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【研究前沿】同济大学张赫团队发表关于染色质拓扑相关结构域调控基因转录新模式的最新研究
真核生物基因组在进化上保守,但在空间层次上具有高度可塑性,由染色质环、拓扑相关结构域(topologically associating domain,TAD)等动态的染色质高维结构组成。当TAD重构介导的染色质环处于紊乱状态时,易引起染色质构象重塑,导致基因表达异常,甚至促使肿瘤发生。因此,亟需进一步发现受TAD变化调控的功能基因,并深入揭示TAD重构调控基因转录的新机制。 2024年5...
Nature子刊:蛋白质如何调控基因表达
在细胞内,DNA紧紧盘绕,并与几种蛋白质包装成一种称为“染色质”的结构,这可让DNA适应细胞环境,同时也防止基因在错误的时间表达。在一个化学“条码”的指导下,专门的效应蛋白可以结合染色质,解开它或进一步压缩,以激活或沉默基因。该系统对生物学和医学(例如癌症研究)具有巨大的影响。然而,效应蛋白-染色质相互作用的效率,一直是难以捉摸的,特别是由于两者之间的...
Science:人鼠具有相同保守调控基因
本周,Science报道了美国华盛顿大学John Stamatoyannopoulos教授领导的科研团队进行了一项研究,该研究比较了老鼠和人类的基因表达控制区片段,发现两个物种有近三分之一的该片段序列高度保守。研究人员通过老鼠基因编码区的接合连接,在45种老鼠细胞中对老鼠的常规DNA进行了准确定位。同时,研究人员使用DNA酶敏感片段技术 (DHSs)对老鼠的不同组织进行了核酸分析。这项技...
Science:MORC家族三磷酸腺苷酶调控基因沉默
转座子的插入和DNA重复序列的甲基化修饰通常会导致基因沉默。AtMORC1和AtMORC6是保守的Microrchidia (MORC)三磷酸腺苷酶家族成员,之前有分析预测其功能是催化染色质超级结构的改变。 本文中,研究者在植物拟南芥中突变了AtMORC1和AtMORC6。发现这两个基因的作用是能够去除细胞对于DNA甲基化和转座子的阻遏,但是不会影响DNA或组蛋白的甲基化修饰本身。 &...