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专家访谈
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【Science】约翰霍普金斯大学联合耶鲁:表观遗传学结合数学以诊断及预测癌症
近日,约翰霍普金斯大学和耶鲁大学的研究者在国际顶尖学术期刊《Science》上发表了研究论文。这篇综述论文指出,通过数学建模可以将癌症的表型可塑性与驱动癌症的表观遗传变化联系起来。这种新的表观遗传定量方法可以更好地定义和测量基因功能中的表观遗传学缺陷及其与癌症遗传景观的相互作用,从而更好、更早地诊断癌症并预测其行为。 https://www.science.org/...
首次发现,上海十院找到甲癌精准表观遗传学分子标志物
甲状腺结节很常见,甲状腺超声检查的患病率约为 70%,其中约 5% 是恶性的。准确评估以区分恶性甲状腺结节和良性甲状腺结节对于其适当的临床管理至关重要。超声影像学联合细针穿刺 (FNA) 活检是甲状腺结节现有的诊断主要方法。 近日,上海市第十人民医院甲状腺中心/上海市甲状腺疾病研究中心在全球范围内首次发现甲癌精准表观遗传学分子标志物。该项研究应用定量显色印迹基因原位...
表观遗传学研究利器——ATAC-seq技术,高效探索染色质开放区
1. ATAC-seq可以得到实验时点全基因组染色质开放信息,RNA-seq可以得到同一时点的基因表达信息,将两个组学数据联合分析,可以获得该时点下影响基因表达的的上游调控区域,寻找到影响基因表达的潜在TF(Transcription Factor)。 2. 通过对比不同细胞或者相同细胞在不同阶段的组学数据,可以对比出基因表达调控的差异。 3. 通过CUT&Tag...
【Nature】免疫系统的保护作用竟然还能遗传给后代?科学家通过实验告诉你有关表观遗传学的新发现!
如果这一代感染了某种疾病,这是否也会影响着后代的免疫能力?荷兰拉德堡德大学与德国波恩大学、德国萨尔兰大学、瑞士洛桑大学和希腊雅典大学的研究人员对这一问题展开了深入的研究与合作探讨,并且进行了实验与思考。之前科学家在这方面的研究之中就对小鼠做了实验,在之前的他们那些实验中,小鼠父亲因为克服了真菌的感染或受到真菌化合物的刺激,自身的免疫能力增强了许多,随后,他们体内的这种保护作用提高了很多的免疫...
Proteintech战略投资表观遗传学专家Active Motif,完善“人类抗体组计划”!
北京时间2021年9月8日,全球著名抗体生产商 Proteintech Group正式宣布:对表观遗传学专家Active Motif 公司进行战略投资!Active Motif 指出,将利用这笔资金扩充其研发创新引擎以及商业布局。 早在2020年,Proteintech 与 Active Motif 就已达成战略合作,通过 Proteintech...
靶向治疗肺癌,参与DNA甲基化,从表观遗传学水平抑制肿瘤基因表达
非小细胞肺癌是世界范围内导致癌症致死的主要杀手,应用拓扑异构酶II抑制剂依托泊苷只对一小部分患有非小细胞肺癌的病人具有良好疗效,因此,改变药物作用靶点愈来愈成为药物治疗该疾病的重中之重。之前有研究表明,EZH2能与PRC2共同作用对H3K27进行三甲基化,从而起到基因沉默的作用,因此甲基转移酶EZH2成为一个非常具有应用前景的潜在作用靶点。[1] 昨日...
《转》访复旦大学于文强教授:从表观遗传学研究中谈科研创新与自信!
《转》访是转化医学网的品牌专访栏目,是业内专家、大佬、知名企业智慧交流碰撞的平台,也是促进行业健康发展的重要力量,《转》访致力于打造转化医学领域最知名的专家访谈栏目。 复旦生物医学研究院表观遗传学中心PI于文强教授,多年来一直在国际著名大学的表观遗传实验室与该领域的顶尖级科学家共同从事表观遗传学研究,取得了许多杰出的研究成果...
表观遗传学:癌细胞耐药性,有我一份力!
表观遗传学同药物之间作用 近日,美国范德比尔特大学科学家发现了一种肿瘤对西妥昔单抗(用于治疗晚期结直肠癌)产生抗性的非遗传因素。 该研究对应文章发表于最新上线的Nature Medicine杂志上,名为“lncRNA MIR100HG-Derived miR-100 and ...
表观遗传学与抗癌药物的抗性相关
近日,美国范德比尔特大学科学家发现了一种肿瘤对西妥昔单抗产生抗性的非遗传因素,西妥昔单抗常用于治疗晚期结肠直肠癌。 该研究对应文章则发表于最新上线的Nature Medicine杂志,名为“lncRNA MIR100HG-Derived miR-100 and miR-125b Mediate Cetuximab Resistance via Wnt/β-Catenin Signaling。...
逆转吸毒成瘾?从表观遗传学着手或可实现
近日,美国南卡罗来纳医科大学(MUSC)科学家研究发现早期吸毒者大脑中表观遗传因子 经历着急剧的变化,这类表观遗传学的变化则在极大程度上加剧了吸毒成瘾这一难以逆转过程的发生。该研究对应文章则发表于最新上线的Neuron杂志,名为HDAC5 and Its Target Gene, Npas4, Function in the Nucleus Accumbens to Regul...
