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跨界融合,破解难题:LeviCell技术引领单细胞研究领域的革命性突破

首页 » 产业 » 快讯 2024-07-25 转化医学网 赞(20)
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导读
贝瑞基因引入了LeviCellTM平台,通过简便的步骤,可同时高效的去除死细胞与细胞碎片,以全面优化各项测序控制指标及评估,只为能更好的为终端客户提供真实的高质量、高稳定性测序数据。
单细胞转录组测序(scRNA-seq)是一种功能强大的工具,可帮助研究人员分析罕见和复杂的细胞群,评估某些基因的作用或筛选药物对多种疾病中不同细胞类型的影响等。但如果不能保证数据的质量与可靠,这一强大的工具便会失去作用。而样本质量的多变性,尤其是低细胞活力与高碎片占比,对测序数据的质量与可靠性构成了严重的挑战。
为此,贝瑞基因引入了LeviCellTM平台,通过简便的步骤,可同时高效的去除死细胞与细胞碎片,以全面优化各项测序控制指标及评估,只为能更好的为终端客户提供真实的高质量、高稳定性测序数据。
以某次试验的四个随机样本(样本类型分别为:人输尿管、人终板、人髓核1、人髓核2)为例,让小贝壳er带大家一起感受LeviCellTM加入后对样本质控指标的提升吧:
LeviCellTM处理样本前后的质检结果
如上图示,经LeviCellTM一步简便处理后,可将4个样本(人输尿管、人终板、人髓核1、人髓核2)的细胞活率由83.9%、56.0%、78.0%和89.0%分别提升至96.0%、98.6%、93.4%和94.9%;碎片率由60.0%、37.0%、26.0%和34.0%下降至4.0%、5.7%、9.0%和7.0%;结团率由20.1%、23.0%、34.0%和40.0%降低至26.2%、18.9%、10.1%和25.8%。从而,全面提升样本质量,为下游获取高质量单细胞测序数据打下夯实的基础。
除细胞计数仪的间接检测结果外,利用LeviCellTM内置的显微成像系统,还可直接通过肉眼观测到细胞样本质量提升的整个过程。如下图所示:
下机数据-细胞过滤
高线粒体表达量意味着细胞破损,或者非正常细胞。不同组织不进行富集处理的情况下,其线粒体基因所占的比例均在10%-20%左右,甚至有一些组织的线粒体基因占比要高于20%。而引入LeviCellTM系统之后,结果发现其线粒体占比迅速下降,达到5%及以下,保证了细胞的质量。
下机数据-细胞数及中位基因数统计
人输尿管检测到细胞数10,097,每个细胞的平均基因中位数2,106。人终板检测到细胞数4,119,每个细胞的平均基因中位数3,371。人髓核1检测到细胞数1,633,每个细胞的平均基因中位数4,178。人髓核2检测到细胞数3,837,每个细胞的平均基因中位数4,276。所有样本检测到的细胞数和每个细胞的基因中位数均符合预期。
经过以上抽取的随机样本处理结果,LeviCellTM系统提供了一种单细胞分析前的样本处理方案,只需一步简便的操作,便可有效去除死细胞及碎片,为下游提供值得信赖的高质量实验数据。LeviCellTM的引入,亦是贝瑞基因向客户阐释“成为值得信赖的基因科技公司”愿景所迈出的坚定一步。
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