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最新:RNA-seq数据分析指南
新一代测序技术在爆炸式发展的同时,也衍生出许多其他技术创新。RNA深度测序(RNA-Seq)就是其中之一,这项技术使我们对细胞发育及其调控机制的理解,达到了前所未有的深度和广度。尽管研究细胞RNA并不是什么新鲜事,但RNA-Seq的出现大大拓展了转录组研究的规模,取得了累累硕果,这些是传统技术难以企及的。 RNA-seq可以获得相当惊人的数据量,而这恰恰是一柄双刃剑。...
引进Sequel测序平台,未来组继续领跑三代测序服务市场
武汉未来组今天正式宣布引进最新的美国三代测序平台Sequel,借助于独家开发的基于“天河二号”平台的三代测序基因组组装流程,未来组即将提供“一周一个动植物基因组”的特色服务。 2016年1月21日,中国首家三代测序服务公司武汉未来组与美国PacBio公司在中国的独家代理商基因公司顺利签约引进了Sequel测序仪。根据协...
元码基因宣布采购30台MiniSeq测序仪,助力共建 “联合精准医学中心”
在刚刚结束的JP摩根大会上,Illumina公司发布了新的MiniSeq测序仪,MiniSeq测序仪是桌面式高通量测序系统,集成了簇生成、测序和数据分析功能,操作简单,只需将所需试剂封装在一个盒子里,并进行用量设置,即可保证上百样品灵活高效的测序。MiniSeq测序仪可以远程监控运行,一天之内可以得到结果,内置的数据分析功能可以提供传输、保存、分析和分享...
展望NGS的下一个突破点,RNA-Seq和线粒体测序上榜
如今NGS已能够快速经济地阅读数亿个reads,所及之处远超越基因组学(如RNA测序使转录组学发生革命性变化)。尽管NGS取得了诸多进步,但依然存在一些重大的挑战。日前,牛津大学举办的“NGS七周年大会”聚焦了NGS面临的挑战,此次会议阐述了NGS领域最令人生畏的障碍,同时也阐述了跨越这些障碍的技术。 本次会议中提及的NGS...
我们来啦 | BGISEQ-500即将接受预订!
两个月前,在第十届国际基因组学大会上,华大基因自主研发的首台桌面型、高通量、一站式、开放性的基因测序仪BGISEQ-500华丽亮相,在行业内外引起轰动。 华大基因也在发布会上承诺 将于12月25日开始接受预订 &em...
《转》访Celsee 诊断公司CSO王一心:荣膺美国2015 Scientist年度十大创新产品背后的故事
2015年12月底,The Scientist重磅推出了2015年度十大创新产品排行榜。其中有3款测序仪上榜,包括Illumina的MiSeq,10X Genomics,Thermo Fisher的 Ion S5 & Ion S5 XL ,说明 2015年是测序和基因组编辑产品技术是突飞猛进,屡获突破的一年! 在这个榜...
《转》访林平博士: “抓得着”与“看得见”的CTC检测技术
2004年CellSearch CTC检测技术被FDA认证后,CTC研究与临床检测应用进展迅猛,并涌现出各种检测技术。SE-iFISH是CTC检测技术的后起之秀。它能够从病人或肿瘤动物模型内的体液标本中有效富集各种肿瘤细胞,并对获得的CTC同步进行原位染色体及肿瘤标示物的检测,从而极大地提高了CTC检测技术在不同肿瘤间的通用性、敏感性及特异性。转化医学网对循环肿瘤细胞 (Cir...
GSK、Avalon再携手 1000万美元投资Iron Horse
随着生物医药产业的蓬勃发展。越来越多的小型生物医药公司展现出了惊人的创造力,这些小型生物医药公司的产品线极大丰富了生物医药研发市场。而这也是生物医药产业巨头乐见其成的情况。包括罗氏、阿斯利康等医药巨头在内的许多大型医药公司都会入股一些有潜力的新型生物医药公司以期掘出金矿。 最近,英国制药巨头葛兰素史克公司就联手著名投资公司Avalon Ventures投资了Ir...
耶鲁大学的第二个ResearchKit app研究和预防流产
该研究由生殖和胎盘研究部主任Harvy J Kliman博士主持,其提出孕晚期流产和小胎盘相关。他补充说胎盘生长和胎儿生长一样都能用超声监测。 入选研究的女性被要求在进行超声检查后,利用app几率胎盘的宽度、高度和厚度来追踪评估胎盘容积(EPV)。当孕期结束时,受试者利用app记录妊娠结局。 Kliman的目的是用该研究的数据来检测是否EPV能够影像妊娠结局。如果研...
Sequenom和科罗拉多大学医学院将评估液体活检技术
Sequenom近日宣布,其将和丹佛科罗拉多大学医学院合作,以前研究该公在黑色素瘤患者身上使用的液体活检检验技术。 作为合作的一部分,合作伙伴们将评估Sequenom的技术,能够通过循环的肿瘤DNA文本来监测黑色素瘤患者的治疗反应和复发情况。 Sequenom的CMO Daniel Grosu补充道,该研究是该公司第一次将关注点集中在黑色素瘤上,这将扩...
