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【Research】上海交大肖华/曹成喜教授联合美国胡深教授关于肺癌口腔微生物组的宏蛋白质组学分析
近日,上海交通大学生命科学技术学院肖华教授与合作者发表研究论文“In-Depth Metaproteomics Analysis of Oral Microbiome for Lung Cancer”在中国科协和美国科学促进会共同创办的综合性科技期刊《Research》。该研究创建了宏蛋白质组学研究新策略,从微生物功能的执行者——蛋白质的水平对微生物组开展了深入探究,实现了口腔微生物组的深度...
【Nature子刊】非编码RNA翻译成蛋白质?中山大学张弩等发现KRAS致癌信号的关键调控因子!
2022年10月14日,中山大学第一附属医院张弩教授、徐建波博士,南京大学生命科学学院闫超教授以及苏州大学姚宏伟教授在Cell Research上联合发表了题为“A novel protein RASON encoded by a lncRNA controls oncogenic RAS signaling in KRAS mutant cancers”的研究论文。该研究表明,由长基因间非...
时隔近七十年!诺贝尔奖得主预言的蛋白质结构终获证实!
最近,该团队终于解决了上述问题,并且证实了持续近70年的β-波纹结构猜想。这项研究发表于《Chemical Science》杂志。 https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2022/sc/d2sc02531k 理论遭质疑 01 蛋白质有各种各样的形状和大小,以在活细胞中发挥...
【CELL DISCOV】西湖大学郭天南等团队结合高通量蛋白质组学和人工智能评估甲状腺结节良恶
9月6日,西湖大学郭天南和李子青团队联合新加坡国立癌症中心研究人员在Cell Discovery 发表了一篇题“Artificial intelligence defines protein-based classification of thyroid nodules”的研究论文。该团队开发了一种人工智能定义的蛋白质生物标志物组别用于诊断甲状腺结节分类。 研究背景 01 先...
【Science子刊】科学家确定了三种蛋白质:可在心脏病发作后维持心脏功能
该研究发表于《Science Translational Medicine》上,它的阳性临床前数据概述了这三种蛋白质的机制,这些蛋白质已被证明可以在小鼠心脏病发作后恢复其心脏功能。 https://www.science.org/doi/10.1126/scitranslmed.abo0699 “搜索引擎”Funsel 01 ...
【Cell子刊】蛋白质RAF1的结构揭示:开发抗肺癌新药的关键步骤
9月1日发表在《Molecular Cell》上的一项新研究的结果为设计RAF1降解剂打开了一扇机会之窗,这些降解剂无论是单独使用还是与KRAS抑制剂联合使用,都可以在KRAS癌基因诱导的肺腺癌患者中产生重要的治疗效果。 https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1097276522007973?v...
【Nature子刊】环状RNA新进展——提高蛋白质产量
发表在《Nature Biotechnology 》杂志上的一份新报告中,Robert Chen和美国加利福尼亚州斯坦福大学的一组跨学科研究人员开发了一种系统的方法,可以快速组装和测试基于合成环状RNA影响蛋白质生产的特征。该团队通过优化精细元素,最大限度地提高了环状RNA的翻译,以实现设计原则——将环状RNA的产量提高了几百倍。与信使RNA(mRNA)水平相比,该结果促进了感兴趣的RNA的...
2nd Westlake Proteomics Webinar | 蛋白质组学和甲状腺疾病
西湖欧米携手西湖大学、西湖实验室、Guomics,iMarker Lab, HPP2.0-PDPM,举办 “Westlake Proteomics Series” 研讨会,系列研讨会由SCIEX中国协办。 继抗生素引发的第一代医学治疗技术革命和影像学、分子医学主导的第二代医学诊断技术革命,如今以蛋白质组学驱动的精准医学为中心的精确诊断与精准治疗统一正在引发第三代...
【Nature】重大飞跃:人工智能预测几乎整个“蛋白质宇宙”!
AlphaFold工具已经确定了大约2亿种蛋白质的结构,这些蛋白质来自地球上几乎所有已知的生物体。该研究发布于《Nature》。 https://www.nature.com/articles/d41586-022-02083-2 蛋白质的3D形状 01 从现在开始,确定几乎所有科学已知的蛋白质的3D形状将像使用搜索...
