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专家访谈
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《Science》：罕见遗传病诊断——转录组分析技术再下一城
近年来，随着测序技术的飞速发展，多组学分析技术在疾病的诊断中应用越来越广泛。然而，在罕见遗传病的检测中依然有诸多限制。近日，来自哥伦比亚大学的研究人员开发了一种等位基因表达失衡分析技术，能够通过分析两个等位基因的表达失衡来诊断罕见疾病。通过联合其它技术，其将在罕见遗传病的诊断和机理研究中发挥重要作用。 目前，可通过对人类外显子组和基因组参考数据库...
《转》访苏州大学秦樾教授：细胞核内转录因子无需太多的信号转导，就可以发挥强大作用
《转》访是转化医学网的品牌专访栏目，是业内专家、大佬、知名企业智慧交流碰撞的平台，也是促进行业健康发展的重要力量，《转》访致力于打造转化医学领域最知名的专家访谈栏目。肿瘤免疫以及肿瘤干细胞信号传导是肿瘤领域至关重要的研究对象。我们邀请了苏州大学秦樾教授来谈谈他对这一领域的一些看法及心得。聆听大咖观点！ 肿瘤免疫是转化医学领域的重点关注对象之一，您...
同志们注意！抗逆转录病毒治疗可预防艾滋病传播
艾滋病以潜伏时间长、感染后难以察觉、传染范围广及死亡率极高成为世界上最具破坏力的流行病之一，其肆意传播使人类生存和发展受到了严峻挑战。随着艾滋病病毒感染人数的增加，抗艾滋病药物的研究已成为世界重大课题之一。众所周知，性传播是艾滋病的重要传播途径，而其中男同性恋者特殊的性行为方式，使得他们感染艾滋病病毒的几率相比异性恋者更高。 ...
甲基化与lncRNA: 表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么？circRNA，lncRNA，外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外，现在很多小伙伴们开始了新的玩法，通过多平台联用，将不同层面的东西结合起来，比如，表观遗传与非编码RNA的结合，就是一个很好的例证。 研究背景 肺癌是一种常见的恶性肿瘤，特别在中国，由于环境的污染，肺癌的发生率也在持续升高。非小细胞肺癌（NSCLC）是肺癌中最常见的...
2016年Nature Methods年度技术：表观转录组分析
2016年12月29日，北京大学生命科学学院伊成器研究组应邀在《Nature Methods》杂志发表题为“Epitranscriptome sequencing technologies: decoding RNA modifications” 的综述论文（doi:10.1038/nmeth.4110）。 表观转录组学（epitranscriptomics，又称“RNA表观遗...
伯豪客户发表转录组测序新成果！
研究背景 FOXP3+调节性T细胞（Treg）具有免疫抑制作用，在维持自身免疫过程中具有重要作用。因此，对Treg细胞在体内的分子机制研究也具有重要意义。关于FOXP3+ Treg细胞稳定性的争论从最近的一些工作报道中也是愈演愈烈。在这些研究中，稳定Treg细胞在炎症反应以及成淋巴反应中具有T-effector-cell-like表型，并且发现FOXP3表达不稳定。稳定的Tre...
基因组研究再创佳绩，转录因子异常背锅小儿白血病
应用基因组测序技术、RNA测序技术、染色质免疫共沉淀测序技术等前沿手段，来自华盛顿大学附属美国圣裘迪儿童研究院儿童癌症基因组项目的研究人员完成了1900例儿童及成人急性B淋巴细胞白血病患者遗传信息的检测。他们发现这些白血病患者体内DUX4基因的多次重组与异构体的异常表达或删除引起的ERG功能缺失密切相关。该研究所对应的具体论文发表于最新上线的Nature Genetics杂志上，标题为“Der...
Science 两种转录因子指导免疫细胞在组织内驻留
在一项新的研究中，来自澳大利亚墨尔本大学等机构的研究人员发现负责在体内皮肤、肝脏、肾脏和肠道的入侵位点抵抗感染的基因。 这项研究是由来自澳大利亚沃尔特与伊丽莎-霍尔医学研究所(Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research)的Axel Kallies博士和Klaas van...
Nature Methods：突破性单细胞表观基因组与转录组分析新技术
由英国及比利时的研究人员开发出的一种新方法，使得在单细胞中同时研究表观基因组及转录组成为可能。发布在《自然方法》（Nature Methods）上的实验方案，可帮助科学家们精确描绘出DNA甲基化改变与基因表达之间的关系。 近年来单细胞测序技术发展迅速，被广泛用于研究细胞间的基因表达谱（转录组）差异。近期的一些单细胞实验方案也使得...
基因“转录漂移”或成衡量老龄化的新通用指标
相对于长生，不老似乎才是人们的终极追求。早在2007年，美国斯克里普斯研究所的团队就用抗抑郁药物米塞林延长了秀丽隐杆线虫的青春期，但其中的奥秘直到最近才被揭开。研究人员同时表示，别指望吃药也能让我们的青春期延长，要实现人类永葆青春的愿望还有很长的路要走，因为人类的进化程度与线虫相隔了上百万年之久。 据每日科学网报道，为了找出米塞林让秀...