Sequenom同加州大学合作评估新型液体活检技术
近日,Sequenom公司宣布,他们将同加州大学合作来调查其公司的液体活检分析技术在黑色素瘤患者中的应用。 作为合作的一部分,合作者将评估Sequenom公司的技术来帮助确定是否循环肿瘤DNA的特性分析可以用于监测黑色素瘤患者对疗法的反应及复发率。 Sequenom公司首席营销官Daniel Grosu指出,这项合作研究是公司首个关注黑色素瘤的研究,其或将扩张癌...
Sequenom同汉堡-埃彭多夫医学中心合作开发结直肠癌液体活检新技术
今天,Sequenom公司宣布,他们将同汉堡-埃彭多夫医学中心(University Medical Center Hamburg-Eppendorf,UKE)进行合作来评估液体活检技术在结直肠癌诊断治疗中的临床效用。 目前Sequenom公司正在开发一种循环肿瘤DNA的检测技术,最初的目的在于对不易获得或风险性较高的组织样本中的晚期非血液性的恶性肿瘤进行检测并且进行...
单细胞RNA-seq发现调节干细胞发育的新基因
最近,Wellcome Genome Campus的一项新研究演示了单细胞基因组学的力量,揭示了它如何能帮助科学家了解细胞的早期发育。这项研究发现了参与干细胞调控网络的新基因,以及新的细胞亚群,可让我们深入了解干细胞多能性——成为几乎所有不同类型细胞的能力。研究人员还为干细胞群落开发了新的资源,这将有助于解释未来的调查。相关研究结果发表在最近的《Cell Stem Cell...
Illumina扩大HiSeq X测序系统的使用 用于非人类物种
近日,Illumina公司宣布,他们将扩大HiSeq X测序系统的使用来促进用户对非人类的物种进行全基因组测序,这项更新后的使用权利或将使得HiSeq X和HiSeq X Five用户的权利立马生效,同时也将为所有的新客户提供测序系统的服务。 在世界上第一个1000美元的人类基因组及人口规模测序强烈需求的驱动下,自从2014年1...
收购继续:Agilent 2.35亿美元收购Seahorse Bio
周三收盘后,安捷伦科技(Agilent Technologies)就与海马生物公司(Seahorse Bioscience)签订了一项最终的收购协议,协议中Agilent以2.35亿美元对Seahorse Bio进行收购。 Seahorse位于马萨诸塞州的比勒利卡市,其可以帮助科学家们更好地理解细胞健康、功能以及信号转导等,同时也可以通过提供实时动力学来解析必要的细胞...
Cell Research:分子学证据揭示高盐饮食导致细胞炎症
长期的高盐饮食习惯可能会诱发一些慢性疾病,例如心血管疾病、二型糖尿病和自身免疫病等。这些疾病都与免疫系统的功能缺陷存在千丝万缕的关联,但是,高盐饮食是如何影响免疫系统从而诱发这些疾病的呢?中科院营养研究科学所研究院段胜仲领导的一个课题组发现,高盐环境会导致巨噬细胞中的炎症因子水平增加,而细胞的抗炎症因子和细胞内吞相关因子减少。这个研究可能为解释高盐饮食导致的相关疾病提供基础...
Sequenom同加利福尼亚大学合作开发基于新一代测序的ctDNA检测技术
美国西格诺(Sequenom)公司今日宣布,他们将同加利福尼亚大学开展合作进行临床研究,用于开发基于新一代测序技术的循环肿瘤DNA(ctDNA)检测技术。 基于此项合作,加利福尼亚大学Moores癌症研究中心将会测试检测血液中ctDNA实验的可用性,以此来对癌症患者进行监测,并且帮助患者进行疗法的选择。 西格诺公司首先发表声明表示,他们计划在明年1月同加利福尼亚...
干细胞先驱:助力单细胞RNA-seq的统计法
以精确的定时模式表达的基因,被称为振荡基因,在细胞分裂、昼夜节律和肢体形成这样的发育功能中,起着重要的作用。但是,因为我们不能对基因表达进行定时的观察,因此,这些基因在很大程度上是未被发现的。 最近,美国Morgridge研究所和威斯康星-麦迪逊大学的科学家们开发出一种算法,提供了一种新的方法,来识别振荡基因的动力学,并首次确定了这些早期发育力量的作用。 ...
BD公司收购单细胞基因组学新型公司Cellular Research
近日,BD公司表示,周二市场收盘后它们就已经收购了位于旧金山港湾区的单细胞基因组新型公司Cellular Research;Cellular Research 公司在2011年被斯坦福大学以及硅谷的企业家创立,用于进行单细胞基因组学的细胞研究,目前研究者们已经开发出了新型的工具,可以基于专有的分子索引技术来开发用于大规模并行单细胞遗传学分析的工具。 ...
女性伟哥将上市!FDA批准Addyi(flibanserin)用于治疗女性性欲障碍
【新闻事件】:FDA批准了Sprout的Addyi(flibanserin)用于女性性欲障碍。这是历史上第一例恢复性欲的药物。由于Addyi和酒精有严重相互作用,所以只有特殊药店才能发售这个产品。主流媒体通常把Addyi报道成女性伟哥,但Addyi既非性功能障碍药物,也不能增强正常人性欲,所以对任何性别这都是第一例。 【药源解析】: Addyi是5HT1A激动剂和5...