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基因测序描绘个体化医疗产业图谱
随着高通量测序技术的引入和“大数据”处理能力的提高,现代医学正在经历巨大的变革,由传统标准化医疗模式向个体化医疗模式转变。而人类基因组计划和DNA元素百科全书计划的完成及肿瘤基因图谱的绘制,也为“量体裁药”式的个体化医疗提供了有力工具,医学领域面临新的机遇。不过,业内人士表示,尽管市场空间可观,但短期来看个性化医疗相关技术和产品对相关公司的收入贡献...
Nature子刊:新型工具有助揭示多种疾病发生的遗传根源
近日,发表在国际杂志Nature Methods上的一篇研究论文中,来自巴塞罗那生物医学研究院(IRB Barcelona)的研究人员开发了一种新型工具,其可以帮助揭示许多复杂疾病发生的遗传原因,比如癌症、阿尔兹海默氏症及糖尿病等。 文章中,研究人员表示他们的实验室中有超过2.3万已经被记录的遗传突变可以影响2000种蛋白的功能,而研究者希望以此来揭示这些...
JCI:揭秘黑色素瘤对药物产生耐药性的新型图谱
名为BRAF抑制剂的药物对于黑色素瘤患者而言非常重要,该药物可以通过关闭刺激癌细胞生长的BRAF蛋白来间接抑制癌症发展挽救患者的生命;然而这种药物通常仅能有效使用1年甚至更短,科学家们在癌细胞中发现了可以产生耐药性的DNA突变,但他们并未找出这些遗传突变产生的原因。 近日,一篇发表于国际杂志Journal of Cl...
UCSD,UCSF推出癌细胞图谱计划
该项目由UCSD穆尔斯癌症中心和UCSF的Helen Diller家庭综合癌症中心合作完成,该项目将获得癌症患者提供的组织样品。该项目还包括在UCSD利用专业的知识,进行大数据的分析,在UCSF开展细胞结构和功能的整合研究。 CCMI是由Nevan Krogan和Trey Ideker领导的,Nevan Krogan是UCSF的QB...
Science:首次实现对人类蛋白质图谱信息的大型分析
发表在国际著名杂志Science上的一篇研究论文中,来自瑞典皇家理工学院的研究者首次对人类蛋白质图谱(Human Protein Atlas)进行了大量的分析,其中包括和癌症相关的蛋白质信息,存在于血液中的蛋白质数量等,这就为后期拓展开发靶向药物的市场提供了一定的帮助。 人类蛋白质图谱是在2014年6月由Knut and Alice Wallenberg基...
中国研究人员PNAS绘制胃癌突变图谱
来自天津医科大学、德克萨斯大学MD安德森癌症中心及加州大学圣地亚哥分校等处的研究人员,在新研究中绘制出了中国人群胃癌(Gastric cancer)的突变图谱,并探讨了其对于预后和治疗的意义。研究结果发布在1月12日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。 中国工程院院士、天津医科大学名誉校长郝希山(Xishan Hao)教授、德克萨斯大学MD安德森癌症中心的Wei Zhan...
重症监护病房的温馨图谱
昨日从天津市第四中心医院重症监护病房了解到,面对部分因气管插管、气管切开或其他原因不能与医护人员正常交流的患者,ICU护理人员手绘了包括想喝水、想见家属、伤口疼痛、身体不舒服、需要找医生等的图谱。当患者有需求时,只要动动手指指出对应图片,护理人员就能立刻明白。 图片由医院提供 ICU一病区护士长宋...
Ecosphere:科学家首次绘制出了人类疾病全球图谱
近日,一篇发表在国际杂志Ecosphere上的研究论文中,来自北卡罗来纳州立大学的研究人员通过研究首次绘制了引发人类疾病的病原菌图谱,该图谱中研究人员将世界分为许多不同疾病发生的区域。 研究者表示,依据传播媒介相关的人类疾病,世界可以被分为7大区域,这些疾病媒介都包括通过害虫进行的传播,比如蚊子传播的疟疾;而依据非病原媒介相关的...
Cell:迄今最大人类基因组编码蛋白相互作用图谱问世
据最新一期《细胞》杂志报道,由加拿大和美国科学家组成的一个国际研究小组,绘制出了迄今最大规模的人类基因组编码蛋白间直接相互作用的图谱,并预测出数十个与癌症相关的新基因。该项研究成果对于理解癌症和其他疾病的形成机制,并最终开发出治疗和预防方案至关重要。 加拿大高等研究院、美国达纳法博癌症研究中心和哈佛医学院共同完成的...
11月王牌聚焦:各种重大图谱成果扑面而来
时近年末,各种重大成果好似扎堆一样接踵而来,人类蛋白质互作组图谱、人类基因组重组图谱、ENCODE重大成果接连公布,让人眼花缭乱,科学界“过年”的氛围扑面而来。 首先是科学家们公布了迄今为止最大规模的人类基因组编码蛋白直接互作图谱,并预测出了与癌症相关的几十个新基因。这一新“人类互作组(interactome)”图谱描述了蛋白质之间的1.4万...
