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打破瓶颈!复旦附属中山医院团队:多重免疫分析揭示血清免疫蛋白质组学可预测胃癌化疗预后
免疫力与患者对化疗的反应有关 01 胃癌——其中胃腺癌(GAC)为主要的组织学类型——是全球最常见的恶性肿瘤之一,也是癌症相关死亡的主要原因。胃腺癌患者对术前化疗的反应是异质性的,因此急需寻找能够预测化疗预后的生物标志物来对患者进行分层,以获得最佳治疗。 新出现的证据表明,免疫力与患者对化疗的反应有关:Choi等报道,肿瘤标本中基质程...
SUNY-Buffalo 曲峻教授:3D打印微支架助力的空间蛋白质组学 | WeOmics G20
“Westlake Proteomics Series” (WeOmics)系列研讨会 由西湖大学Guomics实验室,西湖实验室iMarker实验室,CN-HUPO,The Proteomic Navigator of the Human Body (π-HuB) Project共同举办,并由西湖欧米承办,SCIEX协办。 本期研讨会主题:SUNY-Buffalo 曲峻教授:...
【我的2022】青莲百奥总经理李京丽:不辜负每一张原始谱图数据,用“血液低丰度-蛋白质组学”推动生物标志物医学转化
自2019年底,转化医学网推出《我的2019》年度思考分享,栏目邀请了行业专家、从业者,聚焦癌症治疗、基因检测、新药研发、精准医学、临床应用等各领域,为大家呈上了2019年度思考盛宴。2020年,《我的2020》年度思考分享适应时代需求,以视频方式全面呈现,传递大咖观点,倾听一线声音。2021年,《我的2021》年度思考分享汇聚众多行业大咖,讲述年度故事,共话疫情下的产业发展...
【Nature】分子诊断新方法!最近发现的蛋白质具有检测传染病的潜力
研究人员最近发现来自Sulicurvum sp. PC08-66的Cas12a2依赖于流产感染,即休眠或细胞死亡以响应入侵者的存在来实现群体水平的免疫,防止质粒的复制和传播。以实现人群水平的免疫力,可以利用这种机制来创建降解一系列侧支底物的合理突变体。 https://www.nature.com/articles/s41586-022-05560-w#Sec1 生物...
【我的2022】IsoPlexis亚太区总裁偶铁明:单细胞功能蛋白质组学赋能科研进步,探寻单细胞里的超级英雄!
自2019年底,转化医学网推出《我的2019》年度思考分享,栏目邀请了行业专家、从业者,聚焦癌症治疗、基因检测、新药研发、精准医学、临床应用等各领域,为大家呈上了2019年度思考盛宴。2020年,《我的2020》年度思考分享适应时代需求,以视频方式全面呈现,传递大咖观点,倾听一线声音。2021年,《我的2021》年度思考分享汇聚众多行业大咖,讲述年度故事,共话疫情下的产业发展...
【Nature】重磅发现!经典癌基因能够形成蛋白质球体,保卫癌细胞的基因组
MYC基因是较早发现的一组原癌基因,其编码的MYC蛋白是一种多能转录因子,在细胞增殖、代谢、血管生成、凋亡、粘附和分化等方面具有广泛的作用。最近,有研究团队发现MYC基因还具有对癌细胞的重要保卫作用。 2022年11月23日,来自德国维尔茨堡大学的由Martin Eilers和Elmar Wolf领导的研究小组在Nature杂志上发表了一项研究成果。该研究发现,MYC可以形成大量MYC蛋白,...
同济大学田志新:N-糖基化蛋白质组学 | WeOmics-G17
“Westlake Proteomics Series” (WeOmics)系列研讨会 由西湖大学Guomics实验室,西湖实验室iMarker实验室,CN-HUPO,The Proteomic Navigator of the Human Body (π-HuB) Project共同举办,并由西湖欧米承办,SCIEX协办。 本期研讨会主题:N-糖基化蛋白质组学 ...
【Science子刊】蛋白质组学分析——延缓成纤维细胞诱发的耐药性
肿瘤微环境中的细胞对癌症的生长,存活和对治疗的反应具有显着影响。肿瘤环境中与癌症相关的成纤维细胞(CAF)通常与肿瘤进展和对治疗的抵抗力有关,尽管也一些研究表明这些成纤维细胞也可能使癌细胞对治疗敏感。 在《Science Signaling》杂志上发表的一篇新文章中,莫菲特癌症中心的研究人员阐明了这些相互矛盾的研究,并证明癌症相关的成纤维细胞(CAF)可以根据肿瘤细胞的类型和用于...
