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专家访谈
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SeqCap RNA探针组非编码RNA，融合基因都能捕获啦！
转录组测序(RNA-Seq)是了解一个物种或特定细胞在某一功能状态下所有基因表达的直接做法，但是mRNA-Seq往往需要进行rRNA去除或者polyA尾富集实验步骤；目前最热门的lncRNA-Seq则往往需要超过10Gb以上的测序量；全转录组中还有大量未知功能的RNA值得探索和研究。NimbleGen于201...
Cell惊人发现：谁说非编码RNA不编码？
来自德克萨斯大学西南医学中心的Eric Olson和同事们在分析梳理肌肉特异性的长链非编码RNAs(lncRNAs)以了解它们的功能时，发现了一种在骨骼肌中特异性表达的lncRNA。尽管这一RNA以往被归类为是非编码RNA，它的序列中包含的一小段却看上去好像一个编码区域。这一研究发现发布在《细胞》（Cell）杂志上。 微肽 l...
华裔学者Nature发表RNA技术突破
RNA在生物学系统中有着举足轻重的作用，它不仅将DNA的遗传信息传递给蛋白，还调控了各种生物学过程。单链RNA就像一条胶带，可以折叠起来通过碱基互补配对形成二级结构，这样的3D结构决定着RNA的功能。 用于结构分析的传统技术（比如X射线晶体衍射）一般比较麻烦，“而且一次只能用于一个RNA，”斯坦福大学的Howard Chang教授说。 ...
何川教授Cell阐析神秘的RNA表观遗传修饰
来自加州大学的研究人员报告称，他们揭示出了重要的RNA表观遗传修饰――N6-甲基腺嘌呤(m6A) 的一个新功能：调控了信使RNA（mRNA）的翻译效率。这一突破性的研究发现发布在6月4日的《细胞》（Cell）杂志上。 领导这一研究的是著名的华人化学生物学家、芝加哥大学的何川（Chuan He）教授。其主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗...
复旦大学肝癌研究刊登权威杂志
microRNAs(miRNAs)是近年来发现的一类长度为18―24个核苷酸的非编码RNA分子。它主要通过与靶标基因3’UTR的完全或不完全配对，降解靶标基因mRNA或抑制其翻 译，从而参与调控个体发育、细胞凋亡、增殖及分化等生命活动。在人类疾病包括癌症中显示了异常的表达模式和功能异常，有实验证据表明，miRNA 可以担任抑癌基因或者癌基因，与肿瘤的形...
Oncogene：microRNA让乳腺癌化疗效果更好
发生治疗抵抗是系统性癌症治疗的主要缺点。利用传统化疗方法治疗侵袭性三阴性乳腺癌会在很短时间内产生治疗抗性，但其中的机制仍不清楚。近日，来自美国的华人科学家在国际学术期刊oncogene在线发表了一项最新进展，对化疗方法治疗三阴性乳腺癌导致治疗抗性产生的机制进行了深入探讨。 在该项研究中，研究人员发现基因毒性治疗方法能够显著增加三阴性乳腺癌细胞中miR...
PNAS：mRNA诊断早期卵巢癌成为可能
卵巢癌是一种致命的疾病，是出了名的难诊断治疗的癌症。加州大学圣地亚哥医学院以及Moores癌症中心科学家鉴定出了卵巢癌细胞的6个mRNA亚基（信使RNA），使早期卵巢癌的诊断成为可能。更重要的是，在这些mRNA亚基中，有些能编码针对新疗法的特殊蛋白质。这项研究成果5月25日发表在Proceedings of the National Academy of Scienc...
出人意料的非编码RNA调控
为了将六英尺多的DNA塞进细胞核里，细胞将基因组紧紧缠绕在组蛋白核心上形成核小体，并最终将其包装成紧密的染色质。DNA转录的时候需要打开核小体，而胚胎干细胞的染色质重塑复合体esBAF可以做到这一点。它不仅会打开需要转录的DNA，还暴露了促进转录的启动子和增强子。 基因组测序研究最近显示，增强子区域不仅能促进蛋白编码基因的转录，还包含有非...
JournalofNeuroscience:大脑如何调节记忆力和情绪
最新发现的两种不同类型的干细胞，使科学家们向了解清楚大脑是如何调节记忆和情绪的，更迈近了一步。Queensland大学的研究人员们在海马区域，发现了两种类型的干细胞，这个区域时大脑学习和记忆的关键区域。此项研究的主要作者，Dhanisha Jhaveri博士说，Queensland大脑研究所（QBI）的研究人员们首次分离出了这些细胞的纯细胞群。这项发现可能对学习和记忆障碍的治疗...
世界杰出女科学家Cell发布miRNA研究重要成果
来自韩国基础科学研究所(IBS)RNA研究中心和首尔国立大学生物科学学院的一个科学小组，报告称发现了称作为DROSHA-DGCR8复合体的微处理器（Microprocessor）精确确定包含miRNA的初级转录物的切割位点，确保忠实启动microRNA生物合成的分子机制。 发表在5月28日《细胞》（Cell）杂志上的这些研究结果，不仅揭示了人...