历经十年,人类蛋白质组图谱公布
由瑞典皇家理工学院的Mathias Uhlén领导的一项长达十年之久的研究项目——人类蛋白质图集(Human Protein Atlas,HPA)项目,在本周发布了1300万张全身人类蛋白质“图像”。通过制备出荧光标记抗体,将其应用于保存组织的薄切片,观察组织的颜色以及附着在组织上的抗体,研究人员绘制出了17,000个已知蛋白质的图像。 Uhlén表示,构建人类“蛋白质组”的系统详细图集...
NATURE:自身免疫病致病变种的遗传及表观遗传精确图谱
全基因组扫描相关的研究已经识别出了可能导致潜在人类疾病的位点,但是它在所导致的核苷酸变异和机制还并不为人知。我们在此开发了精确制图的算法,用基因型分型数据来识别21种可能由自身免疫疾病导致的致病变种。 我们将这些预判和转录以及顺式调控的元件注释相结合,元件注释来自于包括静息态和兴奋态的CD4+T-细胞、调节性T细胞、CD8+T细胞、B细胞和单核细胞等在内的原发性免疫细胞的RNA和...
Nat Commun:新型蛋白质图谱或可帮助寻找潜在的抗癌药物
近日,一项发表在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自伦敦帝国理工学院的研究人员通过研究揭示了致病性酶类如何对蛋白质进行修饰及其如何被阻断的分子机制;这种酶类名为N-肉豆蔻酰基转移酶(NMT),研究人员希望该研究可以帮助他们设计新型药物来靶向作用该酶类,为癌症及炎性疾病开发新型靶向性疗法。 文章中,研究者鉴别出了一种可以阻断NMT活...
绘一张身体蛋白质折叠的图谱
对于诺贝尔奖观察者而言,这又是一个推测的季节。2014年拉斯克奖于近日揭晓。久负名望的拉斯克奖被誉为“美国诺贝尔奖”,也堪称诺贝尔奖风向标。拉斯克奖基金会宣布,有86位拉斯克奖获得者之后又获得了诺贝尔奖,其中47位出现在最近30年。 今年,日本京都大学的Kazutoshi Mori和美国加州大学旧金山分校的Peter Walter因发现身体如何修复...
Science:比较远古与现代人的甲基化图谱
对远古 DNA 进行测序已经帮助科学家们了解将现代人与他们已灭绝的最近亲族尼安德特人与丹尼索瓦人分开的遗传改变。现在,发表在《科学》杂志上的一项最新研究表明,科学家们也已经更好地理解了表观遗传学是如何影响这些群组之间的差异的。 表观遗传学调控可改变基因的表达方式,但它并非通过改变基础的 DNA 序列,而是通过包括 DNA 甲基...
Nature发布重大成果:首个人类基因表达全图谱问世
由大型国际性协会研究人员组成的一个研究组今日公布了人体内主要细胞和组织中基因作用方式的第一个全面,详细的图谱。这一发现描绘了调控基因活性的复杂网络,也提供了在疾病中扮演重要作用的基因的新信息。 “我们第一次能够确定基因组中哪些区域在发生疾病的时候会被激活,哪些区域在正常情况下被激活了,而且无论是脑细胞,还是皮肤,血液中的干细胞,或者毛囊中...
Nature:科学家绘制迄今最大基因表达图谱
日前,来自劳伦斯伯克利国家实验室(Lawrence Berkeley National Laboratory)等机构的研究人员在《自然》(Nature)杂志上报告称,他们对编码于动物基因组中的信息在不同的器官、发育阶段和环境条件下的处理机制展开了迄今为止最大型的调查研究,绘制出了基因如何在神经细胞中发挥功能以及响应环境压力的新图像。科学家们对遗传学研...
上海中山医院:创建心脏研究新图谱库 推动心脏转化医学
上海中山医院 葛均波院士 记者今天上午从复旦大学获悉,该校与美国加州大学经过3年多的合作,近日终于在心脏蛋白质组生物信息学研究方面取得重要进展,创建了全球首个统一标准的“心脏细胞器蛋白质图谱库”。这项研究犹如一座桥梁,把原来“分散进行”的心脏...
eLife:绘制第一张人类抵抗HIV图谱
我们的基因掌控着通向未来艾滋病治疗的钥匙?利用一台超级计算机,科学家们对数以千计的HIV病毒株基因组进行了分析,生成了第一张人类抵抗AIDS的图谱。 通往未来艾滋病治疗的钥匙有可能就藏在我们自身的基因之中。每个受到HIV感染的人都会采用一些防御策略,一些人甚至根本没有接受任何的治疗但却成功地遏制住了病毒。这种免疫系统斗争会在病毒内留下它...
Science:一幅脑内的甲基化图谱
表观基因组学的变化,包括DNA的化学修饰,可以作为基因组的一层额外信息。表观基因组学在学习和记忆及年龄相关的认知度方面扮演着重要的角色。新的研究发现DNA甲基化,一种特殊的表观基因组学修饰的形式。从出生到成年,DNA甲基化形式在大脑细胞中是动态变化的。从而帮助理解大脑细胞中基因组学的信息是如何控制胎儿的发育的。大脑比其它器官复杂,这项发现使科学家们...