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专家访谈
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新品首发｜VITA GutMicrobiome：解锁肠道菌群的单细菌转录组
2022年3月，我们发布了全球首个高通量单细菌RNA测序技术MscRNA Seq（收录于M20 Seq）和VITApilote高通量单细菌转录组试剂盒，推动微生物研究迈入了单细菌转录组时代。 然而，当今微生物的科学研究正在快速驶向复杂度和精准度更高的未知领域。为应对新的科学问题对技术带来的挑战，帮助研究人员对肠道微生物组进行更为深入的研究，我们正式推出VITA单细胞测序产品家族的...
【新品发布】 鲲羽生物原位检测新品三连发，助力空间转录组和蛋白组研究
鲲羽生物立足基因原位测序（in situ sequencing）和原位杂交(in situ hybridization)技术的研发和应用。核心成员从事相关研究20年，拥有本细分领域国际一流的核心技术和知识产权。作为少数从事基因原位检测的研发型公司，鲲羽生物以解码生命空间奥秘、革新临床精准诊断为目标，结合基础科研和临床发展实际需要，重视研发不断拓新，在前期快速DNA FISH试剂盒/RNA FISH...
重大突破！南京大学发现胰腺癌肝转移单细胞转录组学景观 助力开发治疗新策略
近日，南京大学研究团队在国际权威杂志《Nature Communications》上发表了题为“Single cell transcriptomic analyses implicate an immunosuppressive tumor microenvironment in pancreatic cancer liver metastasis”的研究论文，本研究中，研究人员展示了同步切...
倒计时7天 | 百创智造S系列空间转录组细胞分割产品发布会
6月28日，百创智造，在青岛举办“百创智造S系列空间转录组细胞分割产品发布会”。届时，多位生命科学领域专家、学者将齐聚一堂，分享和交流单细胞级空间组学、精准时空组学研究的应用及前沿进展。 同时在发布会上也将揭晓百创智造是如何创新性的将原片H&E，原片荧光，原片测序结合在一起，来实现单细胞的分割。 会议议程 公...
未发先火！美国国家癌症研究所首试Duomic技术——转录组+蛋白组“一步”到位
单细胞测序数据，鱼也； 单细胞功能蛋白组学数据，熊掌也。 鱼与熊掌能否兼得呢？ 请注意这里的兼得不是指用同一批细胞中的一部分去测序，另一部分进行蛋白组学研究，而是同时得到同一个细胞中的单细胞水平的蛋白组层面和核酸层面的数据。要想做到这一点需要依靠Phenomex公司旗下品牌IsoPlexis推出的Duomic平台解决方案...
【研究前沿】单细胞转录组揭示浸润型基底细胞癌免疫微环境及其特异靶标MDK通路关键功能
基底细胞癌是全世界最常见的皮肤癌，常常发生在面部，对患者的外貌造成损害。浸润型基底细胞癌（Infiltrative basal cell carcinoma, iBCC）是一种具有高侵袭性的基底细胞癌亚型，往往出现破坏性生长和对周围组织的侵犯。尽管手术切除是大多数患者的首选治疗，但是由部分患者存在术后复发风险，尚存在不能完全手术切除iBCC，因此临床上急需开发有效内科治疗方案。所以需要对iB...
【研究前沿】重庆大学附属三峡医院印明柱教授团队发表基于图深度学习的空间转录组空间域识别框架
【转化医学网报道】单细胞测序和空间转录组学是前沿的生命科学技术，有助于推动基因组学科技创新，提高我国在生命科学领域的科研水平和竞争力。基于人工智能的空间转录组学数据分析有利于探究组织的生理状态和疾病机制、识别细胞转录因子和基因调控网络、揭示细胞亚型的异质性和多样性、发现潜在的治疗靶点，为研究疾病诊断、预防和治疗提供重要的基础数据和科学依据。 ...
重磅发布！北京大学周永胜、汤富酬、乔杰合作对人胚胎骨髓间充质干细胞进行单细胞转录组和功能分析
3月31日，北京大学周永胜、汤富酬及乔杰在《Signal Transduction and Targeted Therapy》在线发表题为“Characterization of mesenchymal stem cells in human fetal bone marrow by single-cell transcriptomic and functional analysis”的研究...
权威认证:上海欧易通过全国科研与临床实验室转录组测序检测室间质量评价
近日，国家卫生健康委临床检验中心（NCCL）公布了首次《全国科研与临床实验室转录组测序检测室间质量评价预研活动》的评价统计结果，上海欧易实验室顺利通过此次测评！此次测评结果肯定了上海欧易在转录组建库技术、生物信息分析和数据解读方面的能力。 图1 上海欧易通过转录组室间质评 转录组测序（transcriptome sequencing...
【Cell】麻省理工张锋研究：全面绘制人类所有转录因子图谱，让细胞命运调控变得可预测
近日，美国麻省理工学院张锋研究组在Cell发表了文章，创建了一个包括人类所有转录因子不同剪接形式在内的条形码库，以单细胞分辨率绘制了每个转录因子在人体胚胎干细胞中过表达的表达谱。该图谱涵盖了所有三个胚层和滋养层细胞类型生成的转录因子，并且通过开发预测与验证平台可以检测不同转录因子组合的影响。 https://www.cell.com/cell/fulltext/S0...
