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Nucleic Acid Research发布第一个人类自身抗原数据库
自身抗体是一类由B细胞免疫系统分泌,可识别自身蛋白(自身抗原)的抗体分子。它对于维持生物体自身平衡、区分正常与异常增殖细胞以及免疫系统紊乱中均扮演着关键的角色。鉴于其重要的生理功能,发现这些自身抗体的靶标抗原并阐明它们在临床肿瘤和自身免疫病诊断和治疗中的价值则显示出重要的科学意义。例如,2012年美国FDA批准了一组由七个肿瘤自身抗原(p53、NY-ESO-1、 CAGE、...
癌症治疗方法就是海量基因数据
《连线》网站发表文章称,癌症的治疗方法就是数据——海量的基因数据。数据集越庞大,疾病模型和预测工具就会越精确,越强大。但实际上,获取海量数据存在两大难题:规模化和知情同意。 以下是文章主要内容:几年前,埃里克·斯凯德(Eric Schadt)遇到了一位身患癌症的妇女。她患上的是严重的结肠癌,癌细胞很快就转移到了她的肝脏。她来自密西西比州,丈夫死于战争,独自将两个女儿抚养成人。她唯一得到的医疗...
Nature访谈:为什么这家大型制药公司要收集200万基因组数据
宣布收集200万人基因组序列计划五个月后,制药巨头阿斯利康委任哥伦比亚大学遗传学家DavidGoldstein来领导这项任务。 在基因组学项目雄心勃勃的时代,这项长达10年、规模达200万人的基因组计划似乎是合理的步局。制药行业在应用基因组学方面的历史参差不齐。很多公司在世纪之交时投入了巨资,一些分析师将其归咎于不断上升的研发成本和投资回报较差。但业内已了解到,内容丰富的数据库,并不是总...
CFDA发布新规,药品数据监管进入新时期
自2014年FDA和欧盟对印度和中国药企实施严格审计以来,很多中国制药企业被发现在数据监管方面的缺陷。在数据监管方面,由于自动化设备的大规模使用,以及电子数据伪造方面的技术限制,制药企业很容易在这个方面被检查出问题。在2015年7月22日,CFDA启动对国内临床试验核查以来,大部分被判定为作假的临床试验项目,或多好少的涉及数据管理问题。 事实上,对...
Human Longevity发表万人基因组深度测序数据,发现1.5亿个基因变异 ...
J. Craig Venter研究所和基因组学公司HLI(Human Longevity)的研究人员对10500多人进行基因组深度测序(deep sequencing),以便从主要的人类祖先群体中鉴定新的、已知的和罕见的基因变异。研究者使用Illumina的HiSeq X Ten对10545个人进行平均覆盖度为30X~40X的基因组测序。 这项研究...
Clovis公布新型RARP抑制剂药物rucaparib治疗卵巢癌研究数据
Clovis Oncology公司最近公布了旗下开发的用于治疗带有BRCA基因突变型卵巢癌患者的新药rucaparib的研究报告。该药物主要是针对接受过2种或以上的化疗疗法并产生抗药性的患者。此次数据是公司在正在召开的欧洲内科肿瘤学学会(ESMO)上公布的。 然而投资者似乎对这一数据并不买账,公司股价应声下滑了超过四分之一。去年公司公布其另一种治疗...
Nature访谈:为什么这家大型制药公司要收集200万基因组数据
对阿斯利康基因组计划负责人David Goldstein来说,面临的挑战不仅仅是如何获得序列,还包括如何明智地使用这些数据。近日,Nature就相关问题对Goldstein进行了访谈。 宣布收集200万人基因组序列计划五个月后,制药巨头阿斯利康委任哥伦比亚大学遗传学家David Goldstein来领导这项任务。 在基因组...
凯撒医疗集团CIO:我们怎样利用医疗大数据提高医疗服务质量
编者按:本文根据凯撒医疗集团首席医疗信息官在松禾资本精品论坛之“医疗大数据&智慧医疗”论坛上的演讲整理。略有删减。 首先我很荣幸能今天来到这里跟大家交流,我也对刚才场内的互动问答非常感兴趣。原因是我们曾经有完全一样的争论,而且这个争论现在也在世界各个国家发生。 今天我想提到我们对这些问题的一些理解以及解决方案,这些...
大数据时代 医疗机构应如何应对
如今医疗领域形势复杂,各医疗机构面临降低成本、改善患者服务等多重任务。鉴于时间、资源有限,医务工作人员要有能力迅速定位高危患者并优先为其提供治疗,而大数据能助其完成这一点。 预计至2021年,全球大数据市场价值将达350亿美元。浩如烟海的数据也许会让医疗机构望而生畏,但它们对改善患者医疗服务、降低医疗机构成本确有奇效。因而医疗服务提供商及其合作伙伴必须直面复杂大数据的挑战...
贝瑞和康大数据项目初战告捷 建成全球最大妇科肿瘤基因组数据库
基因组大数据的重大意义开始凸显,贝瑞和康与阿里云合作开展的“神州基因组数据云”项目取得的阶段性成果,便已经收效显著。 9月23日,在第十九届全国临床肿瘤学大会暨CSCO学术年会上,北京贝瑞和康生物技术股份有限公司(以下简称“贝瑞和康”)公布了在生物信息分析领域和大数据建设方面做出的重要成果。 贝瑞...
