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专家访谈
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Nature Methods：超快速的基因组分析工具
近年来，测序市场呈现出百花齐放的美好局面。这使得测序的成本不断下降，但同时也带来了数据分析的难题。经济而又高效地处理全基因组测序的数据，相信是每个人的愿望。如今，一个开源的基因组分析平台也许能满足你的愿望。 这个平台被称为SpeedSeq，由华盛顿大学医学院等机构的研究人员开发。它利用低成本的服务器，在短短的13小时内即可完成50x人类基因组的比对、变异检测...
著名华人院士伉俪Nature子刊揭示肿瘤新靶点
来自加州大学旧金山分校、多伦多儿童医院等处研究人员揭示，进化上功能保守的EAG2钾通道可作为脑肿瘤的一个治疗靶点。这一重要的研究发现发布在8月10日的《自然神经科学》（Nature Neuroscience）杂志上。 领导这一研究的是学术界著名的华人科学家夫妻詹裕农（Yuh-Nung Jan）和叶公杼（Lily Yeh Jan）。二人在199...
两篇Nature填补诺奖研究的空白
最近，研究人员揭开了关于“生物体中的细胞如何处理刺激”的新细节。这项研究部分是由瑞士国家科学基金会资助，主要集中在所谓的G-蛋白，该蛋白有助于将细胞外部的刺激，传达到细胞内部。使用瑞士保罗谢尔研究所（Paul Scherrer Institute，PSI）开发的一种技术，这项研究的作者发现了“G蛋白的哪一部分对于它们的作用是至关重要的”。特别是，他们表明，只有几个氨基酸―...
Nature子刊：生物激光器“点亮”细胞，有望破解癌变机理
哈佛大学的研究人员近期研发了一种生物激光器，可以植入细胞，让细胞内部发光，检测细胞结构和癌变细胞的病理变化。这项技术能应用于医疗领域，特别是破解癌细胞如何转移的机制。 激光束，由带电原子之间级联激发产生，这些连锁反应通常借助内衬反射镜，让光束来回穿梭，从而形成光束。依据此原理，哈佛大学医学院的两位光物理学家Andy Seok-Hyun&nb...
Nature：终于找到你！肝脏干细胞来源揭秘
Nature杂志最新在线的一篇研究中，Howard Hughes医学研究所（HHMI）的科学家确定了能够分化为功能性肝细胞的干细胞。这项研究解开了关于肝脏不断新生的细胞到底从何而来的老谜团。研究的通讯作者，斯坦福大学HHMI研究员Roel Nusse博士说:“我们解决了一个很老的问题.我们发现，就如同其他需要补充丢失细胞的组织，肝脏干细胞也会增殖和产生成...
Nature Genetics:基因突变与癌症儿童药物的有氧副作用有关
加拿大药物安全协会的基因组学网络成员，不列颠哥伦比亚大学的研究员和其他人员做了一个全基因组的多阶段研究，该研究涉及超过450使用蒽环霉素治疗的儿童癌症患者，这些患者来自加拿大的十多个中心。一些患者已经发展成出了心脏的相关毒性症状，而另一些则没有。 他们的分析揭示了一个已知的，位于视黄醛受体基因RARG内的rs2229774，据估计，接受这些药物治疗会增加五倍左...
两篇Nature文章揭示细胞死亡新机制
在10亿多年前发生的一次内共生事件中，一个细菌被细胞所吞食，并最终变成了细胞器――线粒体。随着时间的推移，近1000种编码线粒体蛋白的基因，其中的大多数现在从线粒体转移到了细胞核中，并且是在细胞质中被翻译为蛋白质。一个至关重要的输入机制确保了这些蛋白质最终定位在线粒体内适当的位置。 发表在《自然》（Nature）杂志上的两项互补研究，提供了...
Nature：肿瘤关键蛋白结构被成功解析
发表在国际杂志Nature上的一项研究报告中，来自阿贡国家实验室等处的研究者利用高特异性的X射线晶体学技术解析了低氧诱导性因子（HIFs）的蛋白结构，低氧诱导性因子是肿瘤对低氧反应的重要调节子，该研究或为寻找新型药物切断癌细胞的氧气和营养供给最终治疗癌症提供新的思路。 研究者Fraydoon Rastinejad博士指出，这项研...
上海交大Nature子刊发表最新成果之脑海绵状血管瘤
脑海绵状血管瘤（CCM）是发生于中枢神经系统的常见血管畸形，可导致多种神经性损伤，引起出血性中风、癫痫等症状。人们发现这种疾病与三个致病基因有关，它们编码的蛋白分别是CCM1、CCM2和CCM3。这三种蛋白都是接头蛋白，能够和多种配体相互作用，参与了多种生物学过程。理解CCM蛋白与其他蛋白的互作，有助于揭示脑海绵状血管瘤的发病机理。 家族...
