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iCAGES:助力癌症个体化治疗发展的大数据分析工具
前言: iCAGES--世界上第一个无需生物信息基础即可上手的癌症基因组学分析工具,帮助临床医生快速分析和鉴定癌症患者所携带的驱动基因变异,并选择针对性治疗方案。 来自哥伦比亚大学医学研究中心(Columbia University Medical Center, CUMC)的王凯教授及其团队发布了一个旨在帮助癌症个体化治疗的大数据分析工具,通过鉴定患者的驱动基因变异和快速寻找相...
Nature Methods:超快速的基因组分析工具
近年来,测序市场呈现出百花齐放的美好局面。这使得测序的成本不断下降,但同时也带来了数据分析的难题。经济而又高效地处理全基因组测序的数据,相信是每个人的愿望。如今,一个开源的基因组分析平台也许能满足你的愿望。 这个平台被称为SpeedSeq,由华盛顿大学医学院等机构的研究人员开发。它利用低成本的服务器,在短短的13小时内即可完成50x人类基因组的比对、变异检测...
GOTTCHA:性能卓越的宏基因组分析工具
随着测序技术的发展,宏基因组学逐渐成为了新的热门领域。宏基因组学主要是鉴定环境样本中的所有微生物,理解它们各自所起的作用。这类研究比一般的基因组分析更需要计算机技术的帮助,因为宏基因组学研究的是不同基因组的混合物。 美国Los Alamos国家实验室的科学家们在本周的Nucleic Acids Research...
Nature:基因组解读分析工具在争夺临床市场
<p style="text-align: center;"><a href="http://img.360zhyx.com/uploads/2012/10/a0ce3bcbjw1dy6j94la4qj.jpg"><img class="aligncenter size-full wp-image-5226"...