【Nature子刊】人类遗传学视角看——基因变异如何影响我们的免疫细胞,造成COVID-19严重程度不同
导读 | 近日,发表在《Nature Communications》上的研究,揭示了与COVID-19严重病例相关的基因变异如何影响我们的免疫细胞,这是从人类遗传学角度揭示与疾病相关的新途径的力量。科学界已经确定了许多称之为“严重的COVID-19风险变异”,研究人员结合了COVID-19宿主遗传计划的患者遗传数据和免疫细胞表观基因组数据库,以确定这些风险变体影响的基因和易感细胞类型。发现一种风险变体在非经典单核细胞(先天免疫细胞)中表现出最强的效果,这种风险变异导致该细胞减少了一种名为OAS1的基因的表达。缺乏OAS1表达可能会降低一个通常降解病毒RNA并激活免疫系统抗病毒反应的蛋白质家族的表达,从而阻碍机体的防御。这可能是COVID-19的潜在治疗靶点。 |
新的研究显示了与COVID-19严重病例相关的基因变异如何影响我们的免疫细胞。
这项由拉霍亚免疫研究所(LJI)研究所的科学家们领导,首次深入研究COVID-19严重程度与多种类型的免疫细胞中的基因表达之间的联系。这项研究可以指导新冠病毒疗法的开发,以提高免疫细胞功能。
在他们的研究中,研究人员报告称,一种称为非经典单核细胞的细胞类型中存在一种基因,可能是COVID-19的潜在治疗靶点。
《Nature Communications》的资深作者、LJI教授、医学博士Panduragan Vijayanand说:“这项研究强调了人类遗传学揭示与疾病相关的新途径的力量。”
这项研究于近日发表在《Nature Communications》上,研究人员发表了一篇题为“COVID-19 genetic risk variants are associated with expression of multiple genes in diverse immune cell types”的文章:
科学界已经确定了许多基因差异,称为多态性,他们称之为“严重的COVID-19风险变异”。这些基因变异与基因表达相关,似乎会影响病例的严重程度。然而,科学家们不知道哪些免疫细胞受这些风险变体的影响最大。
在COVID-19疾病基因表观,Vijayanand和他的同事们的研究中,将其与来自COVID-19宿主遗传计划的患者遗传数据和LJI开放获取的免疫细胞表观基因组数据库(LICE)相结合,以确定这些风险变体影响的基因和易感细胞类型。研究团队观察了人体关键保护性和抗病毒细胞的13种亚型:T细胞、B细胞、NK细胞和单核细胞。
“有许多不同的免疫细胞类型,它们都在全局发挥着很小的作用,”研究第一作者、LJI的讲师Benjamin Schmiedel博士说,“我们必须分别观察每种免疫细胞类型,以了解免疫系统如何对新冠病毒作出反应。”
研究人员发现了基因变异与基因的几个重要关联。其中有一种风险变体影响了研究的13种细胞类型中的12种。21号染色体上这种严重的COVID-19-风险变异与细胞上一种称为IFNAR2的受体表达降低有关。该受体是一个信号通路的一部分,该通路向免疫系统发出感染警报。这一新的关联可能有助于解释为什么有些人不能对SARS-CoV-2产生强烈的免疫反应。
与此同时,12号染色体上的一种风险变体在非经典单核细胞中表现出最强的效果,这是一种天然免疫细胞,在体内巡逻,并发送信号分子提醒其他免疫细胞注意威胁。这种风险变异导致非经典单核细胞减少了一种名为OAS1的基因的表达。缺乏OAS1表达可能会降低一个通常降解病毒RNA并激活免疫系统抗病毒反应的蛋白质家族的表达,从而阻碍机体的防御。
Schmiedel说:“非经典单核细胞是一种罕见的、未被充分研究的细胞类型。它们只构成大约2%的免疫细胞。”
Schmiedel希望COVID-19疾病的基因表达在临床上进一步评估,以确定这些基因在COVID-19发病中的作用。他说:“我们能够识别这些遗传机制是向前迈出的一大步。我们可以利用这些信息,结合我们的免疫细胞数据,找到潜在的治疗目标。”
该研究的其他作者,“COVID-19遗传风险变异与多种免疫细胞类型中多个基因的表达相关”,包括Job Rocha、Cristian Gonzalez Colin、Sourya Bhattacharyya、Ariel Madrigal、Christian H.Ottensmeier、Ferhat Ay和Vivek Chandra。(转化医学网360zhyx.com)
参考资料:
https://medicalxpress.com/news/2021-11-covid-case-severity-genetic-differences.html
注:本文旨在介绍医学研究进展,不能作为治疗方案参考。如需获得健康指导,请至正规医院就诊。
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