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GOTTCHA:性能卓越的宏基因组分析工具
随着测序技术的发展,宏基因组学逐渐成为了新的热门领域。宏基因组学主要是鉴定环境样本中的所有微生物,理解它们各自所起的作用。这类研究比一般的基因组分析更需要计算机技术的帮助,因为宏基因组学研究的是不同基因组的混合物。 美国Los Alamos国家实验室的科学家们在本周的Nucleic Acids Research...
Nature子刊:全基因组分析揭开癫痫基因调控网络
来自英国伦敦帝国大学的Enrico Petretto和他的同事们使用了一种基因定位系统方法,在癫痫患者中发现了活跃的基因调控网络。 该研究成果近日发表在了《Nature Communications》上,Petretto和他的团队在颞叶和海马癫痫患者中确定了大量的基因共表达网络,而在这个网络中,转录过程是过表达的。研究人员指出,在...
Congenica获160万美金用于基因分析平台开发
生物信息学公司Congenica今天宣布,它已从剑桥创新资本收到100万英镑(160万美元)的注资用于建立其 Sapientia平台。 Sapientia是一个和可伸缩的模块化数据分析工具,主要用于解释临床基因组序列数据。 Congenica创始人之一Matthew Hurles在一份声明中表示:“Sapientia...
药明康德基因中心携手NextCODE Health在中国开展大规模人群全基因组分析业务
药明康德基因中心宣布与总部位于美国波士顿的NextCODE Health公司合作,利用全球唯一存储超过三十万人全基因组信息的集中式数据库,服务中国科学家。双方将基于药明康德基因中心CLIA认证的测序平台与NextCODE Health生物信息学分析平台,提供快捷、精准的一站式测序与分析服务。双方将致力于在中国开展大规模人群全基因研究及临床诊断,建立中...
NEJM:基因组分析解析一种高危白血病亚型
最近,美国圣裘德儿童研究医院进行的一项多机构研究表明,在患有最常见急性淋巴细胞白血病(ALL)的年轻人当中,有超过四分之一的人为一种预后不良的高危亚型,这种白血病亚型的患者,可能从广泛用于其他成年人更常见白血病治疗的药物获益。相关研究结果发表在最近的《新英格兰医学杂志》(The New England Journal of Medicine)。 &e...
ASCO 2014:“肿瘤基因组分析:未来出路或TMI?”
是否值得投入大量金钱进行癌症靶向治疗是争议最多的内容之一。ASCO 2014将此列为今年年会的主题之一以阐明癌症靶向治疗的价值。与会过程中,研究人员就此进行了讨论,包括靶向治疗的复杂性,基因组分析以期靶向药物可以在第一时间靶向靶点等。 癌症基因组测试已经应用临床。美国MemorialSloan-Kettering Cancer Center的Cha...
中国科技大学:新算法解决复杂肿瘤全基因组分析难题
5月27日,记者从中国科学技术大学获悉,该校李骜研究组在复杂肿瘤基因检测方面取得突破性进展,他们提出的一种新颖生物信息学算法,有效解决了利用新一代测序技术检测复杂肿瘤全基因组异常的国际性难题。成果日前发表在国际权威期刊《生物信息学》上。 基因组异常是多种恶性肿瘤的标志性特征,在肿瘤发病机理、临床诊断和治疗等研究中具有极为重要的作用。但传统肿瘤基因组...
Illumina:将与索尼合作推出基因组分析业务
据日本媒体报道,索尼公司计划与Illumina成立一家合资企业,并推出人类基因组分析业务。 据知情人士透露,这家合资企业将在日本开展基因组信息分析,并向制药公司出售数据库中的信息。索尼公司目前已将医疗领域作为核心业务。 这家合资企业将由索尼的子公司M3与Illumina合作成立。它将利用Illumina的测序仪器对医院及其他医...
Nature:胰腺癌全基因组分析揭示疾病的新型路径
近日,刊登在国际杂志<em>Nature</em>上的一篇研究报告中,来自贝勒医学院的研究者表示,在对胰腺肿瘤的一项最新的基因组分析中,研究者发现了参与这个疾病发病的两条途径,这就为开发新型以及早期的疾病检测手段提供了帮助。 <!--more--> 研究者Fisher表示,如今我们知道了参与胰腺癌发病的每一个基因,这对于我们深入解析该疾病的发病机理带...
JNCI:子宫浆液性癌全基因组分析揭示畸变基因
<a title="子宫浆液性癌和浆液性内皮上皮内癌中最常见的突变基因和Cyclin E表达 " href="http://img.dxycdn.com/cms/upload/userfiles/image/2012/08/26/162369009.jpg" rel="fancy_group"><img src=&quo...
Blood:美完成T细胞淋巴瘤基因组分析
近日,由美国研究者进行的全球首个外周T细胞淋巴瘤(PTCL)全基因组测序分析已完成。该研究团队的成果已于8月1日在线发表于《血液》(<em>Blood</em>)杂志上。 来自明尼苏达州罗切斯特市梅奥医学中心(Mayo Clinic)的研究团队发现,有13种基因组学异常在外周T细胞淋巴瘤中常见。其中有5种异常与p53蛋白相关,未突变的p53蛋白在癌症的抑制中发挥了重要...