ICG大会生物创新论坛热点发布——mNGS快速建库方法引关注
导读 | 2020年10月25日,第十五届国际基因组学大会(ICG-15)在武汉开幕,大会以“组学和人类健康”为主题。 |
10月25日,第十五届国际基因组学大会(ICG-15)在武汉开幕。大会以“组学和人类健康”为主题,特别是针对抗击疫情的最新研究成果与知识“缺口”,探讨基因组学研究与技术发展、群体基因组学与精准医学等问题,促进全球范围内组学领域的合作、创新和应用。
翌圣生物在该次论坛上发布的是基于提升mNGS检测时效性的建库试剂盒——Hieff NGS® OnePot PCR-free DNA Library Prep Kit(Cat#12209)。该试剂盒主要的设计点在于:1. 以PCR free形式设计,节省扩增时间,实现1小时高效建库;2. 1ng超低投入建库,满足各种取样方式获得的病原样本;3. 试剂盒使用超洁净分子酶(UCF.ME,Ultra Clean Factory Molecular Enzyme),酶纯度更高,超低背景菌残留,无污染引入;4. 酶切法打断建库,可以直接上自动化建库仪器。
以模式人基因组(NA12878),并以质量比1 ‰的比例掺入蜡状芽孢杆菌基因组(Bacillus,GC 34%)、嗜盐杆菌基因组(Halobacterium,GC 65%)。总量5 ng input进行PCR-free建库,数据如下所示。竞品进口品牌试剂盒对高GC物种的建库有偏好性,如数据中展示的人为掺入的嗜盐杆菌基因组,其所占比例只有0.42‰,远远低于预期的1‰。
另外,值得一提的是翌圣此次分享的超洁净分子酶(UCF.ME,Ultra Clean Factory Molecular Enzyme)。超洁净分子酶即在超洁净工厂中使用超洁净制造工艺生产出的分子酶原料,从源头杜绝微生物DNA污染,即便是历经35-40循环扩增后,非特异性依然毫无扩增,拒绝假阳性,使客户的低生物量样本研究结果明明白白、真真切切。翌圣在Hieff NGS® OnePot PCR-free DNA Library Prep Kit试剂盒中使用的即为超洁净分子酶,不为试剂盒引入任何背景污染,在一定程度上利于mNGS检出率的提升。
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