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【Nature子刊】AI对抗疫情:清华大学程功团队开发SARS-CoV-2进化预测模型
2024年12月23日,清华大学医学院程功教授团队在期刊《Signal Transduction and Targeted Therapy》上发表了题为“A predictive language model for SARS-CoV-2 evolution”的研究论文。利用该模型,团队成功鉴定并验证了几种病毒感染性和免疫逃避能力显著增强的变体。通过输入3个不同时间点的序列数据,团队在XBB...
【Nature】美国华盛顿大学丁莉团队:揭示肿瘤在2D与3D空间中的进化策略和微环境互动
2024年10月30日,美国华盛顿大学医学院丁莉团队在期刊《Nature》上发表了题为“Tumour evolution and microenvironment interactions in 2D and 3D space”的研究论文。团队通过共同注册来自16个样本的48个连续ST切片来重建3D肿瘤结构,这提供了对肿瘤空间组织和异质性的见解。此外,使用无监督深度学习算法并整合ST和COD...
【Cell子刊】揭秘人类大脑进化:北京大学王韵团队发现染色质结构域Y样在皮层发育中的关键作用
2024年10月, 北京大学神经科学研究所王韵团队在期刊《Cell Reports》上发表了题为“The chromodomain protein CDYL confers forebrain identity to human cortical organoids by inhibiting neuronatin”的研究论文。在这项研究中,团队表明CDYL对人类皮层神经发生至关重要,并且它...
《Nature》七篇连发!肺癌研究重大突破!科学家绘制出肺癌进化分子画像,肺癌诊疗或迎新变革
肺癌演变 01 https://www.nature.com/articles/s41586-023-05783-5 这项研究分析了在手术中或随访期间从预期参加TRACERx研究的第一批421名非小细胞肺癌患者中取样的1644个肿瘤区域。研究试图找到不同亚克隆的驱动优势和与临床结局之间的关系。 在肺腺癌中,40个常见癌症基...
【Science】脂肪肝“重男轻女”?植根于免疫和新陈代谢之间的进化权衡
10月20日,来自美国加州大学旧金山分校的研究者们于《科学》(Science)期刊发表了题为“An evolutionary trade-off between host immunity and metabolism drives fatty liver in male mice”的论文。该研究表明,肝转录因子BCL6在雄性小鼠更容易罹患非酒精性脂肪肝病这一表型上起到促进作用;但在细菌感染...
【Nature】重磅!空间基因组学:助力科学家绘制癌症进化谱系图,破解乳腺癌扩散机制
这项新研究“Spatial genomics maps the structure, nature and evolution of cancer clones”发表在《Nature》杂志上,讲述了现在如何绘制肿瘤发展图谱,结合癌细胞的遗传信息、周围的细胞类型以及它们如何随着时间的推移与环境相互作用。未来,这种方法可用于观察治疗如何影响癌症,不仅仅在基因水平上,还包括对肿瘤与免疫系统及其周围...
ctDNA检测揭示晚期胃癌序贯化疗期间的分子进化过程
上海交通大学医学院附属瑞金医院肿瘤科近日在《Journal of Translational Medicine》杂志上发表了检测循环肿瘤DNA(ctDNA)辅助预测晚期胃癌一线含铂化疗疗效的学术论文,题名为“Molecular evolutionary process of advanced gastric cancer during se...
【倒计时1天】蛋白定向进化在工业酶领域的应用以及Twist Bioscience的解决方案,4月28日上午十点,我们云端相会!
会议背景 蛋白质工程和酶工程在医药、食品、化工等众多研究领域发挥着举足轻重的作用。如何构建高效的酶分子改造策略?如何通过对酶分子进行有效的改造,实现化学品及手性医药中间体的酶法绿色合成?如何运用蛋白序列研究工具,更快捷、精准地探索蛋白质与其环境之间的复杂关系? 欢迎参加由Twist Bioscience于4月28日举办的网络研讨会——蛋白定量进化在工业酶领域的...
蛋白定向进化在工业酶领域的应用以及Twist Bioscience的解决方案
会议背景 蛋白质工程和酶工程在医药、食品、化工等众多研究领域发挥着举足轻重的作用。如何构建高效的酶分子改造策略?如何通过对酶分子进行有效的改造,实现化学品及手性医药中间体的酶法绿色合成?如何运用蛋白序列研究工具,更快捷、精准地探索蛋白质与其环境之间的复杂关系? 欢迎参加由Twist Bioscience于4月28日举办...
【Nature】挑战进化理论,基因突变并非随机,有朝一日必将助力对抗癌症!
加州大学戴维斯分校(University of California Davis,UCD)和德国马克斯-普朗克进化生物学研究所(Max Planck Institute for Developmental Biology)的一项新研究表明,一种简单的路边杂草可能是深入了解和预测DNA突变的关键。 这项研究结果于昨日(1月12日)发表在《Nature》上,题为“M...
【PLOS Biology】它的天生抗癌能力能否造福人类?从物种进化中寻找治疗癌症的新方法!
在一项新研究中,Angelo Fortunato及其同事描述了丝盘虫的不寻常能力,即使是受到严重的辐射损伤后,它仍能修复其DNA,并且挤出受损的细胞。这一发现推动了对天然癌症抑制机制的科学研究。从这些物种进化中得出的见解可能会为治疗癌症找到更有效的新方法。去年,仅在美国,就有60多万人因癌症而丧生! 在这项新研究中观察到的这种不同寻常的微生物,还未充分发展,并且很容易在实验室中培...
