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行业“天花板”——体液蛋白质组检出数目突破8000+！

首页 » 产业 » 快讯 2023-11-15 谱天生物ProteinT 赞(18)

导读

为下一代而创新

体液蛋白组学研究现状

蛋白质是生物体功能的主要承担者，以血浆为代表的体液蛋白质组学为手段探索生物标志物的研究层出不穷。低丰度蛋白是潜在标志物的重要来源，但由于血浆等体液的复杂性及检出手段的限制，低丰度蛋白检出有限，新的临床标志物发现越来越少^[1]，FDA审批的蛋白标志物也逐年下降。因此，提高低丰度蛋白的检出水平，对于体液蛋白组学研究至关重要。

血浆蛋白组学相关研究陆续在CNS主刊登顶

不同技术有其各自的优缺点^[2]，哪种技术才是未来体液蛋白组学的首选呢？质谱法虽适合于血浆等体液生物标志物的发现及机制研究，但由于通量及蛋白检出数目等不足使其应用受限。

以血浆为代表的体液蛋白质组学技术的特点

体液蛋白组学研究革命性技术

为了突破基于质谱法进行体液蛋白组学研究的技术限制，谱天生物联合天津大学，经 6 载潜心研发，数十种纳米材料测试，2 万余例样本验证，成功研发具有自主知识产权的核心产品——下一代纳米低丰度蛋白富集质谱分析技术的液体活检新标志物发现平台n-LAPE/MS^TM，可在 5h 处理样本 96 个，结合最新质谱，单样本30min有效梯度内，蛋白检出高达 8000+，结果稳定，助力体液蛋白组学临床应用。

谱天生物--n-LAPE/MS^TM平台

独家专利纳米材料，低本高效

n-LAPE/MS^TM血浆等体液蛋白质组检测试剂盒利用纳米磁珠对不同丰度蛋白亲和力的差异，偏好性吸附低丰度蛋白，提高质谱对低丰度蛋白的检出能力从而提升蛋白的检出数目。

n-LAPE/MS^TM平台技术原理

蛋白检出数目大幅提升

相对于去除高丰度蛋白的常规方法，n-LAPE/MS^TM检出蛋白数目提高 2-3 倍；30min 有效梯度质谱蛋白检出数目高达8000+，覆盖 80%以上的体液蛋白，极大提升新的高性能标志物的发现概率。

不同前处理方法质谱检测血浆蛋白检出效果对比

深度测量

经过富集，有效检测蛋白含量分布跨10个以上数量级，低丰度蛋白占比由 2.54% 提升到 54.41%，＜1ng/mL 的低丰度蛋白数目由 40+ 提升到 1100+，检出数目显著提升，蛋白检出更加完整^[3]。

检出数据稳定，重现性高

富集试剂盒性能稳定，经质谱检测技术重复蛋白表达CV值中位数＜10%，与质谱仪CV值相当，表明前处理流程稳定，未显著增加质谱检测结果的离散度。稳定检出能够为血浆蛋白组学大队列研究、发现优质标志物打下坚实的基础。

样本前处理自动化

自动化可以切实解决大队列样本对通量的需求，减少人为误差。谱天整合资源开发配套的自动化前处理平台 PT-ASP480 Pro^TM，可实现 5h 完成 96 个样本前处理，简化试验操作，减少人为因素，降低批次效应。

PT-ASP480 pro^TM自动化前处理平台

样本微量且多样化

采用该方法进行血浆蛋白组学研究仅需 10uL 血浆，节约珍贵样本。同时对磁珠进行优化，开发出适应不同样本类型的试剂盒，扩大体液种类，增加体液标志物发现的可能性。

基于HFX质谱平台半小时有效梯度内蛋白检出数目

送样建议

样本质量对于检测结果至关重要，除溶血、反复冻融等常见影响蛋白检出的因素外，常温放置时间对检出结果也影响巨大。因此，以血浆样本为例，依据血浆收样国标^[4]，收样标准如下：

1.使用谱天提供的/EDTA采血管采集新鲜静脉血

2.2h 内， 1300 g 离心 10 min，收集中上层血浆

3.将血浆冻存于-80 ℃（短时间可暂存 -20 ℃），干冰寄送

样本收集方法对检出结果的影响

谱天生物提供基于n-LAPE/MS^TM的高质量体液蛋白组学服务，实现以血浆为代表的体液蛋白质检出数目革命性突破，助力体液蛋白质的临床转化。同时，n-LAPE/MS^TM体液蛋白前处理试剂盒即将全面开售，包含低丰度蛋白富集，蛋白、多肽提取的整套试剂，将蛋白前处理手工操作过程缩短至 3h，敬请期待！

参考文献：

[1] Geyer P E , Holdt L M , Teupser D ,et al.Revisiting biomarker discovery by plasma proteomics[J].Molecular Systems Biology, 2017, 13(9):942.

[2] Suhre K, McCarthy MI, Schwenk JM. Genetics meets proteomics: perspectives for large population-based studies. Nat Rev Genet. 2021 Jan;22(1):19-37

[3] Ma C, Li Y, Li J, Song L, Chen L, Zhao N, Li X, Chen N, Long L, Zhao J, Hou X, Ren L, Yuan X. Comprehensive and deep profiling of the plasma proteome with protein corona on zeolite NaY. J Pharm Anal. 2023 May;13(5):503-513.

[4] GB/T 38576-2020《人类血液样本采集与处理》.

ProteinT / 谱天生物

INNOVATION FOR NEXT GENERATION

谱天生物，聚焦精准医学最前沿多组学领域的国家高新技术企业。天津市临床多组学重点实验室牵头单位，率先开展基因+蛋白+代谢的多组学研究，其中自主知识产权的蛋白质谱液体活检技术水平居于国际前列。核心团队来自耶鲁大学、美国国立卫生研究院、国家蛋白质科学中心等国内外知名科研院所。

公司研发管线涵盖肺癌、食道癌、胃癌、结直肠癌、肝癌、胰腺癌等常见癌种和泛癌种及心脑血管等疾病的早筛早诊、复发监测、伴随诊断等。具有核心知识产权的UmbrellaTM临床分子数据库，临床样本数据10W+，谱天生物致力于医学技术的不断创新、商业化与临床应用，推动医学发展，探寻人类健康的更多可能。