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【NUCLEIC ACIDS RES】编辑效率91%!苔藓RNA编辑因子识别900个人类转录组脱靶点
苔藓RNA编辑因子 在活细胞中,存在着许许多多的信息流(traffic),如同置身与一个大型施工现场。在陆地植物中,DNA形式的蓝图不仅储存于细胞核中,还存在于线粒体(细胞的发电厂)和叶绿体(光合作用单元)之中。这些蓝图指导着蛋白质的构建,进而支持生命体的代谢过程。然而,蓝图信息是如何在线粒体和叶绿体中传递的呢?——通过创建蓝图的转录本(RNA)来实现。转录本(RNA)随...
【Nature子刊】转录共激活因子TAZ:改善细胞衰老引起的功能下降
研究人员在连接PU.1和Hippo途径共激活剂TAZ的oHSCs中发现了一条途径。了解其在HSCs衰老中的失调可能有助于开发干预治疗策略,从而改善老年人群的免疫功能。该研究发布于《Nature Communications》。 https://www.nature.com/articles/s41467-022-32970-1 造血干细胞功能逐渐丧失 ...
【Nature子刊】清华携手中山:单细胞转录组和翻译组双组学揭示了人类卵母细胞成熟的潜在机制
8月31日,由清华大学和中山大学科学家联手合作进行的研究论文“Single-cell transcriptome and translatome dual-omics reveals potential mechanisms of human oocyte maturation”发表在国际期刊《Nature Communications》上,通过单细胞多组学研究和干细胞体外分化试验为研究人类...
【Nature】突破时间维度!对“活”的单细胞进行转录组学动态测序
解决破坏性采样局限性 与其在后续时间内的分子及表型行为相联系——即在离散的时间点内监测某一个细胞数千个基因的活性。由于此特点,研究者也称此技术为“时间性转录组学分析”。 近年来,已开发了几种细胞分析方法来试图解决破坏性采样局限性。这些方法大致可分为两类:一类是纯计算方法:通过将相似的细胞状态连接到连续的轨迹中,或通过模拟mRNA剪接动力学,在快照(...
【柳叶刀子刊】复旦大学团队通过转录组分析探索阿尔兹海默病生物标记物!
主观或客观的潜微认知能力下降被认为是阿尔茨海默病(AD)的临床前表现,阿尔茨海默病是 预防或延缓疾病进展的潜在关键窗口。而先前的研究大多数侧重于识别阿尔茨海默病(AD)或轻度认知障碍的表达变化,但是缺乏关于临床前 AD 的转录组学分析和生物标志物的系统性研究。复旦大学团队的研究结果为病毒感染假说提供了支持,并为临床前AD提供了候选进展生物标志物。该研究发布于《eBioMedicine》。...
【即将开播】空间转录组学技术及算法在线研讨会,7月16日下午两点,大咖云集,欢迎收看!
会议背景 空间转录组学是2020年Nature methods评选的年度方法,是当前单细胞组学研究领域的新方向,在肿瘤学、病理学、免疫学、发育生物学等诸多临床领域具有广泛的应用前景。 近年来,研究者开发了多种空间转录组技术,可以在保留组织空间位置的同时获得基因表达特征、表观调控等组学信息,在传统测序技术的基础上增加了空间信息维度,使得研究者可以从更精细的...
【直播预告】空间转录组学技术及算法在线研讨会,7月16日下午两点,欢迎收看!
会议背景 空间转录组学是2020年Nature methods评选的年度方法,是当前单细胞组学研究领域的新方向,在肿瘤学、病理学、免疫学、发育生物学等诸多临床领域具有广泛的应用前景。 近年来,研究者开发了多种空间转录组技术,可以在保留组织空间位置的同时获得基因表达特征、表观调控等组学信息,在传统测序技术的基础上增加了空间信息维度,使得研究者可以从更...
【科技前沿】百迈客发布国内首款亚细胞级微孔空间转录组芯片!
伴随着单细胞技术的发展,分析工具的拓展使得空间分析在过去一两年逐渐发展成为一个新的科研领域。空间转录组学技术更是先后在2020、2022年被《Nature》、《Nature Method》评为 “年度技术”,其相关技术呈指数级增长。它不仅可以提供研究对象的转录组等数据信息,同时还能定位其在组织中的空间位置。这对于癌症发病机制、神经科学、发育生物学等众多领域的研究都有重要意义。 ...
【Cell子刊】研究人员成功绘制了弥漫性大B细胞淋巴瘤的单细胞转录组图谱,有助于HBV阳性B细胞淋巴瘤患者的治疗
卡罗林斯卡医学院(Karolinska Institute)的生命科学和营养研究人员,共同通讯作者Qiang Pan-Hammarström指出:“我们发现了恶性细胞与良性细胞的发展轨迹,恶性细胞和肿瘤浸润细胞之间的相互作用,我们还发现慢性病毒感染的影响可以进一步解释DLBCL的疾病异质性。对恶性细胞亚群的体细胞突变谱和药物反应进行深入研究,可以为疾病机制和治疗策略提供其他视角。” ...
【推荐】如何选择合适的逆转录酶来提高逆转录效率和灵敏度?