【Nature子刊】汤富酬/王洁团队通过单细胞转录组谱揭示了小细胞肺癌的肿瘤异质性
10月5日，北京大学生命科学学院汤富酬教授团队与中国医学科学院王洁教授团队在Signal Transduction and Targeted Therapy上联合发表了题为“Single-cell transcriptomic profiling reveals the tumor heterogeneity of small-cell lung cancer”的研究论文。该研究对原发性肿瘤（PT...
【Nature子刊】复旦/交大团队系统表征癌症转录组，促进抗癌药物发现！
2022年11月10日，上海交通大学李胜利、Liu Teng团队与复旦大学何祥火团队在Nature Communications上发表了题为“Systematic characterization of cancer transcriptome at transcript resolution”的研究论文。该研究大大扩展了癌症RNA库，并将促进抗癌药物的发现。 https://doi.org...
一年发布21篇！北大汤富酬教授团队2022年单细胞转录组测序研究综述
2022年（截止到2022年12月1日）北京大学汤富酬团队在单细胞转录组测序领域取得了一系列重大突破，共发布研究成果21项，本文对以下九项研究进行系统综述。 01 2022年1月25日，暨南大学兰雨，刘兵及北京大学汤富酬共同通讯在《Cell Research》在线发表了研究论文，研究人员在小鼠和人类胚胎中发生关键血管生成和血管生成事件的时间窗口...
【PNAS】“复旦四分型”再完善！邵志敏教授团队绘制最毒乳腺癌“肿瘤特异性转录本”图谱
RNA是细胞传递基因信息的重要“信使”，一旦细胞发生癌变，便很有可能产生异于常态的RNA，即“肿瘤特异性转录本”。近日，复旦大学附属肿瘤医院邵志敏教授、江一舟教授团队携手黄胜林教授团队，发现在三阴性乳腺癌的细胞中存在大量“肿瘤特异性转录本”，并据此成功绘制出目前世界首个三阴性乳腺癌“肿瘤特异性转录本”图谱。该项研究成果11月8日在线发表于国际权威期刊《Proceedings of the N...
【Nature子刊】浙江大学范骁辉教授团队报道首个可将传统转录组测序数据重构至单细胞空间分辨率的方法
2022年10月30日，浙江大学药学院范骁辉教授团队联合计算机科学与技术学院陈华钧教授团队和军事医学科学院高月教授团队在《Nature Communications》上发表了研究论文。研究提出了一种空间解卷积算法—Bulk2Space，首次实现将Bulk转录组重构至单细胞空间分辨率。 https://www.nature.com/articles/s41467-02...
【Science】西湖大学朱听课题组历经六年终实现“镜像”T7转录，或可用于诊断治疗等领域！
2022年10月27日，清华大学/西湖大学朱听团队在《Science》在线发表了研究论文，该研究用化学方法合成了一个100千尔顿的镜像T7 RNA聚合酶，使酶组装的长镜像基因的全长镜像5S、16S和23S核糖体RNA能够高效、忠实地转录。 https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm0646 过往研究回顾...
【今日直播】基于纳米孔测序平台的单细胞全长转录组——应用和实践
对单个细胞进行基因组和转录组异质性分析为许多研究领域（包括癌症研究、细胞发育和功能以及免疫学）提供了新见解。但使用传统的短读长测序技术时，单细胞测定存在局限性；例如，在转录组研究中，无法在异构体方面确定转录本丰度。长读长纳米孔测序解决了这些挑战，可以在单条读长中对全长转录本和大基因组区域进行端到端的测序，并覆盖重复区域和结构变异。 12月1日，我们邀请...
【PNAS】清华陈默课题组：白血病关键转录复合物的组成机制及治疗新靶点
尽管多个证据表明LYL1在急性髓系白血病中的生物学重要性，但LYL1如何与AE协同调控基因表达并不清楚。清华大学医学院陈默研究员课题组发现LYL1在AETFC的组装和转录激活功能实现中具有重要作用。该团队研究成果发表于《Proceedings of the National Academy of Sciences》。 https://www.pnas.org/doi...
连发四篇，IF值累计超200！复旦徐彦辉团队在人源转录起始机制研究方面取得重大突破
自2020年起，复旦大学附属肿瘤医院徐彦辉团队连续发表四篇研究论文，围绕人源转录起始机制研究取得了系列重要突破，部分成果入选2021年度中国生命科学十大进展。 人源BAF-核小体 2020年1月31日，徐彦辉课题组题在《Science》杂志在线发表了题为“Structure of Nucleosome-bound human BAF Complex”的研究论文。报...
限量样品免费申请！Meridian全新可冻干热稳定逆转录酶！
PCR反应中当检测靶标为RNA时，首先使用逆转录酶将RNA逆转录为cDNA，再通过DNA聚合酶的作用进行PCR扩增。常见的逆转录酶是莫洛尼鼠白血病病毒逆转录酶(MMLV-RT),它不耐高温，只能在相对较低的温度(~50°C)下维持其酶活性。但是在cDNA合成的步骤当中，较高的逆转录温度对于降低RNA二级结构对逆转录的抑制作用和减少非特异引物结合是有益处的。 ...