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基因检测助力癌症分型,结肠癌精准医疗实现生存率飞跃
近日,来自德国,瑞士,美国和澳大利亚的科学家研究发现早期结肠癌患者可能会从预测性基因检测中受益更多,针对早期结肠癌患者的预测性基因检测能够帮助他们作出关于化疗的正确决策。 该研究对应文章发表于最新上线的Annals of Oncology杂志,名为"Prognostic value of MACC1 and proficient mismatch repair...
Fluidigm Biomark™ HD SNP分型经典案例
方案一 农业分子标记 本文通过RNA-Seq筛选到大量的病原菌的SNP,而且样本质量并不高。Fluidigm则通过STA(预扩增),验证了88个SNP,将不同区域的病原菌(Moniliophthora roreri)亲缘和地缘关系区分开来。 通过RNA seq 筛选到SNP,然后用Fluidigm对601个SNP进行验证 ...
Fluidigm Biomark™ HD SNP分型解决方案
Fluidigm高通量基因分析系统(Bio-Mark™),是集成了流体通路(Integrated Fluidic Circuit,IFC)技术、实时定量PCR技术及强大的基因分析软件的技术平台。IFC 将微流控通道、阀门和反应仓集成在一张芯片上,通过一个控制系统自动完成多达9216个PCR反应。大大降低了手工加样的步骤并减小了误差。IFC系统比传统的384孔板系统能少用99.5%的maste...
农林领域Affymetrix SNP基因分型解决方案
单核苷酸多态性(SNP,single nucleotide polymorphism)是物种遗传多样性的重要组成之一。遗传多样性为作物、蔬果和禽畜带来了丰富多样的优良性状,但也带来了各种复杂的病害。通过SNP基因芯片技术,人们可以经济高效地了解存在于个体或群体中的单核苷酸多态性,并借助生物信息学和群体遗传学方法,深入探究隐藏在优良性状或病害背后的遗传因素。可以预见,基于高通量的基因分型将帮助...
Ann Oncol:胃癌的分子分型进展
胃癌是全球第三大癌症相关死亡原因,在2013年导致841,000例患者死亡。作为一种异质性疾病,不同国家的胃癌流行病学和组织病理学存在差异。流行病学和临床研究显示,亚洲和西方国家的胃癌发病率和总生存率有显著差异。与中欧和西欧相比,东欧地区年龄校正的胃癌发病率更高。这些地理上的差异可能是由人群特异性基因风险因素和感染原导致的,如幽门螺杆菌(该病菌是胃癌的致病因素)。 &em...
基因分型市场2020年将达到170亿美元
MarketsandMarkets是一家总部设在美国的全球性市场调查和资讯公司,主要从事战略分析市场报告的调研和发布,是全球财富500强企业之一。 近日,美国市场调查与咨询公司MarketsandMarkets发布了一份全球基因分型市场的分析报告,分析并研究了北美、欧洲、亚洲及其他地区的市场主要推动力、限制因素和机遇。 这份题为“基因表达分析市场的技术(...
Illumina推出HLA分型的新模式
人类白细胞抗原(HLA)区域为各种疾病和状况提供了重要的见解。不幸的是,由于此区域的高度多态性,HLA分型存在不小的挑战。近日,Illumina公司宣布推出TruSight HLA,这个方案通过测序11个HLA基因而全面查看HLA区域,带来准确的HLA分型。 TruSight HLA为高通量的HLA分型提供了一个从...
研究人员研发出肾透明细胞癌分型检测方法
新加坡研究人员最近开发出一种基因检测方法,可有效地鉴别肾透明细胞癌(ccRCC)的不同亚型。该检测能评价病人的预后和治疗后的状况,对改善病人治疗有很大潜力。 肾透明细胞癌(ccRCC)是一种最常见的肾癌。由于手术后患者状况不同,肾透明细胞癌患者在切除肿瘤后,预后是很难预测的。 一般肾透明细胞癌...
基于LDR的SNP分型技术在中国的推广故事
LDR技术,和TagMan、Massarray、SNPshot等一样,是目前遗传学研究中常用的SNP分型技术。 该技术是由2001年开始在国内研究推广,而且有个不为人知的故事。利用DNA芯片来进行DNA突变检测是当时的热点,但是往往芯片杂交信号判定比较困难。当时,东华大学肖君华教授、复旦大学卢大儒教授、中科院微系统所...
Affymetrix获得Peptide Groove LLP技术的独家授权
Affymetrix公司10月20日宣布,它已获得Peptide Groove LLP技术的独家授权,从各种分析所产生的基因分型数据中实现人类样本的HLA分型,包括Affymetrix的Axiom基因分型分析。Peptide Groove LLP的合作伙伴开发出HLA*IMP,这是第一种HLA分型统计推断方法,能够高度准确地从SNP基因分型数据中检出4位的HLA类型。传统的...
PNAS:中国科学家发布新型肿瘤分型系统
近日,北京师范大学生命科学学院樊小龙教授研究组与北京天坛医院江涛教授研究组、瑞典Lund大学等研究机构合作,提出了基于分子共表达网络的神经胶质瘤分型系统。相关研究论文刊登在了近期出版的《PNAS》杂志上。 &nbs...
Affymetrix:与英国UK Biobank即将开展50万份样本基因分型工作
英国生物样本库(UK Biobank)与Affymetrix最近完成了一款芯片的开发,它将用于UK Biobank生物样本库中全部50万份样本的基因分型。 http://www.ukbiobank.ac.uk/ 据Affymetrix公司的代表介绍,这款芯片将会成为Affy...
肿瘤个体化医疗第一步: 从分子水平对肿瘤分型
肿瘤几乎从来就没有共享过完全相同的遗传突变,这一事实使得人们为更好地将癌症类型分门别类、以及开发出更有效的靶向性治疗所付诸的科学努力面临困难重重。 鉴定癌症基因分型 在发表于9月15日《自然方法》(Nature Methods)杂志上的这篇新研究论文中,来自加州大学圣地亚哥分校研究人员提出了一种称作为基于网络分层(network-bas...
FDA:批准首个丙型肝炎病毒基因分型诊断试剂
6月20日,FDA今天批准了一个丙型肝炎病毒(HCV)基因检测试剂。雅培的RealTime HCV Genotype II,可以分辨基因型1、 1a、 1b、 2,、3、 4及5.该试剂使用感染病人的血浆或血清样本进行测试,能够帮助医疗专业人员确定适当的治疗方法。由于不同的HCV基因型对现有的药物疗法有不同的治疗响应,因...
Illumina:推出两款基因分型新产品
Illumina公司近日推出了Infinium HumanCore BeadChip系列产品。Infinium HumanCore和Infinium HumanCoreExome BeadChip芯片的内容是与一些顶尖的研究所共同开发,支持经济高效的大规模基因分型和筛选研究。基于Illumina久经考验的Infinium分析,BeadChip芯片能够实现在多个群体中发现标记的基因分型,适合世界各地...