从表观遗传学入手,逆转“衰老时钟”!
人类(和动物)的老化是一种必然过程,每种物种的寿命或多或少地被预先确定。 最近的一项研究表明,一种表观遗传修饰DNA甲基化可以显示与老化相关的变化。DNA甲基化是一种表观遗传修饰,其可以改变DNA的表达方式而不改变DNA的基本序列。 这些修饰是非常准确的,依照这些修饰可以从身体中的任何组织或液体预测+/- 3.6年人类老化程度(Horvath S. 2013)。 这是迄今为止预测老化的...
甲基化与lncRNA: 表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么?circRNA,lncRNA,外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外,现在很多小伙伴们开始了新的玩法,通过多平台联用,将不同层面的东西结合起来,比如,表观遗传与非编码RNA的结合,就是一个很好的例证。 研究背景 肺癌是一种常见的恶性肿瘤,特别在中国,由于环境的污染,肺癌的发生率也在持续升高。非小细胞肺癌(NSCLC)是肺癌中最常见的...
清华Nature子刊发表表观遗传学新成果
高等生物的基因组DNA围绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。通过“读取”模块识别组蛋白共价修饰是表观遗传学调控的一个主要机制。 最近人们发现了多种组蛋白赖氨酸酰化,比如巴豆酰化(Kcr)、丁酰化(Kbu)和丙酰化(Kpr),它们大大拓展了组蛋白赖氨酸修饰的编码能力。清华大学医学院的研究人员发现,双PHD锌指(DP...
徐国良院士Nature发表表观遗传学新成果
表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的活性,而且这种修饰会受到环境因素的影响。DNA甲基转移酶(DNMT)介导的胞嘧啶甲基化是哺乳动物基因组最常见的一种表观遗传学修饰,在基因组印记、X染色体失活等重要过程中起到了关键性作用。TET家族的双加氧酶能够逐步氧化5-甲基胞嘧啶,由此实现去甲基化。 迄今为止,人们还不完全清楚胞嘧啶甲基化和去...
第五届国际肿瘤表观遗传学大会
由中国人民解放军总医院主办的第五届国际肿瘤表观遗传学研讨会将于2016年10月20-24日在美丽的首都——北京隆重举行。 本届大会的核心内容是肿瘤表观遗传学的最新进展,涵盖以表观遗传学为基础的精准治疗、长链非编码RNA临床应用等前沿研究成果。主要内容包括DNA甲基化、组蛋白修饰、基因组印迹、发育表观遗传学、非编码RNAs、DNA损伤修复的表观遗传机制、表观遗传记忆机制、...
表观遗传学市场总览:定性和定量分析
本文探讨了目前的国际表观遗传学市场格局,最近几年表观遗传学领域发展势头强劲,推动了多种不同疾病的研究以及疗法开发。 图1,表观遗传学文献增长;图2,表观遗传学文献增长地理分布 表观遗传学知识基础分析 为了准确高效地对这一细致且多样的学科进行分...
Nature重大发现改写表观遗传理论
传统的观点认为,5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine, 5mC)是哺乳动物中唯一的甲基化形式。发表于3月30日《自然》(Nature)杂志上的一篇新论文将改写这一理论,来自耶鲁大学和其他研究机构的科学家们报告称,他们在小鼠胚胎干细胞(ESCs)中发现了N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenine,N6-mA)。通过这一研究项目,该研究小...
单细胞ATAC-seq——肿瘤表观遗传学研究的利器
人类细胞的DNA约有6英尺长,如何将这些DNA装入直径仅为5微米大小的细胞核中是细胞面临的一个巨大的拓扑学挑战。细胞的解决方案是将DNA进行不同层次的折叠形成可以调控的结构,这其中最重要和最基本的结构就是核小体,进一步再由核小体包装形成染色质[1]。 在每个细胞中组成基因组的60亿个碱基中只有小部分具有生物学活性,能与转录元件结合开始合成RNA,而剩下不活跃的DNA则被包装成高度凝聚的染...
80后,德州A&M大学助理教授,追逐表观遗传学的奥秘
――今年35岁的黄云目前就任德州A&M大学健康科学中心的助理教授 当黄云(Yun “Nancy” Huang,音译)还是一名大学生时,她一直希望成为一名医生,但在浙江大学医学院获得学士学位后,她的想法改变了,“我意识到,要治愈疾病,我还需要了解更多疾病的基础生物学知识。” 2005年,黄云来到了美国,在乔治亚州立大学的J...
PNAS:癌症干细胞无限自我复制更新特性由表观遗传学塑造
癌症干细胞能够通过自我更新和分化,启动并维持癌症的发生和发展。为什么肿瘤之中只有癌症干细胞拥有这样的能力呢?加州大学圣地亚哥分校的研究人员发现,癌症干细胞的这种特性是由表观遗传学决定的。这项研究发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 胶质母细胞瘤是一种高度侵袭性的脑瘤。研究显示,胶质母细胞瘤中的去甲基化酶LSD1,能够关闭维持癌症干细胞特性所需的基因。这不仅...