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专家访谈
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单细胞RNA测序助力分析！浙江大学刘夏/方维佳/冯新华发现可提高肝细胞癌患者免疫检查点阻断治疗疗效的联合免疫治疗策略
3月8日，浙江大学刘夏、方维佳、冯新华共同通讯在期刊《Journal of Experimental & Clinical Cancer Research》上在线发表题为“S100A9+CD14+ monocytes contribute to anti-PD-1 immunotherapy resistance in advanced hepatocellular car...
国家癌症中心学者领衔：单细胞RNA测序分析为肺癌的早期诊断和治疗提供新的见解
近日，中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院高树庚和赵亮团队联合在《Clinical and Translational Medicine》上发表题为“Single-cell RNA sequencing analysis reveals transcriptional heterogeneity of multiple primary lung cancer”的研究论文，研究显示了MPLC不...
【Nature子刊】清华大学团队：单细胞RNA测序用于胃癌研究的突破进展
胃癌（GC）包括许多分子亚型，是全球第五大最常见的恶性肿瘤，估计2018年有783，000人因为胃癌死亡。虽然GC在早期原发阶段是可治疗的，但大多数患者在晚期或转移阶段被发现，预后相对较差。免疫疗法，特别是靶向PD-1和CTLA4的抗体，已经引起了各种癌症类型（如黑色素瘤）治疗的范式转变，但GC的反应率相对较低。最近，清华大学研究团队发布于《Nature Communications》的文章...
【Cell子刊】首次绘制小细胞肺癌分子图谱，使用单细胞RNA测序揭示了推动肿瘤转移的幕后黑手——一种不寻常的细胞类型
想象一下，你将要进行一次越野旅行，在沿途的景点停下来欣赏当地的景点。您可能希望手边有道路地图册，包含不同比例尺的地图，涵盖主要公路和较小城镇的道路，或者至少有一个GPS，可以使用这些信息访问数字地图册。 直到最近，癌症研究人员还像越野旅行者一样，只拥有几个热门城市的几张地图。由于某些癌症的生长速度很快，地图很快就过时了。这种情况阻碍了医生了解肿瘤内部的真实情况和开发...
【Cell子刊】单细胞RNA测序揭示癌细胞对化学疗法的多种反应机制
在这项新的研究中，科学家利用单细胞RNA测序技术，首次展示了单个癌细胞群中的单个细胞对化疗造成的DNA损伤的不同反应。结果发现，这些细胞之所以具有不同的“命运”，实际上是因为它们具有完全不同的激活基因集，而这些不同的“转录组学格局”决定了化疗对DNA造成损伤后细胞的命运。 该研究由美国密歇根大学罗格尔癌症中心的李俊熙（Jun Hee...
【Cell】超2万个单细胞RNA测序，揭示靶向疗法诱导癌细胞进化
据美国国家癌症研究所（National cancer Institute）统计，肺癌在美国每年影响超过22.8万人，且这种癌症具有高度的异质性，并会产生耐药性变化，因此限制了个性化治疗的效果。近日，加利福尼亚大学旧金山分校（UCSF）的一个研究小组收集了转移性肺癌患者在靶向治疗前和治疗期间的样本，并进行单细胞RNA测序分析。 研究人...
【Nature子刊】史上最大单细胞RNA测序项目！首次发现胶质母细胞瘤干细胞，有望抑制所有的癌细胞
要想更深入地了解癌症是如何开始、发展和获得对治疗的抵抗力的，部分取决于对癌症干细胞生物学的更深入探索。胶质母细胞瘤是最常见的成人原发性脑癌，对胶质母细胞瘤的干细胞生物学的研究是有限的。最近，一项研究发现了一种源自单一癌细胞类型的癌细胞结构，这种结构可以用来减缓癌细胞的生长。 这项研究是迄今为止最大的单个癌细胞RNA测序项目，包括55...
Cell Stem Cell发表单细胞RNA测序新成果
寨卡病毒是一种新出现的蚊媒病毒。2015年5月，巴西开始出现寨卡病毒感染疫情，这种病毒随后在美洲快速蔓延。世界卫生组织称，越来越多的证据表明寨卡病毒与小头畸形之间存有关联。针对这种疾病，目前尚无特异性治疗办法或者疫苗。最佳预防方式是采取保护措施，避免蚊子叮咬。 三月四日，Johns Hopkins大学的宋红军（Hongjun S...
浙大80后教授发表单细胞RNA测序研究
基因表达变异是小鼠胚胎干细胞（ESC）的一个重要特征，但人们还不清楚这背后的具体原因。 浙江大学和哈佛大学的研究人员对小鼠胚胎干细胞进行了单细胞mRNA-seq分析。他们发现，这些细胞表现出的异质性是血清培养造成的。这项研究发表在一月二十一日的Cell Reports杂志上，文章的通讯作者是浙江大学80后教授郭国骥、哈佛大学的S...
单细胞RNA-seq发现调节干细胞发育的新基因
最近，Wellcome Genome Campus的一项新研究演示了单细胞基因组学的力量，揭示了它如何能帮助科学家了解细胞的早期发育。这项研究发现了参与干细胞调控网络的新基因，以及新的细胞亚群，可让我们深入了解干细胞多能性——成为几乎所有不同类型细胞的能力。研究人员还为干细胞群落开发了新的资源，这将有助于解释未来的调查。相关研究结果发表在最近的《Cell Stem Cell...
干细胞先驱：助力单细胞RNA-seq的统计法
以精确的定时模式表达的基因，被称为振荡基因，在细胞分裂、昼夜节律和肢体形成这样的发育功能中，起着重要的作用。但是，因为我们不能对基因表达进行定时的观察，因此，这些基因在很大程度上是未被发现的。 最近，美国Morgridge研究所和威斯康星-麦迪逊大学的科学家们开发出一种算法，提供了一种新的方法，来识别振荡基因的动力学，并首次确定了这些早期发育力量的作用。 ...
Cell：揭秘激活神经干细胞的信号
来自同济大学医学院、加州大学洛杉矶分校、南昌大学等处的研究人员报告称，他们利用单细胞RNA测序技术，同时运用加权基因共表达网络分析(WGCNA)，揭示出了激活休眠神经干细胞的信号。这一重要的研究结果发布在5月21日的《细胞》（Cell）杂志上。 同济大学医学院的李思光（Siguang Li）教授以及孙毅（Yi Eve Sun）教授是这篇论文的共同工作。李思光教...