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【Nature子刊】中科院利用单细胞转录组学研究,揭示了前列腺癌的细胞类型
2009年,汤富酬等人首次报道了单细胞RNA测序技术。最近的一项研究中,中科院的研究人员利用基于液滴的单细胞RNA测序技术,发现了一种新的前列腺祖细胞类型,在某些情况下可能会促使前列腺癌的发生。 该研究由中国科学院的科学家领导,并于8月17日发表在《自然遗传学》杂志上,题为“Single-cell transcriptomics i...
【研究】韩国研究人员绘制了SARS-CoV-2转录组结构图
研究人员表示,他们使用了两种互补的测序技术来绘制SARS-CoV-2转录组和表位转录组的高分辨率图。他们发现,Illumina和MGI平台等合成测序(SBS)方法具有较高的准确性和覆盖率,但读取长度短。他们补充说,尽管基于纳米孔的直接RNA测序(DRS)的测序准确性受到限制,但它可以进行长读测序,这对于分析长嵌套CoV转录本特别有用。而且,由于DRS可以检测RNA而不是cD...
《Science》:罕见遗传病诊断——转录组分析技术再下一城
近年来,随着测序技术的飞速发展,多组学分析技术在疾病的诊断中应用越来越广泛。然而,在罕见遗传病的检测中依然有诸多限制。近日,来自哥伦比亚大学的研究人员开发了一种等位基因表达失衡分析技术,能够通过分析两个等位基因的表达失衡来诊断罕见疾病。通过联合其它技术,其将在罕见遗传病的诊断和机理研究中发挥重要作用。 目前,可通过对人类外显子组和基因组参考数据库...
甲基化与lncRNA: 表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么?circRNA,lncRNA,外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外,现在很多小伙伴们开始了新的玩法,通过多平台联用,将不同层面的东西结合起来,比如,表观遗传与非编码RNA的结合,就是一个很好的例证。 研究背景 肺癌是一种常见的恶性肿瘤,特别在中国,由于环境的污染,肺癌的发生率也在持续升高。非小细胞肺癌(NSCLC)是肺癌中最常见的...
2016年Nature Methods年度技术:表观转录组分析
2016年12月29日,北京大学生命科学学院伊成器研究组应邀在《Nature Methods》杂志发表题为“Epitranscriptome sequencing technologies: decoding RNA modifications” 的综述论文(doi:10.1038/nmeth.4110)。 表观转录组学(epitranscriptomics,又称“RNA表观遗...
伯豪客户发表转录组测序新成果!
研究背景 FOXP3+调节性T细胞(Treg)具有免疫抑制作用,在维持自身免疫过程中具有重要作用。因此,对Treg细胞在体内的分子机制研究也具有重要意义。关于FOXP3+ Treg细胞稳定性的争论从最近的一些工作报道中也是愈演愈烈。在这些研究中,稳定Treg细胞在炎症反应以及成淋巴反应中具有T-effector-cell-like表型,并且发现FOXP3表达不稳定。稳定的Tre...
Nature Methods:突破性单细胞表观基因组与转录组分析新技术
由英国及比利时的研究人员开发出的一种新方法,使得在单细胞中同时研究表观基因组及转录组成为可能。发布在《自然方法》(Nature Methods)上的实验方案,可帮助科学家们精确描绘出DNA甲基化改变与基因表达之间的关系。 近年来单细胞测序技术发展迅速,被广泛用于研究细胞间的基因表达谱(转录组)差异。近期的一些单细胞实验方案也使得...
黄岩谊、汤富酬组开发新的单细胞转录组测序法
北京大学生物动态光学成像中心(Biodynamic Optical Imaging Center, BIOPIC)是北京大学于2010年成立的一个跨学科合作实体研究中心。中心的目标是发展和利用最先进的生物成像与基因测序手段,在分子和细胞水平上进行生命科学与医学基础研究。中心配备了界一流的研究设备和条件,有重点地发展最新的生物成像和测序技术。 ...
张亚平院士JMCB获人类大脑转录组进化研究进展
人类在进化过程中,脑的大小和复杂程度得到了极大得增加。脑的结构使得人类有着区别于其他物种的极高的认知能力,比如语言能力、抽象思考能力等等。转录后修饰,如RNA编辑、可变剪切等能够由相同的DNA序列生成不同的RNA,进而翻译成不同的蛋白质构体,是扩大蛋白质多样性的重要机制。随着二代测序发展,转录后修饰等已成为当今研究热点。 ...
转录组学方介导的多效调控蛋白 SprA 作用机制研究
Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期,浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了 题 为 “Transcriptome-guided identification of SprA as a pleiotropic regulator in Streptom...
RNA的美丽新世界
至少对于某些理论学家来说,生命的最初形式就是RNA。生命可能源自自我复制的RNA分子,而分子生物学家却长期将目光放在DNA上。但这一偏见确实有不错的理由。DNA不仅被广泛认为携带着生命指令的决定性拷贝,而且也更易于在实验室操作。 如今,这两个合理解释都土崩瓦解了。基于非蛋白编码部分RNA的一整层基因调控模式的发现,以及同期发展起来、操作这些分子的新工具和新技术,已...
《BMC Plant Biology》:安诺优达携手海南大学,探究椰果发育转录组
近期,安诺优达携手海南大学,在椰果转录组研究方向取得重大进展,相关研究结果发表在《BMC Plant Biology》上。该文章以系统全面的数据,展示了不同发育阶段特异性表达的基因,填补了当前椰果发育过程中基因调控方面的空白。 椰子是亚热带重要的经济作物,椰果含丰富维生素B、C、氨基酸、复合多糖物质和多种维生素,具有重要的经济价...