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【Cell】里程碑!复旦大学杨禹丞合作绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱
复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队,首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划,“DNA元件百科全书计划”(Encyclopedia of DNA Elements)从2003年启动至今整整20周年;本研究作为“DNA元件百科全书计划”的子项目,历经上百位合作者逾6年的艰辛努力得以顺利完成,为研究人员在个性...
【Science子刊】预测铂类药物的耐药机制!——三阴性乳腺癌的基因组/表观基因组学改变
在三阴性乳腺癌(TNBC)和卵巢癌(OvCa)中很常见,然而,改变基因组和表观基因组性 BRCA 因此,研究者研究了BRCA缺失或基因改变的TNBC和OvCa患者与BRCA启动子甲基化患者对铂治研究发布于《Science Translational Medicine》。...
【Science】深入认识基因组和表观基因组,将有助于预防、诊断和治疗癌症
2020年,大约有1000万人因为癌症丧失了他们宝贵的生命。这种致命疾病是由我们DNA的种种变化引起的。 科学家首次公布人类基因组序列,距今已经20年了。继这一重大成就之后又有了重大的技术进步屡屡出现,让我们能够更便捷并极其详细地读取DNA的层层信息,包括从细胞癌变时DNA发生的第一次变化,到晚期肿瘤的复杂微环境。 现在,为了加快对癌症...
【Nature】生命科学“登月计划”再进一步!MIT绘制迄今最全面人类表观基因组综合图谱!
然而很明显,越来越多的证据表明,那些最初被认为是“垃圾DNA”的非编码DNA片段在发育和基因调控中起着至关重要的作用。 近日,在一项新研究中,麻省理工学院的一组研究人员公布了这种非编码DNA的最全面的图谱,并于2021年2月3日发表于国际顶级期刊Nature杂志。 这项题为“Regulatory genomic circuitry of human di...
【Cell子刊】表观基因组可作一种治疗策略来预防视力丧失
研究阐明了与杆状感光细胞、视网膜光敏细胞衰老有关的分子变化和生物学途径。未来的研究可以进一步研究如何预防或延缓衰老过程中的视力丧失,并有望降低相关神经退行性风险。 每个生物体都有一个基因组,一个控制人体所有细胞和组织功能的基因库。这些基因的表达(当存储在DNA中的信息转换成用于制造蛋白质或其他分子的指令时)由有机体的表观基因组进行调...
第三届国际表观基因组学研讨会在上海金山隆重开幕!
会议邀请了 25 名国内外表观基因组学研究的重量级嘉宾,近 300 名研究者参加本次盛会,共同探讨交流表观遗传学领域的最新研究进展。大会开幕式由于文强教授主持。 上海市公共卫生临床中心党委书记卢洪洲教授 上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心党委书记卢洪洲教授代表主办方——上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心对来自世界各地的参会者表示热...
第三届国际表观基因组学研讨会嘉宾报告题目公布
随着人类基因组计划的完成,表观遗传学已成为后基因组时代生命科学研究的前沿。为促进表观遗传学领域的国际学术交流与合作,推动基础研究和转化医学研究进程,由上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心、复旦大学生物医学研究院、上海人类学学会主办的第三届国际表观基因组学研讨会 (The 3rd International Epigenomics Conference) 将于 2019 年 1...
揭秘肝再生新方法,解除表观基因组修饰的刹车装置!
近日,纽约大学的研究人员发现了一种肝脏再生的新方法。通过敲除表观基因组中抑制“跳跃基因”(即转座子)的一个元件(Uhrf1),可以重新分配表观遗传标记,解除肝再生的抑制,从而加快肝脏再生的过程。这项研究对于开发具有促进肝再生功能的药物具有重要的意义。 转座子能够激活基因组中的一些基因,该研究新发现了一种表观遗传补偿机制,这种调节机制能够保护基因组被转座...
表观基因组对糖尿病发展作用揭示
英国《自然·通讯》期刊近日发表的一篇表观遗传学论文,揭示了表观基因组对疾病发展的作用,探索了环境对Ⅰ型糖尿病发展产生影响的线索。科学家在Ⅰ型糖尿病病人中发现了免疫基因的表观遗传变化,而这些机制对人类来说仍是未解的谜题。 过去十年来,Ⅰ型糖尿病的发病率出现了显著上升,这被认为是环境因素(比如感染和饮食)在疾病发展中扮演了重要角色。其实到目前为止,医学界都还无法控制人体内...
