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专家访谈
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Nature重大发现改写表观遗传理论
传统的观点认为，5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine, 5mC)是哺乳动物中唯一的甲基化形式。发表于3月30日《自然》（Nature）杂志上的一篇新论文将改写这一理论，来自耶鲁大学和其他研究机构的科学家们报告称，他们在小鼠胚胎干细胞(ESCs)中发现了N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenine，N6-mA)。通过这一研究项目，该研究小...
单细胞ATAC-seq——肿瘤表观遗传学研究的利器
人类细胞的DNA约有6英尺长，如何将这些DNA装入直径仅为5微米大小的细胞核中是细胞面临的一个巨大的拓扑学挑战。细胞的解决方案是将DNA进行不同层次的折叠形成可以调控的结构，这其中最重要和最基本的结构就是核小体，进一步再由核小体包装形成染色质[1]。 在每个细胞中组成基因组的60亿个碱基中只有小部分具有生物学活性，能与转录元件结合开始合成RNA，而剩下不活跃的DNA则被包装成高度凝聚的染...
单细胞测序助力中科院刊发《science》 表观遗传研究取得重大突破
图：父亲的后天饮食可通过改变精子RNA影响后代健康 单细胞测序解决了用组织样本测序或样本稀少时无法解决的细胞异质性难题，正日益成为科研热点，尤其是在生殖领域的研究中大放异彩。近日，安诺基因与动物所周琪、段恩奎研究组以及上海生命科学院营养所翟琦巍研究组合作，在高脂饮食诱导的父代肥胖小鼠模型中，发现一类成熟精子中高度富集的小RN...
Science：父亲“原罪”之表观遗传
如果你患有糖尿病、癌症或甚至有心脏问题，或许你应该将其归罪于父亲或甚至祖父的行为或环境。近年来，科学家们已证实甚至在母亲怀上后代之前，父亲的生活经历包括食物、药物、暴露于毒性产物、压力等都可以影响他的孩子、甚至孙子的发育和健康。 然而，尽管科学家们在这一领域已开展了十年的研究工作，对于延续数代传递环境记忆的机制却知之甚少。麦吉尔大学的研究人员及瑞士的合作者们认为，他...
Nature聚焦p53与癌症表观遗传
来自宾夕法尼亚大学Perelman医学院的一项新研究发现，侵袭性癌症生长及一些表观遗传改变与突变p53蛋白有关。在本周的《自然》（Nature）杂志上这一研究小组描述了他们的研究结果以及对于一些难治癌症的意义。 领导这一研究的是多伦多大学细胞与发育生物学、遗传学和生物学系教授Shelley Berger，文章的第一作者是Berg...
80后，德州A&M大学助理教授，追逐表观遗传学的奥秘
――今年35岁的黄云目前就任德州A&M大学健康科学中心的助理教授 当黄云（Yun “Nancy” Huang，音译）还是一名大学生时，她一直希望成为一名医生，但在浙江大学医学院获得学士学位后，她的想法改变了，“我意识到，要治愈疾病，我还需要了解更多疾病的基础生物学知识。” 2005年，黄云来到了美国，在乔治亚州立大学的J...
同济大学最新文章揭示胚胎干细胞中表观遗传调控新机制
2015年7月9日，国际著名学术期刊Genome Research（影响因子：14.6）在线发表了同济大学生命科学与技术学院张勇教授课题组与诺华（中国）生物医学研究有限公司资深研究员寿建勇博士团队题为“SETDB1 modulates PRC2 activity at developmental genes independent of H3K9 tr...
曹雪涛院士综述文章：当免疫遇上表观遗传
近日，曹雪涛（Xuetao Cao）院士和第二军医大学的鲍嫣(Yan Bao)博士，发表了一篇题为“Epigenetic Control of B Cell Development and B-Cell-Related Immune Disorders”的综述文章，探讨了参与B细胞发育和B细胞相关免疫疾病的表观遗传控制机制。 曹雪涛院士现...
PNAS：癌症干细胞无限自我复制更新特性由表观遗传学塑造
癌症干细胞能够通过自我更新和分化，启动并维持癌症的发生和发展。为什么肿瘤之中只有癌症干细胞拥有这样的能力呢？加州大学圣地亚哥分校的研究人员发现，癌症干细胞的这种特性是由表观遗传学决定的。这项研究发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 胶质母细胞瘤是一种高度侵袭性的脑瘤。研究显示，胶质母细胞瘤中的去甲基化酶LSD1，能够关闭维持癌症干细胞特性所需的基因。这不仅...
Cell子刊：干细胞分化的表观遗传学开关
Illinois大学的研究人员发现了一个指导胚胎干细胞成熟为内皮细胞（形成血管的特化细胞）的表观遗传学开关。这项研究发表在六月二十五日的Stem Cell Reports杂志上，可以帮助人们更有效的从干细胞获得内皮细胞，并将其用于组织修复。 高等生物的细胞核负责储存基因组DNA，这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体，形成碟状的核小体结...
