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专家访谈
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miRNA测序在非编码RNA研究中的应用案例
研究背景 雷特氏综合征（Rett syndrome）是一种严重影响儿童精神运动发育的神经发育性疾病。甲基化-CpG结合蛋白2（MeCP2）基因功能的缺失会导致该病的发生[1,2]。反之，MeCP2基因拷贝数的增多则会导致自闭症（Autism spectrum disorders）的产生[3]。因此，可以说MeCP2蛋白的剂量效应对中枢神经系统（Central ner...
lncRNA测序在非编码RNA研究中的应用案例
在过去几年中，高通量转录组测序（High-throughput transcriptome sequencing）最大的发现之一莫过于在哺乳动物基因组中发现了一些功能各不相同的RNA[1]。除去那些由于转录起始位点（Transcriptional start sites）的改变以及终止子（Ternination）和可变剪切（Splicing）的变化之外，另一些新的反向...
华人学者Cancer Cell：首张人类癌症非编码RNA综合图谱
随着对重要但知之甚少的基因组部分——“DNA暗物质”的认识日渐增加，从根本上改变了科学家们研究疾病的方式。人类基因组中包含有大约2万个蛋白质编码基因（占总数的不到2%），而70%的基因组被转录为非编码RNA（延伸阅读：Cell惊人发现：谁说非编码RNA不编码？ ）。但当前仍尚未系统地调查过这些称作为长链非编码RNAs (lncRNAs)的片段以及它们发...
SeqCap RNA探针组非编码RNA，融合基因都能捕获啦！
转录组测序(RNA-Seq)是了解一个物种或特定细胞在某一功能状态下所有基因表达的直接做法，但是mRNA-Seq往往需要进行rRNA去除或者polyA尾富集实验步骤；目前最热门的lncRNA-Seq则往往需要超过10Gb以上的测序量；全转录组中还有大量未知功能的RNA值得探索和研究。NimbleGen于201...
Cell惊人发现：谁说非编码RNA不编码？
来自德克萨斯大学西南医学中心的Eric Olson和同事们在分析梳理肌肉特异性的长链非编码RNAs(lncRNAs)以了解它们的功能时，发现了一种在骨骼肌中特异性表达的lncRNA。尽管这一RNA以往被归类为是非编码RNA，它的序列中包含的一小段却看上去好像一个编码区域。这一研究发现发布在《细胞》（Cell）杂志上。 微肽 l...
出人意料的非编码RNA调控
为了将六英尺多的DNA塞进细胞核里，细胞将基因组紧紧缠绕在组蛋白核心上形成核小体，并最终将其包装成紧密的染色质。DNA转录的时候需要打开核小体，而胚胎干细胞的染色质重塑复合体esBAF可以做到这一点。它不仅会打开需要转录的DNA，还暴露了促进转录的启动子和增强子。 基因组测序研究最近显示，增强子区域不仅能促进蛋白编码基因的转录，还包含有非...
第二军医大学Hepatology解析癌症中的非编码RNA
来自第二军医大学、复旦大学和中科院的研究人员发现，一种叫做DANCR的长链非编码RNA通过解除对CTNNB1的抑制增强了肝癌的干性特征。该研究成果刊登在国际权威杂志Hepatology（影响因子11.665）。 第二军医大学的周伟平（Wei-Ping Zhou）教授、孙树汉（Shuhan Sun）教授和复旦大学生物医学研究院的刘雷（Lei ...
从心脏病到癌症—长非编码RNA到底发挥了什么作用？
直到近几年才发现人类基因的70%是非编码RNA，非编码RNA不能翻译为蛋白质，但仍在人体中发挥重要作用。Stefanie Dimmeler是首批发现一个microRNA亚群在血管再生中发挥重要作用的研究人员之一，她最近获得了欧洲研究委员会（ERC）的ERC高级研究员资助，这使她能够对另一群非编码RNA进行相关研究。Stefanie Dimmeler相信这一群非编码RN...
非编码RNAs的新角色
我们机体中大约70%的基因都可以为生物活性分子提供一定的蓝图，而如今研究人员通过解析一种名为非编码的RNAs就可以帮助阐明生物活性分子的功能了，非编码的RNAs并不会翻译成为蛋白质，其似乎在机体中行使着控制的作用。 研究者Stefanie Dimmeler是第一批证明micro-RNAs亚群在血管再生过程中扮演重...
PNAS：新研究扩大了人类microRNA的数量
在公共数据库中，人类基因组产生microRNA的位置大约有1900处，而Thomas Jefferson大学的最新研究表明，这个数字将会是更加庞大的。 结果还表明，这些新的位点中，很多都是具有人类和组织特异性的，这将对疾病中miRNA的作用研究产生巨大的影响。 自从二十年前第一次发现miRNA...
Nature：瞄准miRNA的抗癌火箭炮
自从发现microRNAs(miRNAs)在控制人类疾病中扮演着关键的角色以来，人们一直希望能够将这些短片段的非编码RNA分子转化为癌症的一种治疗策略。但由于大量的生理和细胞屏障阻止了以miRNA为基础的疗法真正触及肿瘤细胞，大大阻碍了这一有前景的应用。 现在科学家们发现了一种新型的传送平台，利用肿瘤微环境的独特特性其可以让类似于miRNA镜像的反义分子进入到癌细胞中。这些研究结...
J TRANSL MED：miR-200c与膀胱癌
miR-200c是一种比较短小的非编码RNA，在肿瘤发生和肿瘤进展中起着非常重要的作用，而且在上皮肿瘤细胞间质化（EMT）也起着重要的调节作用，间质化的肿瘤细胞能够加速肿瘤的进展和转移。然而，miR-200c在膀胱癌细胞的角色以及作用机理目前研究得并不是很多，本研究的目的就是确定miR-200c在调节EMT过程中扮演的角色，并弄清楚miR-200c是如何促发膀胱肿瘤细胞侵袭...
第三届长链非编码RNA高端研讨会圆满结束
2014年5月22日，由中国科学院生物物理研究所和生物芯片北京国家工程研究中心联合主办，北京博奥晶典生物技术有限公司承办的第三届长链非编码RNA高端研讨会在北京稻香湖景酒店顺利召开。会议以“长链非编码RNA在重要生物学过程中的功能与作用机制研究”为主题，开展学术研讨。会议当天吸引了近150位的参会人员，包括中国医学科学院肿瘤研究所/基础医学研究所、北大医院系统、阜外医院、协和、北京蛋白质组...