疗方法与疾病患者及其疾病最为契合。癌症精准医疗的关键问题在于癌症具有超过200种类型以及更多数量的亚型,癌症的类型及其亚型通常根据肿瘤基因组的特定异常获得定义。
“某些类型的癌症只在极少数人身上出现,而针对于这些罕见癌症的靶向药物少之又少。大量的数据可以帮助我们找到导致这些罕见癌症发生的基因变异,并进一步帮助我们开发针对于这些癌症的靶向药物。扩大NCI数据库样本量对于这一工作来说具有巨大的意义。”Staudt说。
Staudt希望Foundation Medicine的数据库共享能够能够激发其他公司的类似举动,这对于癌症基因组研究来说将是一次意义非凡的变革。与此同时,NCI也将继续通过诸如NCI-MATCH等创新临床试验生成自己的新数据。NCI-MATCH项目致力于对大量肿瘤基因组中存在特殊变异的病人进行靶向疗法测试。
“理想状态下,大量的病人测序信息与详细的临床信息都是十分必要的,尤其是关于疾病治疗效果的数据。”美国临床肿瘤学会CEO Clifford Hudis说。“这便意味着临床医生必须改善他们医疗记录的数据输入并通过计算机对这些数据进行充分的处理与分析。”
但是由于病人对隐私保护以及医疗数据共享监管的担忧,将上述多种临床和医疗信息进行综合分析便成为了一个复杂的问题。同时,商业实体很难成为数据共享事业的组成部分。Foundation表示该公司的数据共享行为仅仅是为了加速精准医疗倡议的实施,不带有任何盈利目的。“这个举措或许能使我们短暂地领先于同类竞争者。” Hudis说。
(转化医学网360zhyx.com)
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