01逆转录酶活性 逆转录酶主要包括以下三种活性: ①逆转录活性:以RNA为模板,催化dNTP聚合,生成DNA-RNA杂合双链。 ②RNase H活性:水解杂合双链中的RNA,得到与RNA互补的DNA单链(cDNA)。 ③DNA指导的DNA聚合酶活性:以cDNA单链为模板,以dNTP为底物,再合成双链DNA。 02逆转录酶种类 目...
【Nature子刊】利用空间转录组学技术,创建结肠基因图谱——获得肠道疾病新见解!
卡罗林斯卡医学院的研究人员利用一种名为空间转录组学的技术,分析了小鼠结肠中的基因表达,并创建了一个图谱,显示组织中单个基因的表达位置。当他们将之前已知的人类转录数据叠加到图谱上时,研究人员获得了对炎症性肠病(IBD)的新见解。相关研究发表在《Nature Communications》杂志上,题为“The spatial transcriptomic landscape of the hea...
限量样品免费申请!Meridian全新可冻干+热稳定逆转录酶!
PCR反应中当检测靶标为RNA时,首先使用逆转录酶将RNA逆转录为cDNA,再通过DNA聚合酶的作用进行PCR扩增。 常见的逆转录酶是莫洛尼鼠白血病病毒逆转录酶(MMLV-RT),它不耐高温,只能在相对较低的温度(~50°C)下维持其酶活性。但是在cDNA合成的步骤当中,较高的逆转录温度对于降低RNA二级结构对逆转录的抑制作用和减少非特异引物结合是有益处的。 迈迪安...
【快讯】菲沙基因&曙光智算强强联合丨精品单细胞转录组线下培训班重磅开启!
“ 曙光智算 ” 曙光智算信息技术有限公司是中科曙光的全资子公司,公司目前运营全国十余家计算中心,已建成算力资源、存储资源、网络资源及先进计算增值服务一体的统一服务平台。曙光智算发挥曙光在计算领域近30年的技术积累及技术优势提供端到端全栈算力生产、交付与应用支持服务,助力产业升级、科研创新、政务服务和信息技术应用创新。以及丰富的全国产及通用计算资源和异构加速资源,助力产...
博奥晶典携手NanoString、Illumina共同开启空间全转录组神经科学创新大赛 — 现已正式接受报名!
神经退行性病变、神经炎症、传染性疾病和神经创伤都能对中枢神经系统(CNS)造成毁灭性影响,影响认知功能、行为、心理健康等。因此,深入了解中枢神经细胞(如神经元细胞、星形胶质细胞、胶质细胞和少突胶质细胞)的功能作用,以及阿尔兹海默症、帕金森症、额颞叶痴呆(FTD)、肌萎缩性侧索硬化症(ALS)和多发性硬化(MS)等疾病的通路,对于神经类疾病的预防、诊断和治疗至关重要。然而众所周知,难以获得病变...
【Nature】重磅!人造卵细胞成为现实——使用转录因子重建卵母细胞转录网络
对于自然生命来说,繁育后代是其一生中极其重要的使命。然而,在现代社会,随着生活压力的不断增大以及环境污染的日益加剧,世界各国的不孕不育率都呈现出飙升之势,很多夫妻都饱受不孕不育的困扰。 据统计,我国有超过5000万不育不孕患者,超过正常育龄人口的10%,这一数字超乎我们的想象。 &e...
【Nature子刊】迄今最详细人类心脏单细胞转录组图谱,揭示心脏细胞异质性,助力精准医疗
为了深入了解心血管疾病的机制和治疗策略,洞悉人类健康心脏的分子组成,一个跨国研究小组绘制了人类心脏六个区域的近五十万个细胞的单细胞转录组图谱。这是迄今为止最详细的人心脏单细胞转录组图谱,揭示了心脏各区域细胞的异质性,为将来的心脏病研究和治疗提供依据。 该研究由哈佛医学院、剑...
会议邀请-国际大咖与您云相聚于空间转录组学国际峰会
今年5月中举行的“科研无疆,发现无限-国际癌症大会“受到了广大老师同学的热烈欢迎,全球范围内共有多达5000名参会者共聚该盛会。随着空间生物学,特别是空间转录组学在肿瘤,发育生物学以及新冠病毒中的进一步应用,关于该领域的开发也在最近迎来更多突破。为了更好地与广大研究人员分享这些最新最燃的研究结果,15位来自哈佛大学,麻省理工学院,康奈尔大学,台湾国立阳明大学的国际大咖...
【Nature子刊】中科院利用单细胞转录组学研究,揭示了前列腺癌的细胞类型
2009年,汤富酬等人首次报道了单细胞RNA测序技术。最近的一项研究中,中科院的研究人员利用基于液滴的单细胞RNA测序技术,发现了一种新的前列腺祖细胞类型,在某些情况下可能会促使前列腺癌的发生。 该研究由中国科学院的科学家领导,并于8月17日发表在《自然遗传学》杂志上,题为“Single-cell transcriptomics i...
【研究】韩国研究人员绘制了SARS-CoV-2转录组结构图
研究人员表示,他们使用了两种互补的测序技术来绘制SARS-CoV-2转录组和表位转录组的高分辨率图。他们发现,Illumina和MGI平台等合成测序(SBS)方法具有较高的准确性和覆盖率,但读取长度短。他们补充说,尽管基于纳米孔的直接RNA测序(DRS)的测序准确性受到限制,但它可以进行长读测序,这对于分析长嵌套CoV转录本特别有用。而且,由于DRS可以检测RNA而不是cD...