【Science 子刊】新发现!癌症转移的奥秘——蛋白质折叠背后的机械力量
发表于《Science Advances》上的一篇论文,向我们表明当肿瘤抑制DCL1缺失时,talin在激活细胞扩散方面起着作用。当DCL1与talin结合时,它又似乎阻止了talin激活细胞扩散的行为。该研究由威斯康星大学密尔沃基分校(University of Wisconsin-Milwaukee)的一组研究人员开展。在研究过程中,科学家们研究使用了一种独特的工具——磁性镊子。 ...
【Cell子刊】千万别打扰了蛋白质的“懒散”凝聚——新角度探索疾病机制
近几十年来,由于基因组学的发展,人们知道了许多疾病是由基因突变所引发的。然而,研究者们依然没有完全弄清楚突变是如何导致了疾病的发生——突变究竟改变了细胞内部的什么物质,进而引发了疾病症状?找出这个问题的答案,即疾病机制(disease mechanism),不仅有助于我们加深对疾病的了解,也对疾病的治疗及预防至关重要。比如,若已知某一个突变产生了某种有缺陷的蛋白质,并由该蛋白引发了某种疾病;...
【Cell子刊】新冠病毒25种“内部”蛋白质,或将成为疫苗新靶点
目前,不管是研究人体对SARS-CoV-2病毒的免疫力,还是探索新冠疫苗开发,刺突蛋白及其他病毒表面蛋白的抗体反应一直是研究者所关注的重点。但是,对于免疫力和疾病预后来说,能识别病毒内部蛋白质的抗体,也同等重要。近日,来自匹兹堡大学、佐治亚理工学院和埃默里大学的研究者完成的一项新研究支持了这个说法。 此项研究题为“Antibodies targeting conserved n...
【Science】改善蛋白质功能既能开发新药,又有无限的应用前景!
瑞典卡罗林斯卡医学院和SciLifeLab的研究人员在《Science》上发表的一项研究“Small-molecule activation of OGG1 increases oxidative DNA damage repair by gaining a new function”中描述了他们如何提高蛋白质修复DNA氧化损伤的能力,并创造出一种新的蛋白质功能。他们的创新技术可能会导致针对...
【Science子刊】不伤害健康干细胞!阻断特殊蛋白质以靶向白血病干细胞!
英国每年有超过3000人被诊断为急性髓系白血病(AML),包括100名儿童。确诊后,带有不良遗传标记的人只有15.3%的机会存活超过五年。尽管研究导致人们对该疾病的理解水平提高,但包括AML在内的急性白血病的主流疗法多年来基本保持不变。它们通常涉及化疗和干细胞移植等治疗,可能会产生严重的副作用。 他们发表在《Science Translational Medicine》上的研究“...
【Nature子刊】2002个原发性肿瘤的蛋白质组学研究,确定出14种癌症中的11种泛癌分子亚型!
阿拉巴马大学伯明翰分校癌症数据分析门户网站(UALCAN)于2017年开发并公开使用,作为泛癌组学数据分析的用户友好门户网站,包括转录组学、表观遗传学和蛋白质组学。 癌症是一种复杂的疾病,其起始、进展和转移、向远处器官的扩散,涉及每一类癌症的动态分子变化。除了一些常见的基因组事件外,个体癌症患者还表现出变异。 蛋白质组是在细胞或组织中表达的蛋白质的补充...
【Nature子刊】蛋白质组学带来早期诊断肝脏疾病的新方法!
与目前最先进的临床试验相比,该工具是非侵入性的,如果不优越,也同样准确。该研究“Noninvasive proteomic biomarkers for alcohol-related liver disease”已发表在《Nature Medicine》上。 https://www.nature.com/articles/s41591-022-01850-y ...
【Nature子刊】深度视觉蛋白质组学——展示其首次应用于癌细胞的潜力
近期研究“Deep Visual Proteomics defines single-cell identity and heterogeneity”发表在《Nature Biotechnology》杂志上,证明了深度视觉蛋白质组学技术首次应用于癌细胞的潜力。该研究将肿瘤的视觉特征与深度分析技术相结合,以可视化与周围健康细胞相邻的畸变细胞中的蛋白质特征。这将使研究人员对疾病有前所未有的认识,...