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专家访谈
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【重磅】上海交通大学韩泽广团队单细胞分析揭示新型冠状病毒潜在易感器官
2019年末，正逢中华大地喜迎新年来临之际，但在华中腹地武汉，一场瘟疫正在悄无声息声息的蔓延。受感染的病人初期显示出与2003年席卷中国的非典型肺炎（SARS）相似的症状。在国内外科学家多方努力下，病毒的基因序列被迅速解析。研究显示，这是一种与SARS有高度同源性的新病毒，被命名为2019-nCoV。迄今，由这种冠状病毒确诊感染者超过3万人，重症患者6000余人，死亡700...
单细胞测序技术“遍地开花”，精准医疗“如虎添翼”！
作者：Carrie 单细胞测序技术 基因测序在体外诊断市场中的重要性日益突出。其中，单细胞测序技术自2009年问世，2013年被Nature Methods评为年度技术以来，越来越多地被应用在科研领域。2015年以来，10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技术的出现，彻底降低了单细胞测序的成本门槛。自此，单...
Cell:癌症疫苗又一突破！新型单细胞测序技术成功助力！
黑色素瘤是皮肤肿瘤中恶性程度最高的一种肿瘤，其扩散速度快，并且更偏爱男性。据《A Cancer Journal for Clinicians》2017年发表的癌症统计，黑色素瘤发病率在男性中比在女性中高约60%，死亡率在男性中比在女性中高出一倍以上。最糟糕的是黑色素瘤对放疗不敏感，所以晚期黑色素瘤患者从常规疗法中获益极少。但是免疫疗法打破了这一僵局。 近日，以色...
《Cell》:单细胞测序揭示复杂的肿瘤微环境
（图片来自原文） 研究人员从8名乳腺癌患者的肿瘤样本及配对的正常血液、乳腺和淋巴结样本中获得多个免疫细胞，开展单细胞RNA测序实验。之后，他们利用SEQC流程和一种名为“Biscuit”的计算方法，对这些组织中的免疫细胞进行聚类和鉴定。 这篇论文的通讯作者，纪念斯隆凯特琳癌症中心的Dana Pe'er和Alexa...
两篇《Cell》,五篇《Science》从癌症到发育,从衰老到免疫,单细胞研究显神威
理解任何多细胞生命系统的前提是理解“细胞”，今天单细胞研究已经不再只是纸上谈兵了，全球已经有许多实验室展开了单细胞研究，近期Science，Cell就接连公布了这方面的成果。 免疫细胞是如何衰老的？ 斯坦福大学医学院的研究人员发现衰老的新奥秘：相比于年轻人，老年人的免疫细胞携带更多的染色质修饰。而且这些修饰差异主要来源于环境。 ...
2017单细胞测序重点事件盘点TOP10！
来源： 博奥晶典 近年来，单细胞测序技术获得快速发展，尤其是大通量单细胞转录组测序突破了传统技术的低通量、高成本等局限；而其中基于微液滴技术的大规模单细胞分选平台的出现，更可一次性实现数十万数量级细胞的表达图谱构建，可用于解析各个器官或者组织细胞复杂的基因网络在单个细胞中的运作机制，可了解各个细胞中这些网络有何差异，以及各种细胞群体如何协同工作。 2017年，基于大规...
单细胞测序明确35种神经细胞，明确诱发痴呆因素！
来自加州大学圣地亚哥分校、哈佛医学院和Sanford Burnham Prebys研究中心的研究人员通过分析成年人脑细胞的单个细胞核，明确了35种不同的神经元和神经胶质细胞，并且发现了这些细胞中哪些亚型更易受到不同脑部疾病常见危险因素的影响。 “关于各种脑病的起源问题存在多种理论。我们的研究结果使我们可以进一步缩小和对大脑中具有发展成这些疾病的最大遗传性危险因素的那些细胞类型进行...
【亿康盘点】2017单细胞扩增测序技术的最新进展
细胞是构成生命体的结构和功能的基本单位，不同类型的细胞形态迥异，功能也各不相同。即使是同类细胞间看似相同，相互间也存在着广泛的细胞异质性。传统的群体细胞分析检测能更快速方便的获得大量数据并利于进行有效的统计学分析，但是随着研究的深入，这种基于群体细胞分析所获得的平均性数据，往往忽略了细胞个体间的差异，在很大程度上掩盖了不少稀有、微量样本的作用以及在生命体内广泛存在的随机行为，这些“平均”结果...
2017热词预测之单细胞测序之神来之笔
最近几年，关于单细胞测序的报道日益增多。事实上，单细胞测序是一个新兴的领域。单细胞测序分为单细胞转录组测序和单细胞基因组测序。单细胞转录组测序分为：单细胞DGE、单细胞polyA测序、单细胞lncRNA测序。单细胞基因组测序分为：单细胞外显子组测序和单细胞全基因组重测序。 据了解，单细胞测序萌芽于2010年，2013年是单细胞基因组学突飞猛进的一年。2013年谢晓亮教...
Nature：华裔新锐将单细胞成像和CRISPR结合揭示细胞历史
研究者们已经开发出了一种新的方法来阅读细胞的历史和“家谱”。这种方法的英文缩写为MEMOIR，即Memory by Engineered Mutagenesis with Optical In situ Readout（通过基因工程诱导突变与光学原位读出的记忆）。该技术可以记录动物细胞的生活史，它们与其它细胞的关系、通信模式和塑造了它们的重要事件。相关文章11月21日在线...