Nature子刊：提高紫杉醇的抗癌疗效
研究人员将一种广泛使用的癌症药物装在纳米颗粒中，将它的抗肿瘤效力提高了七倍。 数十年来紫杉醇（paclitaxel）被广泛用来治疗乳腺癌、卵巢癌、肺癌和其他一些癌症。但由于它的分子大小较小，且不溶于水――这些特性使得机体能够极快速地清除药物，减少它在肿瘤处累积，限制了它的疗效。 尽管有许多的分子包装系统被开发出来，在传递药物的同...
Nature子刊：隐藏在肿瘤中的定时炸弹
化疗药物可以有效抑制高级别卵巢癌，但在治疗之后癌症常常会复发。加州大学洛杉矶分校的研究人员发现，卵巢肿瘤中的一群细胞（CA125阴性细胞）有很强的DNA修复能力，能够抵抗化疗诱发的细胞凋亡，最终重新长出肿瘤。将化疗药物与一种试验性药物联合使用，可以有效消灭这群致命的细胞。这项研究发表在八月三日的Nature Communications杂志上。 ...
Nature子刊重要突破：全能细胞的诞生
多能细胞能够生成胚胎里所有类型的组织，从成体细胞获得多能细胞的技术已经相当成熟了。法国INSERM和德国马普所的研究团队日前获得了重大突破，成功诱导出了全能细胞。这一成果发表在八月三日的Nature Structural & Molecular Biology杂志上。 在受精刚刚完成的时候胚胎只有一两个细胞，这些细胞是全能性的，可...
Nature发布癌症研究突破性成果
在斯坦福Burnham Prebys医学研究所(SBP)与Argonne国家实验室的一项合作研究中，科学家们利用高度专业化的X-射线晶体学技术，解开了肿瘤低氧反应重要调控因子――低氧诱导因子(HIFs)的蛋白质结构。发表在今天《自然》（Nature）杂志上的研究结果，为找到一些新的药物通过切断氧气和营养物质供应来治疗肿瘤打开了...
Nature：揭示肝脏干细胞来源
霍华德休斯医学研究所(HHMI)的科学家们发现了生成功能性肝细胞的肝脏干细胞。这一研究工作解开了关于肝脏中新细胞起源的一个长期的谜题，即便在健康器官中随着细胞的死亡肝脏也必须不断地补充新细胞。 研究的领导者、HHMI研究员、斯坦福大学Roel Nusse说：“我们解开了一个非常古老的问题。我们证实像其他需要补充失去细胞的组织一样，肝脏中具有一些干细胞，在即便没有损伤或...
Nature：风口浪尖上的CRISPR基因编辑
“扯淡！”，这是哈佛医学院生物工程师Kevin Esvelt看到去年发表在《科学》（Science）杂志上的一篇研究论文时，口中冒出来的第一个词。这项研究工作描述利用一种基因编辑技术将突变插入到了果蝇中，并且这种突变可以传递给几乎所有的果蝇后代。尽管有趣，这份研究报告却让Esvelt感到不安：如果基因工程果蝇从实...
Naturecommu：科学家发现导致胰腺癌发生和转移的重要分子
近日，来自德国的科学家在国际学术期刊nature communication发表了一项最新研究进展，他们发现ATM与胰腺导管腺癌的发生和转移具有重要相关性。 胰腺导管腺癌（PDAC）是一种致命癌症，在西方国家所有可导致死亡的癌症类型中位列第四，五年整体生存率只有大约4%。目前利用基因工程动物模型可以有效地对PDAC的形态...
吕志民教授Nature子刊发布癌症重要发现
DNA双链断裂(DSBs)是最严重的一种遗传缺陷形式，可导致癌症及治疗耐药。发表于本周的一项新研究揭示出了更多有关DSBs发生原因以及这种断裂修复机制的细节。 来自德克萨斯大学MD安德森癌症中心、上海交通大学和四川大学的研究人员报告称，他们发现了一种代谢酶――延胡索酸酶（fumarase）在DNA复制中所起的作用。研究结果发布在8月3日的《...
清华大学Nature子刊发表自噬新文章
来自清华大学、北京大学的研究人员证实，CapZ通过促进隔离膜（isolation membrane）内肌动蛋白（actin）组装调控了自噬体膜形成。这一研究发现发布在8月3日的《自然细胞生物学》（Nature Cell Biology）杂志上。 清华大学的俞立（Li Yu）教授、陈柱成（Zhucheng Chen）教授及Na Mi是这篇论文...
华人学者Nature子刊发表癌症重要发现 响应蛋白促进DNA损伤修复
DNA损伤会提高癌症的风险，研究人员发现已知在细胞遭受压力时会恢复表达的一种蛋白，在DNA修复一个早期的关键步骤中发挥了重要作用。他们的研究结果发布在《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。 在这一要么迫使细胞修复DNA损伤要么死亡的迅疾、复杂情况下，ATF3（activating transcription fa...
清华大学Nature子刊发布mRNA研究新方法
来自清华大学、哥伦比亚大学的研究人员报告称，他们开发出了一种叫做mRIN的新方法，可用于直接评估来自大型RNA测序数据全基因组及基因特异性mRNA的完整性。这一重要的研究成果发布在8月3日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。 哥伦比亚大学系统生物学系助理教授张朝林（Chaolin Zhang）是这篇论文的通讯...