【Nature Medicine】科学家绘制结直肠癌肿瘤、免疫和微生物组综合图谱，助力个性化治疗

2023年5月19日，发布于《Nature Medicine》的一项题为“An integrated tumor, immune and microbiome atlas of colon cancer”的论文为更好地了解结肠癌癌症生物学提供了资源，同时有助于科学家发现个性化治疗方法。

https://www.nature.com/articles/s41591-023-02324-5#Abs1

研究背景

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尽管科学家已经对原发性结直肠癌的生物标志物进行了大量研究，但美国和欧洲目前的临床指南仅依赖于肿瘤-淋巴结-转移分期和DNA错配修复（MMR）缺陷或微卫星不稳定性（MSI）的检测，尽管有大量证据表明免疫评分和其他免疫相关参数对结肠癌的预后影响，研究界已经注意到癌症基因组图谱（TCGA）结肠腺癌（COAD）队列中基于基因表达的免疫反应与患者生存之间缺乏关联。TCGA因其基因组数据的丰富性和管理性，代表了组学分析的卓越数据集。

然而，鉴于TCGA的全球范围和时间限制，收集包括生存结果在内的综合临床数据既不是TCGA的主要目标，也不是实际的可能性。近年来，虽然原发性结肠癌的定量特征，包括癌细胞内在、免疫、基质或微生物性质的癌症，已被报道与临床结果显著相关，但关于它们的相互作用以及如何影响患者仍然未知。

研究过程

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缺乏具有广泛随访信息的多组学癌症数据集阻碍了临床结果准确生物标记物的识别。在这项队列研究中，研究人员对348名原发性癌症患者的新鲜冷冻样本进行了全面的基因组分析，包括RNA、全基因组、深T细胞受体和16S细菌rRNA基因在肿瘤和匹配的健康结肠组织上的测序，并辅以肿瘤全基因组测序以进一步确定微生物群特征。1型辅助性T细胞，细胞毒性，基因表达特征，称为免疫排斥常数，捕捉到克隆扩增、肿瘤富集的T细胞克隆的存在，并优于传统的预后分子生物标志物，如一致分子亚型和微卫星不稳定性分类。基因免疫编辑的量化，定义为新抗原数量低于预期，进一步提高了其预后价值。

研究意义

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研究发现了由瘤胃球菌驱动的微生物组特征 溴化物，与有利的结果相关。通过结合微生物组特征和免疫排斥常数，研究开发并验证了一种复合评分（mICRoScore），该评分确定了一组具有良好生存概率的患者。公开的多组学数据集为更好地了解结肠癌癌症生物学提供了资源，有助于发现个性化治疗方法。（转化医学网360zhyx.com）

参考资料：

https://www.nature.com/articles/s41591-023-02324-5#Abs1

注：本文旨在介绍医学研究进展，不能作为治疗方案参考。如需获得健康指导，请至正规医院就诊。