【Nature子刊】你知道癌细胞是怎么进化的吗?它们有自己的生长方式!
当癌细胞发生突变时,一部分癌细胞通过突变获得优势,这些突变使它们更能适应环境,分裂并产生一组“更具契合性”的细胞。例如,如果癌细胞的进化是为了在营养或氧气供应不足的条件下生存,那么新产生的癌细胞可能取代其他“旧癌细胞”,成为主导群体。 肿瘤的进化过程非常复杂,并受到许多因素的影响,包括肿瘤的生长方式。但这一点尚未完全了解。 近日,一个名为“...
【Nature子刊】探索——肿瘤进化
肿瘤具有异质性,这意味着同一肿瘤的不同部分可以在遗传学上截然不同。这种现象被称为肿瘤内异质性,在癌症研究领域内的意义正在稳步增强。同一肿瘤内的细胞和分子差异由于其对诊断和使用靶向治疗的意义,在许多不同的癌症中发挥重要作用。根据Charité医学院、马克斯·德尔布吕克分子医学中心(MDC)和德国癌症转化研究协会(DKTK)最近发表在《Nature Communications》的一项题为“Sp...
【Nature子刊】受达尔文进化论启发,创造药物开发新技术!
身体必须不断地保护自己不受细菌和病毒的侵害。它会产生数百万种不同的抗体,这些抗体被选择来识别敌人,并触发可能的最佳免疫反应。科学家们利用这些抗体进行治疗,以靶蛋白并破坏它们的有害影响。然而,识别将形成药物基础的小分子是一个漫长而乏味的过程。 瑞士日内瓦大学(UNIGE)的化学家们开发了一种受达尔文进化论启发的技术:放大最佳组合并产生多样性,从而使生物学找到解决新问题...
【Science】单细胞测序——在无脑的海绵的基因组中找到神经细胞如何进化的线索!
海绵是很原始的生物,没有神经系统和内部器官。就像你水槽边的那些,大多数都温顺地躺在海底,一动不动。他们缺乏肌肉、肺或鳃、肠道和明显的神经细胞,吃任何漂浮来的营养物质。然而,一项新的研究表明,它们的细胞有一个出人意料的类似神经细胞的特征:它和与其相互作用的细胞具有一些与神经细胞相同的工作基因。这两种细胞可能共同协调进食,就像我们复杂的大脑为我们做的那样。尽管如此,一些海绵生物学家仍质疑这一突出...
【Nature热议】癌细胞为何会卷土重来?读懂肿瘤细胞如何促进化疗耐药性以及如何克服耐药性
耐药性又称抗药性,一般是指病原体与药物多次接触后,对药物的敏感性下降甚至消失,致使药物对该病原体的疗效降低或无效。了解对化疗的耐药性是如何产生的,可能会促使更好的抗癌治疗。 当一部分被称为持续性细胞的肿瘤细胞在化疗中存活下来时,癌症就会复发。在治疗药物存在的情况下,这些持续存在的细胞大多数是不分裂的(静止的),但在治疗过程中,一个罕见的亚群可以重新进入细胞周期,从而使它们...
【Nature】12年时间!神秘古菌终被培养出来,揭开细胞进化历程
古细菌(简称古菌)作为生物三界之一(另外两界为细菌和真核生物),起源比细菌更为古老,其通常存在于深海、高温等极端环境中。而且,它们可能是地球上复杂生命进化的关键。尽管真核生物和古菌可能都起源于共同的祖先,但是许多科学家怀疑是古菌促进了真核生物群的产生,例如变形虫、蘑菇、植物和人等。 一种流行的进化理论表明,真核生物就是起源于古菌,古菌在此过程中与其...
【快讯】浙江大学医学院郭国骥团队发表基于跨物种细胞图谱的谱系进化研究
郭国骥教授 细胞类型是多分子生物的基本单位。后生动物是由不同结构和功能的细胞类型组成的,如:上皮神经、肌肉、神经细胞等。细胞类型的数目和总类别伴随着物种进化而改变,细胞类型已经被当作“进化单位”,具有独立进化的潜力。细胞类型的演化是比较细胞生物学的至关重要的一环,而在物种进化进程中,关于细胞类型起...
【PNAS】胰岛素已达进化“死胡同”,大多数人都是2型糖尿病的“易感人群”
传统观点认为,蛋白质具有绝对的功能特异性,同时也只具有单一、固定的结构,但事实并非如此。蛋白质具有很强的适应性,可以“进化”出新的功能与结构。 然而,最近有一项新的研究发现,人体中一种重要的蛋白质——胰岛素已达到进化的“死胡同”,这导致它适应肥胖的能力将不再增强,也使得大多数人都是2型糖尿病的“易感人群”。 &ems...
【Nature子刊】癌细胞“隐身”怎么办?英美科学家利用数学模型预测癌症进化方向和免疫治疗效果
但癌细胞也不是“吃素”的,癌细胞之所以厉害,就是因为它有“隐身”功能,因此,免疫治疗也并不是对所有的癌症患者都有效。盲目进行免疫治疗不仅成本巨大,还可能适得其反,所以预测癌症的进展和免疫治疗的有效性十分重要。 对此,一个英美研究团队建立了一个数学模型,可以确定免疫系统...