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【Nature子刊】军事医学科学院伯晓晨团队开发新一代深度学习框架,可预测癌症基因模块
2024年7月17日,军事医学科学院伯晓晨团队在期刊《Nature Communications》上发表了题为“CGMega: explainable graph neural network framework with attention mechanisms for cancer gene module dissection”的研究论文。研究结果表明,CGMega可用于剖析癌症基因模块...
【Science】约翰霍普金斯大学联合耶鲁:表观遗传学结合数学以诊断及预测癌症
近日,约翰霍普金斯大学和耶鲁大学的研究者在国际顶尖学术期刊《Science》上发表了研究论文。这篇综述论文指出,通过数学建模可以将癌症的表型可塑性与驱动癌症的表观遗传变化联系起来。这种新的表观遗传定量方法可以更好地定义和测量基因功能中的表观遗传学缺陷及其与癌症遗传景观的相互作用,从而更好、更早地诊断癌症并预测其行为。 https://www.science.org/...
【Nature子刊】评估肿瘤特异性总mRNA水平可预测癌症结果!
德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员开发了一种新方法,他们从患者的肿瘤样本中量化肿瘤特异性的总mRNA水平,这些样本包含癌细胞和非癌细胞。利用这项技术对15种癌症中的6500多名患者的肿瘤进行研究,研究人员证明,癌细胞中较高的mRNA水平与患者存活率降低有关。 这项研究发表在《Nature Biotechnology》上。这种计算方法可以对肿瘤样本中的肿瘤特异性总mRNA水...
【Nature子刊】癌细胞“隐身”怎么办?英美科学家利用数学模型预测癌症进化方向和免疫治疗效果
但癌细胞也不是“吃素”的,癌细胞之所以厉害,就是因为它有“隐身”功能,因此,免疫治疗也并不是对所有的癌症患者都有效。盲目进行免疫治疗不仅成本巨大,还可能适得其反,所以预测癌症的进展和免疫治疗的有效性十分重要。 对此,一个英美研究团队建立了一个数学模型,可以确定免疫系统...
通过机器学习预测癌症抗原能否引起免疫反应——新算法助力个性化癌症疫苗研究
近日,北卡罗莱纳大学的研究人员设计并验证了一个新的机器学习算法模型,该模型可以预测特定肿瘤特异性抗原产生免疫反应的能力,有助于克服研制个性化癌症疫苗的重大障碍。 抗原是免疫系统区分正常细胞和癌细胞的标志,而肿瘤新生抗原(Neoantigen)的发现对癌症的诊断、过继性免疫治疗、肿瘤疫苗、个性化治疗起着极其重要的作用。随着高通量测序技术的发展以及国际大型肿瘤基因组...
Cell:突破!新法有望预测癌症类型!
作者:Michael,Zoe 导 读 癌症免疫疗法可提高患者自身免疫系统的作用,使其能够更好地对抗癌细胞,因此这种疗法为一些先前难以治疗的癌症带来了巨大的希望。然而,免疫疗法并不是对每个人都起作用,这其中涉及的具体机制尚不明确。目前,该领域的大多数研究和由此产生的疗法大都集中在CD8 +...
《Science》重磅!新模型可100%预测癌症药物有效性!
在药物进入临床以前,我们都会进行药物的动物实验和临床前研究,但是多数情况下,我们并不能够很好的预测药物在人体中的疗效,即使其在动物实验中取得了很好的效果。 最近,发表在《Science》上面的一篇名为“Patient-derived organoids model treatment response of metastatic gastrointestinal cancers”...
Nat.Commu. | 这些基因可预测癌症转移、患者预期寿命!
近日,美国加州大学圣地亚哥分校生物工程和生物信息学家发现了肿瘤周围环境引发肿瘤细胞迁移行为的具体方式。研究人员发现,当肿瘤细胞过度集中于机体的有限微环境时,这些细胞就会启动一组特定的基因并开始形成类似于血管的结构。 该研究对应文章则发表于最新上线的Nature Communications杂志,名为3D collagen architecture induces a conserve...
