ctDNA检测揭示晚期胃癌序贯化疗期间的分子进化过程
导读 | 晚期胃癌铂类一线化疗疗效预测生物标志物 |
上海交通大学医学院附属瑞金医院肿瘤科近日在《Journal of Translational Medicine》杂志上发表了检测循环肿瘤DNA(ctDNA)辅助预测晚期胃癌一线含铂化疗疗效的学术论文,题名为“Molecular evolutionary process of advanced gastric cancer during sequential chemotherapy detected by circulating tumor DNA”。
晚期胃癌(AGC)的治疗以多药联合化疗为主,接受一线化疗的AGC患者中位无进展生存期(PFS)仅为6-8个月,针对疾病复发的后续治疗选择有限,整体治疗模式未能带来令人满意的治疗效果。研究发现,在化疗治疗时,肿瘤细胞出现分子层面的进化和改变以适应化疗甚至出现耐药。因此,了解序贯化疗治疗过程中的分子进化可能有助于优化晚期胃癌的后续治疗。
对于晚期患者来说,再次组织活检创伤大、取材困难,胃癌肿瘤内和肿瘤间存在高度异质性,表明基于组织活检的基因组分析可能很难提供具有代表性的肿瘤分子变化的结果,亟需采用创伤性小的技术方法描绘肿瘤分子进化过程,探索疗效预测生物标志物。
上海交通大学医学院附属瑞金医院——张俊教授团队与臻和科技合作,使用臻和NGS panel对30例接受序贯化疗方案治疗的晚期胃癌(AGC)患者的血浆ctDNA进行测序分析,通过动态监测患者ctDNA的基因组变异,发现ctDNA基因组特征的基线和动态变化均与AGC患者一线化疗的疗效有关,CNI、CNV负荷和VAF基线值较高的患者对基于铂的一线方案更敏感,用药后TMB下降越多的患者PFS越长。随着疗效反应,这些分子特征会快速下降,而当一线治疗方案出现疾病进展时,ctDNA中的CNI值和CNV负荷又得到恢复,此时高CNI和高CNV负荷的患者因为新的基因变异耐药而难以从AGC后续的标准化疗方案中获益。在序贯化疗期间可以观察到SNVs和CNVs的波动变化,这些新的SNVs和CNVs在患者中的分布具有高度异质性,可以被富集成多种常见的肿瘤信号通路、耐药通路以及PD-L1表达和PD-1检查点通路,以指导AGC患者在后续治疗方案中的靶向和免疫治疗策略。
与组织活检相比,ctDNA检测具有微创、可多次取材便于动态监测等特点。本研究探索发现ctDNA基因组特征的基线和动态变化可辅助预测AGC患者一线含铂化疗的疗效,为进一步优化晚期胃癌患者的后续治疗方案奠定基础。
原文doi:10.1186/s12967-022-03567-5
注:正文所有图片均来源于Xi et al. Journal of Translational Medicine.(2022) 20:365.
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