【Science】超越阿尔法折叠:人工智能设计创造新的蛋白质
在这些新研究中,华盛顿大学医学院的生物学家表示,利用机器学习,人们可以比以往更精准、更快速地创造蛋白质分子。研究者希望这一进展将能促进相关新疫苗、新治疗策略、碳捕获工具和可持续生物材料的研发。 该研究资深作者、华盛顿大学医学院生物化学教授David Baker表示:“蛋白质是生物学的基础。然而目前,我们在每种植物、动物和微生物中发现的所有蛋白质,远远未到其可能性...
【Cell】长达70年历史的蛋白质折叠理论遭遇挑战!
到目前为止,科学家们认为TRiC和类似的细胞机器(又被称为伴侣蛋白)仅被动地提供了一个有利于折叠的环境,而它们本身并不直接参与蛋白质折叠。研究人员估计,我们细胞内有高达10%的蛋白质会从这些小腔室中得到实际的帮助,折叠成最终的活跃形状。 该研究的主要作者、斯坦福大学教授Judith Frydman表示,许多依靠TRiC微型细胞机器来进行折叠的蛋白质与人类疾病密切...
【CANCER RES】为什么T细胞无法攻击肿瘤了?新研究发现靶向关键蛋白质可改善免疫疗法
近日,北卡罗来纳大学莱因伯格综合癌症中心免疫治疗组的 Jessica Thaxton博士团队在Cancer Research期刊上发表了一项题为“Stress-Mediated Attenuation of Translation Undermines T-cell Activity in Cancer”的研究,详细描述了T细胞的应激反应如何使它们无法阻断肿瘤生长。 Thaxton的研究小组...
【Science子刊】神奇的脂质代谢!芝加哥大学研究发现一种新的可降低患肝癌的风险的蛋白质
近日,芝加哥大学研究人员发表在《Science Advances》杂志上的一项新研究“Lipid droplet turnover at the lysosome inhibits growth of hepatocellular carcinoma in a BNIP3-dependent manner”表明,在小鼠模型中,BNIP3 蛋白的缺失导致线粒体和脂滴的周转减少,从而导...
【Nature】诺奖技术新贡献!研究人员揭示了驱动肠癌发展的关键蛋白质结构
近日,研究人员使用获得诺贝尔奖的显微镜技术,揭示了tankyrase蛋白如何通过自组装成3D链状结构来打开和关闭。该研究论文“Structural basis of tankyrase activation by polymerization”发表在《Nature》杂志上,通过对tankyrase蛋白的关键结构见解,表明了其在帮助驱动肠癌方面的重要作用。 https...
EAD电子活化解离技术及糖蛋白质组学研究进展
糖基化是一种广泛存在的蛋白质翻译后修饰,糖蛋白质在许多重要的生物学过程中发挥重要的作用,包括细胞的信号传导、宿主与病原体的相互作用,以及免疫应答和疾病发生等。糖蛋白质组学(glycoproteomics)是通过大规模分离、富集和鉴定糖蛋白,来分析特定生物样本中聚糖和糖基化蛋白的完整组库。糖蛋白质组学已逐渐成熟,这要归功于仪器、实验方法和计算搜索算法的进步。[1] 电子活化解离(...
【CANCER RES】为什么T细胞无法攻击肿瘤了?新研究发现靶向关键蛋白质可改善免疫疗法
近日,北卡罗来纳大学莱因伯格综合癌症中心免疫治疗组的 Jessica Thaxton博士团队在Cancer Research期刊上发表了一项题为“Stress-Mediated Attenuation of Translation Undermines T-cell Activity in Cancer”的研究,详细描述了T细胞的应激反应如何使它们无法阻断肿瘤生长。 Thaxton的研究小组...
Sander Piersma:从磷酸化蛋白质组学数据中推断激酶活性的工具及应用 | WeOmics-G13
“Westlake Proteomics Series (WeOmics)” 系列研讨会 由西湖大学Guomics实验室,西湖实验室iMarker实验室,The Proteomic Navigator of the Human Body (π-HuB) Project共同举办,并由西湖欧米承办,SCIEX协办。 本期研讨会主题:磷酸化蛋白质组学数据和激酶活性 ...
AlphaFold的新对手?快约60倍的Meta 可AI预测6亿种蛋白质的全新形状!
该团队使用“大型语言模型”生成了预测工具——人工智能AI,这是可以从几个字母或单词预测文本的工具的基础。 通常,语言模型是在大量文本上进行训练的。为了将它们应用于蛋白质,Rives 和他的同事将它们输入已知蛋白质的序列,这些蛋白质可以由 20 种不同氨基酸组成的链表达,每一种都用一个字母表示。然后,该网络学会了“自动完成”蛋白质,其中一部分氨基酸被遮蔽。 蛋白质“自动...