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专家访谈
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【新品】癌症检测/HPV筛查新工具——可冻干尿液直扩基因分型检测
基因分型检测 基因分型检测（Genotyping）可用于遗传疾病诊断，识别疾病风险因素，并指导治疗决策。单点突变，例如单核苷酸多态性（SNPs），是人类基因组中最常见的遗传变异类型，在个体遗传多样性方面发挥着重要作用。 虽然并非所有的单点突变都会产生功能性后果，但有些突变会显著影响基因功能或蛋白质结构，这反过来会增加/降低个体患癌症等疾病的风险。 在体外诊...
精准个体化治疗又添新工具！武汉大学发现预防癌症进展新策略
近日，武汉大学研究人员在权威期刊《Advanced Science》上发表了题为“A Multifunctional Delivery System for Remodulating Cell Behaviors of Circulating Malignant Cells to Prevent Cell Fusion”的研究论文，该研究证明了通过使用多功能递送载体来实现基因组编辑质粒和基于...
【Nature子刊】新方向！诊断肺癌新工具，或可用于临床治疗
通过比较NSCLC患者和非癌症个体的代谢组学特征，我们发现主要与色氨酸代谢、TCA循环、尿素循环和脂质代谢相关的代谢物浓度水平发生了显著变化。此外，部分相关网络分析揭示了代谢物的新比率，显着区分了被考虑的参与者群体。利用鉴定出的显著改变的代谢物及其比例，我们开发了一个ROC AUC值为0.96的机器学习分类模型。所开发的机器学习肺癌模型可以作为肺癌实时诊断方法的原型，未来可能会被引入常规临床...
一国际数据库被检出超34万篇问题论文，新工具发现它们涉及论文工厂！
近年来，被期刊撤销的论文数量不断增加。这些撤稿数据背后，论文工厂扮演了重要角色。科学界面临着日渐规模化、工业化的学术作假手段的侵袭，打击论文工厂已成为了颇为急切的问题。 论文工厂指的是那些按订单制作科研手稿的公司或个人。根据买者需求，他们雇用相关专业写手，套用学术模板写作，最终发表在不同级别的刊物上，整套“一条龙”服务应运而生。 在2021年3月23日，Nature 杂志曾起底论文工厂...
更高效！中科院周琪/李伟团队建立蛋白工程化改造新方法和基于Cas12i的基因编辑新工具
CRISPR-Cas基因组编辑技术在基因治疗、农作物经济性状改良及基础研究等领域均有多样化的应用，引领生物技术与应用的快速发展。自然界中广泛存在的天然CRISPR-Cas系统为新型基因编辑工具研发提供了丰富资源。然而，自然界微生物中发现的大多数Cas工具蛋白在哺乳动物细胞中的编辑效率较低，这限制了它们的应用，尤其是在生物医学方面的应用。 近日，中国科学院动物研究所...
基于CRISPR的两种核酸检测新工具
CRISPR技术的两大豪门实验室分别开发出了一种工具。张锋实验室利用Cas13蛋白的天然RNase活性开发和优化了一种方法，包括SHERLOCK和SHERLOCK v2。Jennifer Doudna的实验室则利用Cas2a的非特异性ssDNA降解开发出另一种称为DETECTR的方法。 检测核酸的时候，大家都希望特异性和灵敏度越高越好。然而，目前的检测方法要么缺乏灵...
CRISPR换乘新工具直冲临床！Nature Biotechnology重磅报导纳米递送实现“安全运载”！
更高的编辑效率，更有效的递送方式。这两者无疑是大多数基因编辑科学家最基本的追求。目前，最常用的基因编辑递送系统则是以腺伴随病毒（AAV）为代表的病毒递送系统。 AAV的缺陷 昨天，一篇发表于Nature Biotechnology 杂志研究所指出的，理想的CRISPR-Cas9传递系统应该限制...
常兴团队Nature Methods发布CRISPR新工具
人们已经发现了大量与人类疾病有关的单核苷酸变异，其中许多是功能获得性突变，会导致蛋白质的氨基酸置换或者形成转录因子的新结合位点。然而现有筛选方法（包括CRISPR、CRISPRi和RNAi）只能破坏一个基因或者改变其表达水平，难以引入一系列功能获得性突变进行高通量筛选，亟需能有效作用于哺乳动物细胞的遗传多样化工具。 中科院上海生命科学院/上海交大医...
常兴团队Nature Methods发布CRISPR新工具
人们已经发现了大量与人类疾病有关的单核苷酸变异，其中许多是功能获得性突变，会导致蛋白质的氨基酸置换或者形成转录因子的新结合位点。然而现有筛选方法（包括CRISPR、CRISPRi和RNAi）只能破坏一个基因或者改变其表达水平，难以引入一系列功能获得性突变进行高通量筛选，亟需能有效作用于哺乳动物细胞的遗传多样化工具。 中科院上海生命科学院/上海交大医学院健康科学研究所的研究团队十月十日在Nat...