厦门大学PNAS表观遗传学新文章
来自厦门大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员证实，热休克蛋白HSP70精氨酸甲基化调控了维甲酸介导的RARβ2基因激活。这项研究发布在6月16日的《美国国家科学院院刊》（PNAS）上。 厦门大学药学院的刘文（Wen Liu）教授和加州大学圣地亚哥分校的Michael G. Rosenfeld教授是这篇论文的共同通讯作者。刘文教授主要从事表观...
清华大学Cell子刊发表表观遗传学新成果
组蛋白修饰和DNA甲基化是重要的表观遗传学修饰，决定着基因组的表观遗传学景观。组蛋白修饰和DNA甲基化能共同起作用调控基因的表达，但人们并不清楚它们在作用机制和功能上的具体关联。 清华大学和洛克菲勒大学的研究团队发现，改变DNA甲基转移酶的组蛋白识别区域会影响表观遗传学景观和小鼠的胚胎干细胞。这一成果发表在六月十一日的Molecular ...
SeqCap Epi甲基化捕获探针组表观遗传学研究方法的革新
DNA甲基化已被证明能在多种生物过程中起到重要作用，包括基因表达、剂量补偿、基因组稳态等等。近年来，其在癌症和许多其他疾病相关领域中也日益受到关注。而目前的研究工具，在进行全基因组或目标区域甲基化研究时，或是价格昂贵而效率有限，或是存在实验偏好且不提供定制方案。 NimbleGen SeqCap Epi基因组甲基化序列富集产品可以实现在单碱基分辨率下进行基因组水平的甲基化分...
何川教授Cell阐析神秘的RNA表观遗传修饰
来自加州大学的研究人员报告称，他们揭示出了重要的RNA表观遗传修饰――N6-甲基腺嘌呤(m6A) 的一个新功能：调控了信使RNA（mRNA）的翻译效率。这一突破性的研究发现发布在6月4日的《细胞》（Cell）杂志上。 领导这一研究的是著名的华人化学生物学家、芝加哥大学的何川（Chuan He）教授。其主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗...
Nature：人类表观基因组图谱顺利完成
十几年以来，科学家们一直在努力绘制人类基因组的图谱，即一张完整展现编码人类生活的DNA序列的图谱，但目前仍然有许多信息需要添加，比如对名为甲基团的化学标志物进行绘图，其影响着基因的表达。 近日，一篇刊登于国际杂志Nature上的研究论文中，来自索尔克研究所的研究人员通过研究绘制出了表观基因组的全面图谱，其中包括来自捐献者超过12个不同的人类器官；甲基化并不会改变个...
李国红研究组：表观遗传因子CENP-A介导着丝粒功能机制
着丝粒是染色质上一段结构与功能高度特化的区域，在细胞分裂期指导动粒的组装，并在纺锤体的牵拉下实现姐妹染色单体的分离。CENP-A是组蛋白H3在着丝粒区的变体，是着丝粒区建立和发挥功能的关键性的表观遗传因子。CENP-A通过招募下游CCAN蛋白家族发挥其功能。CENP-N是CCAN蛋白家族中最重要的成员之一，处在CCAN蛋白家族中...
吉利德并购涉足表观遗传学癌症治疗领域
丹麦时间本月6日，吉利德科技与丹麦私立生物公司EpiTherapeutics ApS宣布签署最终协议，同意吉利德以6500万美元的价格收购EpiTherapeutics，该价格将在调整之后以现金形式支付。 根据协议，吉利德科技将利用EpiTherapeutics首创新药数据库进行表观遗传学领域调控基因小分子抑制剂特别是组...
身高、肤色、智力……也许统统都由一个基因决定
科学家们相信，身高、肤色、智力、疾病风险、是否易胖等一系列性状差异，都是遗传学和环境因素造成的结果。不过他们并不清楚这两类因素是如何共同起作用的。McGill大学的研究团队在三月十一日的Nature Communications杂志上发表文章，揭示了环境（表观遗传学）因子影响性状表达的关键机制。 McGill大学的...
表观遗传学测序技术助力三阴性乳腺癌患者分层
一组澳大利亚的研究员使用甲基化特异性测序技术发现了三阴性乳腺癌中某些甲基化的差异，这些差异可能具有预后价值。 如果患者缺乏雌激素、孕激素受体，并且HER2基因没有过表达或者扩增，则认为乳腺癌是“三阴性”的。具有三阴性乳腺癌（或TNBC）的患者，可以分成两部分，即癌症进展非常迅速或者进展非常缓慢。因此，这些癌症在临床管理上是具有挑战...
NATURE：自身免疫病致病变种的遗传及表观遗传精确图谱
全基因组扫描相关的研究已经识别出了可能导致潜在人类疾病的位点，但是它在所导致的核苷酸变异和机制还并不为人知。我们在此开发了精确制图的算法，用基因型分型数据来识别21种可能由自身免疫疾病导致的致病变种。 我们将这些预判和转录以及顺式调控的元件注释相结合，元件注释来自于包括静息态和兴奋态的CD4+T-细胞、调节性T细胞、CD8+T细胞、B细胞和单核细胞等在内的原发性免疫细胞的RNA和...