预测癌症和死亡的新方法—生物学年龄预测法
表观遗传学年龄是衡量你生物学年龄的一种新方法。最近,美国西北大学的一项研究表明,当你的生物学(表观遗传学)年龄大于你的实际年龄时,你患癌症的风险就会增加。而且,这两种年龄之间的差异越大,罹患癌症的风险就越高。相关研究结果发表在2月15日的《EBioMedicine》。 本研究通讯作者侯丽芳(音译,Lifang Hou)在去年5月...
预测癌症或不是梦!英科学家发现典型变异基因
人无法预测寿命,但也许在不远的将来,我们可以知道自己什么时候会患上癌症。 英国桑格研究所所长,基因学家迈克尔·斯特拉顿在《自然·遗传学》杂志上发表报告说,他和同事们研究了1万名癌症患者身上的DNA序列,试图寻找有代表性的基因变异。 斯特拉顿说,人体内每个细胞都含有DNA,DNA会发生变异。有些变异是突发的,比如由大量阳光照射或长期吸烟引起,但有些变异缓慢而稳定,它随...
NEJM:生物标志物可预测癌症化疗反应
DNA的错配修复(MMR)主要负责纠正复制后的错误以及维持基因组的稳定,有时候MMR的异常会引发一系列癌变表型,近日来自约翰霍普金斯基墨尔癌症中心(Johns Hopkins Kimmel Cancer Center )的研究人员发现,MMR基因的突变或可帮助准确预测病人对化疗药物―PD-1抑制剂的反应。 研究者Luis Diaz Jr博士指出,本文研究或为我们提供...
新突破:DNA新技术能提前10年预测癌症
位于染色体末端的端粒体长度可作为预测未来是否患癌症的生物指示,据国外媒体报道,受益于一项DNA突破技术,未来科学家能够提前十年预测到人体可能出现的癌细胞。 这项发现与端粒体有关,它是染色体末端的“生物保护帽”,可以避免染色体遭受损坏,其作用非常像避免磨损的鞋带末端塑料保护帽。伴随人类年龄增长,端粒体将变得越来越短,导致DNA受损,从而增大阿兹海默症、糖尿病和心脏病等老年性疾病的发...
PLoS Med:新型基因组学工具或可帮助预测癌症患者对疗法的耐受性
近日,刊登在国际杂志PLoS Medicine上的一篇研究论文中,来自俄亥俄州大学癌症研究中的科学家通过研究开发了一种新方法,其可以测定肿瘤内部的遗传改变,这或许可以帮助医生们鉴别那些对疗法容易产生耐受性的恶性癌症患者。 文章中,研究者利用他们开发的名为MATH(mutant-allele tumor heterogeneity,突变体等位基因肿瘤异质性)的新型评分方...
新型设备可预测癌症的扩散趋势
对于许多癌症病人来讲,原发性肿瘤往往并不是最致死的,最致死的是转移性的肿瘤,这些肿瘤可以从原始发生部位转移到机体其它组织器官中,转移性的肿瘤也是引发癌症患者死亡的主要原因。致死转移性肿瘤形成背后的催化剂被认为是从癌症原始部位进入到患者血液中的癌细胞,研究者将这种癌细胞称为循环肿瘤细胞(CTCs),其可以帮助临床医生们更清楚地鉴别出癌症恶化的机制及其引发...
生物银行:预测癌症 像朱莉一样去战斗
几个月前,影星安吉丽娜·朱莉在没有出现任何乳腺疾病症状的情况下,进行了乳腺切除手术,引起全球关注。她之所以这样做,是因为她得知自己的母亲遗传给了她一种特殊的基因,会增加得乳腺癌和卵巢癌的风险。朱莉的母亲在56岁时因卵巢癌去世,而朱莉也被测出将有87%的几率患上乳腺癌,她提前进行这个手术就是为了避免未...
奥专家认为基因测试对预测癌症风险意义不大
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