Nature子刊丨科学家发现癌基因失控的真凶—增强子插入突变！

近日，MIT Whitehead生物医学研究所科学家发现与原癌基因调控失调密切相关的增强子插入突变，这些突变在癌症的发生中起着至关重要的作用。这项新研究对应的论文发表于最新的Nature Communications杂志，题为“Small genome insertions form enhancers that misregulate oncogenes”。

Whitehead生物医学研究所科学家以前的研究已经表明，即便是发生于某些基因上的单碱基插入也可能改变原有的操纵子结构，进而对相关基因功能产生一定影响。即便如此，尚没有足够的研究能够阐明但这种现象与癌症发生的具体关系。

在这项最新的研究中，研究人员发现这些癌基因调控失控相关单碱基插入突变发生频率相比与他们之前的预想要高得多。该团队在102例不同癌症样品的增强子中发现了数种单个或少数几个核苷酸癌症相关插入突变并预测这些突变基因中可能存在许多与原癌基因调控失调有关的基因。

文章的作者写道：“在研究中，我们使用Chip-seq技术对增强子DNA进行了富集。同时，基于具有多个DNA比对程序的计算方法，我们鉴定了数种与增强子相关的单碱基或少数几个碱基插入突变。在我们分析的102例肿瘤样本基因组中，我们在已知致癌基因附近的增强子DNA序列中观察到了数种插入突变。 在进一步对这些插入突变进行研究之后，我们发现插入突变引起的LMO2癌基因表达活性增强子的形成会使体细胞转变为原发性白血病肿瘤细胞。

令研究人员惊讶的是，研究人员在许多曾被同行所忽视的数据中发现了与癌症密切相关的增强子插入突变。

该研究的主要作者Brian Abraham博士解释说：“只有一小部分基因在特定细胞中具有增强子活性，所以只有缩小搜寻范围才能真正地帮助我们实现大海捞针。”

同时，这项研究提供了一个大型的增强子插入目录，可以帮助相关领域的研究人员去发现在癌症中发挥着重要作用的其他基因。

Whitehead研究所兼MIT生物学教授Richard Young博士指出：“了解癌症发生过程中存在的突变诱导调控错乱的基因及其失调方式对于找到癌症的治疗靶点至关重要。”（转化医学网360zhyx.com）

new method extracts important mutations from enhancer DNA