RNA:与癌症生物标记相关的新RNAs
来自Pittsburgh大学医学院的研究人员们发现了两类新的RNA，这些RNA和一种蛋白（乳腺癌的预后生物标记物）紧密相关， 而且它们可能在前列腺癌的进展中起到了一定的作用。他们的这些发现发表在6月的科学杂志RNA上。人类Y-盒子结合蛋白1（YB-1）涉及到许多的细胞功能，其表达水平与多种癌症的药物抵抗和患者治疗效果不佳，均有相关性。这个癌症生物标记物与多种RNA紧密相关，而...
别让你的reads再做布朗运动了 —罗氏RNA序列捕获还原真实不同丰度RNA表达！
近年来，遗传变异通过表达水平的改变从而影响癌症、糖尿病、心脏病等复杂疾病的发病日益受到研究者的重视。与之相关的全转录组分析也越来越成为研究热点。 常规的RNA测序（RNA-seq）能检测基因的表达丰度，检测未注释的基因，以及由于剪切而形成的复杂的基因亚型。然而由于转录本的表达丰度宽泛的动态范围，小部分高表达的转录本占据了细胞...
华人女院士Nature子刊发布miRNA研究重要发现
来自麻省理工学院Picower研究所的研究人员发现了，造成脑功能故障，导致精神分裂症发病的一个主要遗传调控因子。相关研究结果发布在5月25日的《自然神经科学》（Nature Neuroscience）杂志上。 领导这一研究的是美国国家医学院院士、麻省理工学院Picower学习与记忆研究所所长、神经科学教授蔡理慧（Li-Huei Tsai）。...
Nat Neurosci：科学家发现精神分裂症疗法的新靶点
近日，一篇发表于国际杂志Nature Neuroscience上的研究论文中，来自麻省理工学院的研究人员通过研究鉴别出了一种主要的遗传调节子，其或可帮助解释引发精神分裂症的错误大脑功能；相关研究或可帮助开发治疗因突触异常而引发的精神分裂症和其它疾病的新型策略提供一定的帮助。 信使RNA（mRNA）可以将DNA的遗传信息翻译成为...
NatureMedicine：microRNA-200家族，决定2型糖尿病中胰岛B细胞存亡
近日瑞士联邦理工学院分子健康科学研究所的Markus Stoffel在Nature Medicine上在线发表了一篇关于2型糖尿病中胰岛B细胞存亡的研究成果。他们发现microRNA-200家族能够通过相关机制促使B细胞凋亡。 microRNA是一类仅约20nt大小的小RNA。通过与其他蛋白结合，microRNA能够介导基因表达中的转录后调节――通过互补结合到目标...
Cell：揭秘激活神经干细胞的信号
来自同济大学医学院、加州大学洛杉矶分校、南昌大学等处的研究人员报告称，他们利用单细胞RNA测序技术，同时运用加权基因共表达网络分析(WGCNA)，揭示出了激活休眠神经干细胞的信号。这一重要的研究结果发布在5月21日的《细胞》（Cell）杂志上。 同济大学医学院的李思光（Siguang Li）教授以及孙毅（Yi Eve Sun）教授是这篇论文的共同工作。李思光教...
Cell Stem Cell：纯化人类活细胞的新技术
多能干细胞之所有非常流行，其中一个原因就是其可以分化分化成为任何类型的细胞以用于医学研究，然而典型的分化步骤往往会导致异源群体的产生，这样一来研究者所需的理想类型的细胞就必须被纯化；正常情况下，同理想细胞表面受体相互作用的抗体往往就可以帮助进行细胞纯化，但在很多情况下纯化的水平并不高，从而就会引发细胞受损；近日刊登在国际杂志Cell Stem Cell上的一篇研究论文中，...
Nature Medicine：掌控细胞生死的miRNA
瑞士苏黎世联邦理工学院(ETH)的研究人员在β细胞中对microRNA开展研究时，发现了一种对压力下细胞死亡起关键作用的microRNA。研究结果发布在5月18日的《自然医学》（Nature Medicine）杂志上。 糖尿病是现代社会的重要祸患之一，糖尿病病例每年都在上升。全球已有超过3.8亿糖尿病患者。国际糖尿病基金会预计到...
第二军医大学Hepatology解析癌症中的非编码RNA
来自第二军医大学、复旦大学和中科院的研究人员发现，一种叫做DANCR的长链非编码RNA通过解除对CTNNB1的抑制增强了肝癌的干性特征。该研究成果刊登在国际权威杂志Hepatology（影响因子11.665）。 第二军医大学的周伟平（Wei-Ping Zhou）教授、孙树汉（Shuhan Sun）教授和复旦大学生物医学研究院的刘雷（Lei ...
从心脏病到癌症—长非编码RNA到底发挥了什么作用？
直到近几年才发现人类基因的70%是非编码RNA，非编码RNA不能翻译为蛋白质，但仍在人体中发挥重要作用。Stefanie Dimmeler是首批发现一个microRNA亚群在血管再生中发挥重要作用的研究人员之一，她最近获得了欧洲研究委员会（ERC）的ERC高级研究员资助，这使她能够对另一群非编码RNA进行相关研究。Stefanie Dimmeler相信这一群非编码RN...