长痤疮就哭?三阴性乳腺癌患者晕倒在地铁站——表观基因组靶向治疗带来新希望
就在上个月末,湖南有位姑娘因长痤疮影响了美丽容颜而在地铁站伤心大哭,围观群众叫来了警察叔叔对其安抚才使姑娘停止哭泣。看完新闻的小编愁眉苦脸地轻抚自己坑坑洼洼的脸,不由得想对警察叔叔说:“对不起!我们月球表面少女给您添麻烦了!”但是小编也同样清楚,作为女性,何止会受到痤疮的威胁,还有很多远比痤疮更可怕的疾病,比如乳腺癌。可是,您听说过三阴性乳腺癌吗?表观遗传学又跟它有什么关系呢?...
复旦、中科院、遗传学会“基因组和表观基因组大数据分析” 2016年上海市研究生暑期学校盛大开幕
2016年6月19 日上午,2016上海研究生暑假学校如期在复旦大学邯郸校区举行开幕式。复旦生科院教授、上海遗传学会秘书长王久存教授主持;复旦生科院教授、复旦研究生院院长钟扬教授致辞,并发表专题讲座;复旦生科院副院长、上海遗传学会理事长卢大儒教授致辞。会上百号学员济济一堂,正式开启“基因组和表观基因组大数据分析” 的学习和交流之旅。 随着基因分型、新...
Nature医学:表观基因组决定你胖得健不健康
肥胖容易带来糖尿病,但并不是所有胖子都会生病。不少肥胖的人拥有正常的代谢能力,“健康”的胖子发展成糖尿病的机率并不高。瑞典卡罗林斯卡学院(Karolinska Institutet)和法国国家健康和医学研究院(INSERM)的研究人员在Nature Medicine杂志上发表文章指出,与肥胖有关的糖尿病是表观遗传学改变造成的。 ...
Nature Methods:突破性单细胞表观基因组与转录组分析新技术
由英国及比利时的研究人员开发出的一种新方法,使得在单细胞中同时研究表观基因组及转录组成为可能。发布在《自然方法》(Nature Methods)上的实验方案,可帮助科学家们精确描绘出DNA甲基化改变与基因表达之间的关系。 近年来单细胞测序技术发展迅速,被广泛用于研究细胞间的基因表达谱(转录组)差异。近期的一些单细胞实验方案也使得...
Nature Methods:只需100个细胞的表观基因组分析
近二十年来,科学家逐渐认识到DNA中的遗传密码只代表了生命蓝图中的一部分信息,还有许多其他因素影响着基因的启动和关闭,表观遗传学修饰就是其中之一。表观遗传学修饰能在不改变DNA序列的情况下控制着基因的表达,是一种重要的调控机制。 近年来,表观遗传学已经成为了干细胞分化、炎症、癌症等多个领域的研究热点,但它在临床上的潜力还未得到充分挖掘。表...
Cell:首次揭示表观基因组的全面重编程
由剑桥大学领导的一个研究小组第一次描绘出了在生成精子和卵子之前,人类的早期原始生殖细胞中表观基因组(epigenome)被全面擦除的机制。这项发表在6月4日《细胞》(Cell)杂志上的研究,还揭示出我们DNA中的一些区域,包括与肥胖和精神分裂症等疾病相关的区域抵制了完全重编程。 尽管我们的遗传信息――“生命的密码”是写在我们的DNA中,我们...
Nature:人类表观基因组图谱顺利完成
十几年以来,科学家们一直在努力绘制人类基因组的图谱,即一张完整展现编码人类生活的DNA序列的图谱,但目前仍然有许多信息需要添加,比如对名为甲基团的化学标志物进行绘图,其影响着基因的表达。 近日,一篇刊登于国际杂志Nature上的研究论文中,来自索尔克研究所的研究人员通过研究绘制出了表观基因组的全面图谱,其中包括来自捐献者超过12个不同的人类器官;甲基化并不会改变个...
Nature重大成果:最全面的人类器官表观基因组图谱
多年来,科学家们成功获得了人类基因组的工作图――编码人类生命的完整DNA序列图像。而现在他们仍然在往这一图集添加新页面――散布在DNA链上,影响了基因抑制的化学标记物――甲基的图谱。 来自Salk研究所的科学家们报告称,他们构建出了来自个体捐赠者(包括女人、男人和孩子)十多种不同人类器官最全面的表观基因组图谱。尽管甲基化不会改变...
Nature:基于CRISPR的表观基因组编辑
目前关于表观遗传标记(如组蛋白甲基化和乙酰化)调控功能的研究结论,很大程度上都是基于基因表达有关的统计数据,要想了解单个标记在基因调控中所扮演的角色并不容易。 Nature出版社旗下的两份期刊近期公布了两项研究报告,利用目前热门的CRISPR系统,解析了特殊位点上的组蛋白目标修饰。其中一个研究组用融合了组蛋白去甲基化酶的Cas9系统(dCas9),失活增强子进行研...
Cell:开发出比较表观基因组学方法来研究基因组调节功能
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