【BMJ】惠及全人类！罕见病诊断之痛将成历史，全基因组测序是医学发展的必然趋势！

目前的基因检测法未能诊断出来的患者大约有40%，这对患者及其家人，还有他们采用的医疗服务都产生了重大影响。

今天（11月4日）一项名为“Use of whole genome sequencing to determine genetic basis of suspected mitochondrial disorders: cohort study”的新研究发表在《British Medical Journal》（英国医学杂志，BMJ）上，该研究为还没有确诊的家庭带来了希望，除此之外，也支持了英国建立基于全基因组测序（WGS）的国家诊断计划，以更快地诊断更多疾病。

https://www.bmj.com/content/375/bmj-2021-066288

虽然之前小范围、高度选择的定群研究表明，WGS可以诊断线粒体病，但这是第一次在国民医疗服务体系（NHS）中检验WGS的有效性。

该研究由剑桥大学MRC线粒体生物学组、临床神经科学和医学遗传学系的研究人员领导，包括319个疑似患有线粒体病的家庭，这些家庭是通过“10万基因组计划”招募的，该计划旨在将基因检测纳入NHS中，发现新的疾病基因，以及为更多的患者进行基因诊断。

总共有345名参与者（年龄介于0至92岁，中位年龄为25岁）进行了全基因组测序。通过不同的分析，研究人员发现他们可以对98个家庭（31%）做出明确或可能的基因诊断。标准的测试通常无法做出这些诊断。

令人惊讶的是，62.5%的诊断结果实际上并非线粒体病，其中一些有特定的治疗方法。这是因为有许多不同的疾病类似于线粒体病，因此很难分清具体是哪种病。

剑桥大学MRC线粒体生物学组和临床神经科学系的Patrick Chinnery教授说：“我们建议，在进行肌肉活检等创伤性检查之前，应该尽早进行全基因组测序。患者所需要做的就是血液检查，这样能够在全国范围内公平提供。人们不需要长途跋涉多次就诊，而且他们得到诊断的速度会快得多。”

MRC线粒体生物学组、临床神经科学和医学遗传学系的Katherine Schon博士说：“明确的基因诊断可以真正地帮助到患者及其家人，让他们能够获得有关预后、治疗、遗传和生育选择的具体信息，包括植入前遗传学诊断或产前诊断。”

研究人员的诊断结果中，有37.5%是由已知的会导致线粒体病的基因引起的。这些诊断几乎都是特定的参与者家庭所独有的，这反映了这些疾病的遗传多样性。线粒体功能受损往往会影响高能量需求的组织，如大脑、周围神经、眼睛、心脏和周围肌肉。该研究为未来线粒体疾病基因的发现提供了宝贵的新资源。

然而，该团队的大多数诊断（62.5%）是非线粒体疾病，其特征类似于线粒体病。如果只是通过肌肉活检、特定的线粒体基因组合对参与者进行线粒体病研究，那么这些疾病就会被忽略掉。这些参与者患有一系列疾病，包括智力残疾、严重癫痫和代谢障碍，以及心脏和神经系统疾病。

Chinnery说：“这些患者之所以被转诊，是因为疑似患有线粒体病，而常规的诊断测试是专门只针对线粒体疾病的。除非你考虑到这些其他的可能性，否则你不会去诊断这些病的。而全基因组测序就不会有这种影响。”

因此，少数新诊断的参与者已经在接受治疗了。该团队在6名线粒体病患者和9名非线粒体疾病患者中发现了可能可治疗的疾病，但治疗效果还有待确定。

Chinnery说：“英国的诊断服务分散且分布不均，这给罕见疾病患者及其家人带来了重大挑战。通过提供这种基于全基因组方法的国家计划，你可以为每个人提供同等的服务。”

Schon说：“如果我们能够为患有罕见疾病的家庭创建一个全国性平台，我们可以给他们参与临床试验的机会，这样我们就能得到新疗法有效的确切证据。”

该研究指出，有可能诊断的患者数量相对较多，这反映出需要加大对新基因变异的效应的研究，这些变异可能是引发疾病的原因，但目前还不确定。

该研究还主张，应该对所有严重不适的疑似患者及其父母进行快速全基因组测序，以便结果可以帮助指导临床管理。目前在英国，这仅适用于严重不适的儿童。

Genomics England公司的临床主任兼质量总监Ellen Thomas博士说：“我们很高兴看到像这样的重要研究能够得到‘10万基因组计划’参与者的支持。重要的是，从这些结果中可以清楚地看出，他们对庞大且安全的数据集的贡献对于促进基因组研究至关重要，从而产生了这样的见解，然后有可能为NHS及其患者带来价值。我们期待看到这些发现如何支持未来对疑似患有线粒体病的患者的护理。”（转化医学网360zhyx.com）

参考资料：

https://medicalxpress.com/news/2021-11-genome-sequencing-diagnosis-rare-disorders.html

注：本文旨在介绍医学研究进展，不能作为治疗方案参考。如需获得健康指导，请至正规医院就诊。