单细胞测序，解密小RNA分子的未知功能
随着科研人员对各种遗传疾病和癌症的深入挖掘，单细胞基因组方法捕获的信息变得越来越重要。卡罗林斯卡学院（ Karolinska Institute）的研究人员近日公布了一种新方法，这种方法可以读取个体胚胎干细胞中短的、非编码RNA序列，有助于人们更好地理解基因如何调控不同细胞类型的发展。相关结果以《Single-Cell Sequencing of the Small-RNA ...
Cell：单细胞分析重大突破！利用世界上最小的纳米注射器提取单个活细胞的内含物
生物学家对单个细胞的行为而不是对整个细胞群体的行为越来越感兴趣。在一项新的研究中，来自瑞士联邦理工学院（ETH）的研究人员开发出一种新方法可能引发单细胞分析变革。这一技术利用世界上最小的注射器来对单个细胞的内含物进行取样以便进行分子分析。相关研究结果发表在2016年7月14日那期Cell期刊上，论文标题为“Tunable Single-Cell Extraction for M...
Science：最大规模的人脑单细胞测序计划首获成功，大力推动脑部疾病个体化诊疗
2016年6月24日，一项发表在在线出版的Science杂志上的研究开发了首个大规模高效方法用于人类大脑神经性元不同亚型的鉴定，奠定了“绘制”人脑神经元细胞基因活性方法的基础；同时，可以帮助我们更好的理解人脑正常功能及疾病异常，包括阿尔茨海默氏症、帕金森症、精神分裂症和抑郁症等。此篇论文的通讯作者是来自美国加州大学圣地亚哥分校（UCSD）的张鹍教授。 该研究通...
重磅消息: 国内学者首次在单细胞水平上追踪造血干细胞（HSC）的形成
造血干细胞（HSC）移植（常见的有骨髓移植）是治疗血液系统恶性疾病，包括白血病和一些血液遗传病最有效的途径之一，但骨髓移植对配型的要求以及供体的不足使其在临床应用中受到很大的限制。科学家们一直试图绕过这些限制，比如在体外培养HSC使其增殖，或者将其他类型的细胞（如皮肤细胞）转化成HSC，但都没能获得成功，其中最重要的原因是由于目前人们对HSC发育过程中的调控机制了解得还很不...
单细胞研究指南：测序方法大比拼
多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过，近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们，每一个细胞都是独一无二的。不同类型的细胞激活特定组合的机制，即使是同类型细胞，基因表达也会出现差异。 那么，细胞之间的哪些差异有生物学意义，哪些差异来自于技术偏好呢？要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢？这些问题曾经是单细胞研究（尤其是单细胞...
Cell Stem Cell发表单细胞RNA测序新成果
寨卡病毒是一种新出现的蚊媒病毒。2015年5月，巴西开始出现寨卡病毒感染疫情，这种病毒随后在美洲快速蔓延。世界卫生组织称，越来越多的证据表明寨卡病毒与小头畸形之间存有关联。针对这种疾病，目前尚无特异性治疗办法或者疫苗。最佳预防方式是采取保护措施，避免蚊子叮咬。 三月四日，Johns Hopkins大学的宋红军（Hongjun S...
单细胞研究领域发展趋势
单细胞组学研究正在经历一场突飞猛进的发展，全世界的科学家们几乎每周都会有各种研究上的重大突破，发表的高质量相关论文数量也在大幅上升。全面而科学的统计数据可以使您更轻松地了解当前单细胞基因组学和蛋白质组学的最新研究进展和发展趋势。 C1单细胞自动制备系统 世界上第一个单细胞基因组研究的自动化解决方案,C1™单细胞自动制备系统采用创新的微流体技术快速、准确地实现从捕获到制备单细...
单细胞组学在肿瘤与免疫研究中的重要性
细胞生物学是一门非常复杂的学科，特别是针对如肿瘤、免疫等复杂的生物网络或是多变的微环境，难度更是大幅增加。但即便如此，仍然有大批的科学工作者在全力以赴，希望能找到更好的治疗方法，其中肿瘤免疫治疗因有望实现个体化自身治疗，而受到越来越多的关注。 无论是抗体、DC-CIK以及新兴的CAR-T方法，寻找新的特异性表面抗原都...
单细胞组学在肿瘤与免疫研究中的应用
17世纪，在普鲁士的王宫里，大哲学家莱布尼茨在向众人宣传他的宇宙观时，曾经大胆的提出：“宇宙间没有两个东西是完全相同的”。此语一出，众皆哗然，有人立即去王宫的花园中试图找到两片完全相同的叶子，结果却令在场的所有人大失所望。事实上，不仅仅是叶子，即便微小如构成生物体的每个细胞，其形态和功能都不尽相同。 一花一世界，一叶一菩提 &emsp...
单细胞分析技术在转化医学领域的应用
细胞具有天然的异质性 异质性是细胞的天然特性之一，看似相同的一群细胞，其内部有可能存在本质的差别。这种异质性是由很多因素造成的，除了各细胞所处微环境的差异以外，更多的是细胞内在活动的一种表现；通常，细胞的异质性主要体现在以下几个方面： 在基因水平，基因组本身就存在多态性，各种突变、重组会引起不同细胞间基因组序列上的差异；此...