免疫之战:罗氏对上百时美施贵宝,默克公布I/O肺癌PhIII数据
上月,百时美施贵宝(BMY)公布了他们在一线非小细胞肺癌(NSCLC)治疗药物Opdivo(一项被批准的PD-L1抑制剂)的三期Phase III数据的一个错误。紧接着,罗氏基因泰克(RHHBY)公开了他们的二线基础免疫治疗药物Tecentriq第三期阳性非小细胞肺癌(NSCLC)Phase III数据。不久后,默克也公布了其治疗药物Keytruda该指标的数据。 ...
DNA如何存储大数据?
海量数据的存储让科学家们头疼不已,但大自然却以一种意想不到的方式巧妙解决了这个问题。 对Nick Goldman来说,用DNA编码数据的想法一开始只是个玩笑。 2011年2月16日,星期三,Goldman在德国的一家酒店与一些生物信息学家讨论海量的基因组以及其它数据的存储问题。当时,科学家们对传统计算技术的成本和局限性感到沮丧,他们开玩笑地提起了一些科幻...
贝瑞和康公布“神州基因组数据云”项目阶段性成果,填补国际空白
2016年9月8日,北京贝瑞和康生物技术股份有限公司(以下简称“贝瑞和康”)对外公布“神州基因组数据云”项目取得阶段性重要成果,完成世界首个中国人群基因组数据库建设,填补了国际基因数据库中缺少中国人群特有基因组数据信息的空白。 “神州基因组数据云”项目是贝瑞和康与阿里云合作开展,针对中国人群基因组大数据进行前沿探索的重大项目,该项目包括对中国人群基因组的批量计...
2016 数据科学:健康大数据产业论坛 ——大数据驱动下的医疗服务
2016 数据科学:健康大数据产业论坛 ——大数据驱动下的医疗服务 时间: 2016年9月22日-23日 地点:上海远洋宾馆(上海市虹口区东大名路1171号) 大会官网:http://www.bioon.com/z/2016big-data/Index.shtml 本次会议以大数据驱动的医疗服务为着重点,以组学大数据和数据的分析、管理及应用为重点,讨论...
温医大定理学院教授完成国际上首个遗传性骨骼疾病基因数据库
骨骼系统在肌肉附着、人体运动、保护重要器官和保持血管系统稳态方面起到至关重要的作用。任何扰乱骨骼、软骨和关节的发育的基因发生变异都是导致骨骼发育不良,其是出生缺陷患儿中较常见的类型,人群总发病率大约1/1500。遗传性骨骼疾病占骨骼系统疾病的大部分,主要是指具有遗传倾向且有基因确诊的类型。对于严重的骨骼疾病患者来说,存活率不超过一年,大部分均会严重影响患者的生活质量。2010版骨骼疾病分类系...
美国杜克大学生物学家被控篡改数据, 不当获得2亿美金拨款
今天,美东时间9月1日,Science杂志报道,有报料者将杜克大学告上法庭,指控杜克生物学家Erin Potts-Kant篡改实验数据,不当获得高达2亿美金的联邦资助。 如果罪名成立,杜克大学将不得不加倍偿还高达6亿美元的经费,而爆料者最高可得到其中的30%,高达1亿8千万美金,可谓回报丰厚。 杜...
患者隐私怎么处理?基因数据噪音来帮忙
大型基因组数据库对于科学家寻找同疾病相关的遗传变异来说是必不可少的。不过,对于贡献了DNA的人来说,这会带来隐私风险。一项2013年的研究显示,黑客能利用网络上公开可用的信息,从被匿名的基因组数据中辨别出人们的身份。 为解决这些担忧,一个由美国麻省理工学院计算机科学家Bonnie Berger和Sean Simmons研发的系统利用了被称为差分隐私的方法。它通过向用户查询结果中添加少量噪音或...
关于药物临床试验数据核查有关问题处理意见的公告
根据《国务院关于改革药品医疗器械审评审批制度的意见》(国发〔2015〕44号),国家食品药品监督管理总局组织开展药物临床试验数据核查工作发现,部分药品注册申请人、药物临床试验机构、合同研究组织违反《中华人民共和国药品管理法》,在药物临床试验活动中存在数据不真实、不完整和不规范的问题,给药品安全性、有效性带来严重隐患。为进一步规范药物临床试验活动,现就药物临床试验数据核查中有关问题的处理意见公告如下...
2016年国家自然科学基金项目大数据分析
2016年的国家自然科学基金项目评审结果已经出炉。科学网在已有结果的基础上,结合历史数据,对基金在不同空间尺度的分布情况进行全面考察,多角度探索科学基金分布特征。 (一)按项目类别统计2015-2016年项目数量变化趋势 根据国家自然科学基金委8月17日通告显示,共接收项目申请172843项,经初步审查受理169832项,决定资助其中的37409项,约占总数的22...
世界首例人造生命发明人融资3亿美金,誓要建立全球最强基因序列数据库
多年后,文特尔对自己的基因分析结果表明,他携带有大量的、可能导致注意缺陷以及多动障碍的基因片段。 高中毕业后,文特尔应征入伍,智商测试值达142,是同批数千新兵中最高的。他以医疗兵身份受训并前往越南,其间私拆档案拿走了因自己顶撞上级获得的处分文件,但他也曾在训练中因无私帮助受到不公正体罚的黑人同袍而被禁闭。 在越南他竟试图跳海游回美国,幸而游到半道醒悟而返。基因分析显示,文特尔的某个产...