新工具助力攻克癌症免疫治疗（如CTLA-4、PD-1）耐药性
对癌症患者进行免疫细胞治疗的过程中，始终存在着的问题是，仅对其中的一部分有治疗效果，而对另一部分患者的治疗效果始终不让人满意。Insilico Medicine一直致力于研究这两类患者的差别，他们将研究的焦点放在了那些会影响免疫检查点抑制物的物质上。 免疫细胞治疗应用于多种肿瘤，包括黑色素瘤，非小细胞肺癌，其中很多患者的病情都得到了有效的治疗。然而，依然有一定数量的...
全基因组测序：公共健康管理的新工具
最近，美国德克萨斯大学的研究人员开发了一种新的NGS病原追踪技术。研究人员希望该技术可以对大规模传染病的爆发起到有效的预防与控制作用。该研究的对应论文名为：Whole Genome Sequencing for Genomics-Guided Investigations of Escherichia coli O157: H7 Outbreaks，...
“量化活细胞的蛋白质水平非常重要”——新工具帮科学家看到活细胞蛋白质
生物物理学家Joerg Bewersdorf说，2006年是荧光显微镜学的奇迹之年。而与之相媲美的另一个年份是1905年，当时爱因斯坦以相对论、量子论和原子物理学变革了物理领域。而这场显微镜学革命，则是由3篇论文组成的，科学家首次能窥见细胞内部并追踪单个分子的行为。 “每个分子是一台机器，一台纳米机器。”Bewersdorf说。其中，蛋白质是尤为复杂的分子，它们以多种方式弯曲缠绕，执行细胞新...
《自然》：法国科学家发现一种堪比CRISPR的潜在基因编辑新工具
2016年1月11日，美国专利和商标局（USPTO）申明将开始审核“CRISPR-Cas9专利”，以确定CRISPR技术的第一发明单位究竟是麻省理工还是加州伯克利。审核期间，专利申请双方提供相关证据，例如期刊出版物和实验室记录，来证明技术的原创性。 发现CRISPR的三名主要人物 虽...
Nature子刊：准确预测寿命的新工具
最近，韩国基础科学院（IBS）植物衰老研究中心的一组研究人员，在普林斯顿大学Coleen Murphy教授的带领下，不是专注于绘制生命的长度，而是发明了一种工具，用来准确预测寿命，以及评估目前的健康状况，他们还发现了延长“健康寿命”（有机体处于其最佳健康的时间）的调控机制。相关研究结果发表在最近的《Nature Communications》。 随着人类的寿命越来越长，很...
弥补ChIP-seq缺陷的新工具
最近，研究人员开发出一种新技术，可精确地标记“称为转录因子的调控蛋白，是在活细胞的细胞核中哪个部位与DNA相互作用”。 美国辛辛那提儿童医院医学中心的科学家，将这项研究结果发表在八月六日的《分子细胞》杂志（Molecular Cell）。这项新技术被称为SpDamID，可让科学家回答现有技术无法解决的、有关“组织发育和疾病”的基本问题。 ...
流式细胞技术新工具：RT-DC甩开标记
流式细胞技术与相关的荧光激活细胞分选技术（fluorescence-activated cell sorter，FACS）对生物学研究产生了深远的影响，但是它们还是存在一些局限性，近年来，科学家们研发出了一些新的策略，但他们并没有修改传统的流式细胞仪，而是在新型微流控装置上进行精简。这些微型芯片实验室能帮助研究人员在更为多样的物理和分子特征基础上进行筛选和分型，而且也不需要抗体。以下是几位学者提出...
解决基因组学重要挑战的新工具
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术，可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多，但是，仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列，从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前，去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列，还是一个手动和耗时的过程，为了去除污染序列，就需要有关它们的信息。 为了解决这个障碍...
科学家“观察”到人脑编码新概念过程或可开发学习及测评新工具
储存居住信息的脑区 储存饮食习性信息的脑区 图片展示了志愿者是如何学习新概念的，比如名为Cytar的动物的生活和饮食习性，它住在大树巢中，用小牙吃树上的水果。这些新知识分别被编码储存在不同脑区。 美国卡内基・梅隆大学（CMU）利用先进的脑成像技术，观察了大脑对某种具体事物的编码过程，并能通过脑活动标记知道一...
Science：极端病毒或可帮助科学家开发治疗疾病的新工具
通过揭开生活在几乎是沸酸环境中奇怪病毒，来自弗吉尼亚大学医学院的研究人员或许就寻找到了可以抵御人类疾病的新型工具，相关研究发表于国际杂志Science上。研究者Edward H. Egelman博士表示，让我们非常感兴趣的就是观察蛋白质和DNA如何结合来在极端恶劣的环境下保持稳定，而我们的研究发现也似乎阐明了一种对热、干燥及紫外辐射的耐受性机制，这或许就可以帮助开发新型的包...
美国研究：糖尿病可作为研究阿尔茨海默病的新工具
<div>Kasinathan总结道：“按照今天大致的阿尔茨海默症和糖尿病的流行病学增长，研究一种阿尔茨海默症神经病理的生理学模型一直是一个重要的目标。它使得我们可以明确阿尔茨海默症的一种潜在生物标志物，同时可能对于阿尔茨海默症的药物测试和研发也会起到非常重要的作用。”</div> <div id="contentText"> 一项实...