黄岩谊、汤富酬组开发新的单细胞转录组测序法
北京大学生物动态光学成像中心（Biodynamic Optical Imaging Center, BIOPIC）是北京大学于2010年成立的一个跨学科合作实体研究中心。中心的目标是发展和利用最先进的生物成像与基因测序手段，在分子和细胞水平上进行生命科学与医学基础研究。中心配备了界一流的研究设备和条件，有重点地发展最新的生物成像和测序技术。 ...
刘新垣院士Cell携手华裔学者：转录因子的第二重作用
来自华盛顿州立大学和中科院的研究人员，发现了一种蛋白质在细胞分裂中从前未知的功能。众所周知，这一称作为ATF5的蛋白可以控制特异基因的表达频率。ATF5调控了控制细胞存活的一些基因。 现在研究小组发现，这一蛋白发挥了与它的转录因子角色无关的一种作用。在细胞的中心体（centrosome）中，ATF5还充当了结构蛋白。这一重要的研究发现发布在...
长期抗逆转录治疗可阻止艾滋病在异性间的传播
在2011年，HPTN052研究的研究人员也报告了一个突破：当免疫系统相对健康的时候，即HIV早期开始治疗，能够减病毒在未来18个月内传染给未感染的伴侣的风险，即减少96%的患病可能。基于从2011年收集的另外的数据，今天发表的发现证明了，在抗逆转录病毒疗法控制下的HIV能够持久的大大减少HIV的性传播。 “现在这项研究非常清楚，当HIV感染者开始进行抗逆转录病毒治疗，并保持对病毒的抑制...
张亚平院士JMCB获人类大脑转录组进化研究进展
人类在进化过程中，脑的大小和复杂程度得到了极大得增加。脑的结构使得人类有着区别于其他物种的极高的认知能力，比如语言能力、抽象思考能力等等。转录后修饰，如RNA编辑、可变剪切等能够由相同的DNA序列生成不同的RNA，进而翻译成不同的蛋白质构体，是扩大蛋白质多样性的重要机制。随着二代测序发展，转录后修饰等已成为当今研究热点。 ...
Science首次报道逆转录病毒壳体蛋白结构
最近，乌拉圭巴斯德研究所的研究人员，与乌拉圭医学院合作，第一次获得了牛白血病病毒（BLV）衣壳蛋白的高分辨率晶体结构。他们获得的晶体结构显示出此蛋白前所未有的的灵活性，这是传染性颗粒装配的关键。这些研究结果，发表在六月四日的《Science》杂志，是了解逆转录病毒生物学的一个重要进步，为抗逆转录病毒疗法的开发，开辟了新的途径。 牛白血病病毒...
Cell子刊：二胎妈妈更易哺乳孩子
报道：坊间传闻，二胎妈妈要比第一次生宝宝的妈妈更容易分泌乳汁，这是真的吗？一组来自冷泉港实验室的研究人员证明了这一点，并指出了其中的分子机制。这一研究成果公布在5月13日的Cell Reports杂志上。 这一研究结果表明乳腺能形成怀孕长期记忆，从而影响了其激素变化，这种记忆会贯穿生物机体整个生育年龄。 人体在怀孕期间会发生许多...
赛默飞获CE-IVD认证 将开发出Oncomine实体瘤融合转录试剂盒
近日，赛默飞世尔科技 (Thermo Fisher Scientific)获得CE-IVD认证标志，这标志着其将开发出基于新一代测序技术的Oncomine实体瘤融合转录试剂盒，这种试剂盒是利用Ion Ampliseq测序技术来检测包括ALK，ROS-1， RET，和NTRK1基因在内的一系列基因重排情况，而目前OncoNetwork联盟的研究者正在同T...
Nature子刊：部分SNPs的转录调控亚型与疾病相关
国立卫生研究院和哈佛医学院的研究人员使用基因芯片来分析血液样本中的基因表达和SNP基因分型模式，这些样本是从招募参与Framingham心脏研究的个体中获得的，研究人员拿出了一组剪接数量性状位点的候选组，这其中包括了所谓反sQTLs，这个往往出现在他们调节的转录附近。 通过与美国国家人类基因组研究所的GWAS目录下的SNPs的数据进行对比，研究人员发现几百个sQTLs与人类性状或者疾病中...
转录组学方介导的多效调控蛋白 SprA 作用机制研究
Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期，浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了 题 为 “Transcriptome-guided identification of SprA as a pleiotropic regulator in Streptom...
Nat Med：特殊转录因子FoxO1的缺失或可诱发肺动脉高血压
肺动脉高血压的特点是血管壁中的细胞分裂失控，从而使得血管增厚，近日，发表在Nature Medicine上的一篇研究论文中，来自马克斯普朗克研究所的研究人员发现，转录因子FoxO1可以调节细胞的分裂，而且在肺动脉高血压的发病过程中扮演着重要角色。 研究人员表示，或许可以通过激活FoxO1来治疗肺动脉高血压，这为开发治...