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专家访谈
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Nature Methods：一种快速而可靠的ChIP-seq方法
奥地利科学院的研究人员近日开发出一种新的ChIP-seq方案，将转座酶tagmentation和染色质免疫沉淀相结合，之后开展新一代测序，从而大大简化了ChIP-seq的流程。这个名为ChIPmentation的方法于8月17日在线发表于《Nature Methods》上。 转座酶tagmentation的方法最初由华盛顿大学、...
Genome Research全面解读基因组miRNA
MicroRNA（miRNA）在调控基因表达中起到了关键性作用，涉及了许多生理学和病理学过程。 成熟miRNA只有大约22个核苷酸，但它们的转录本可以长达数百kb。初级miRNA转录本（或pri-miRNA）很快就会被加工为成熟miRNA，导致RT-PCR、RNA测序等标准检测方法的灵敏度不高。由于不了解miRNA基因的启动子或剪切位点，人们...
浙江大学Cell Research发表重要成果
器官的大小决定是生物学中最吸引人的不解之谜之一。浙江大学的研究团队对此进行了深入研究，揭示了一个控制器官大小和肿瘤发生的关键回路。这项研究发表在八月十四日的Cell Research杂志上，文章的通讯作者是浙江大学生命科学研究院的赵斌教授。 Hippo信号通路在进化过程中非常保守，存在于果蝇、小鼠等多种生物中。最初人们在果蝇中发现，Hippo...
Cancer research:好心办坏事—免疫系统如何促进癌症复发？
近日，发表在国际学术期刊cancer research上的一项最新研究进展指出，给病人服用一种免疫抑制药物，阻断部分免疫系统功能，防止其功能过度或可帮助一些病人预防癌症复发。 来自英国的研究人员发现化疗药物的癌症杀伤作用能够促使白细胞聚集在被药物杀伤的肿瘤的血管周围，触发创伤愈合。这些细胞就是M2型巨噬细胞，它们本身能够修复组织损伤，建立新的血管，而这一过程恰恰可以帮...
悼念：公共卫生和患者保护领域的先驱-Frances Oldham Kelsey博士
Frances Oldham Kelsey博士，其在上世纪60年代加入了FDA医疗办公室，其为人所知，是由于其是药物安全和患者保护方面的领导者。她在第一份FDA反对案中建立了莫大的名誉：审查了一种叫做萨力多胺的药物，这种药物已经存在于全球几十个国家。 尽管该公司持续施加压力，但是Kelsey博士依然拒绝批准萨力多胺...
弥补ChIP-seq缺陷的新工具
最近，研究人员开发出一种新技术，可精确地标记“称为转录因子的调控蛋白，是在活细胞的细胞核中哪个部位与DNA相互作用”。 美国辛辛那提儿童医院医学中心的科学家，将这项研究结果发表在八月六日的《分子细胞》杂志（Molecular Cell）。这项新技术被称为SpDamID，可让科学家回答现有技术无法解决的、有关“组织发育和疾病”的基本问题。 ...
Cancerresearch：儿童体内癌细胞如何“拖垮”免疫系统？
近日，来自英国的科学家在儿童神经母细胞瘤细胞中发现一种能够破坏机体免疫细胞关键能量来源的分子，由于这种分子的作用，机体免疫系统在对抗癌细胞的过程中逐渐被"拖垮"，这项最新研究发表在国际学术期刊cancer research上。 儿童神经母细胞瘤是一种罕见的儿童癌症，能够影响患病儿童的神经细胞。在英国每年有大约90名病人被...
SeraCare允许加州大学技术来开发无创产前检测相关材料
近日，SeraCare生命科学同加尼弗尼亚大学宣布了一项许可协议，即利用21、18和13三体染色体滋养层细胞系材料为非侵入性产前染色体异常检测技术开发相关的材料。 在进行了这项协议后，SeraCare生命科学就发起了一项早期访问计划，旨在开发循环的无细胞的胎儿DNA T21、T18、T13非整倍体的相关材料。 作为这项协议的一部分，位于亚特兰大的SeraCare...
潘滔教授Nature Methods发布RNA测序重大突破
来自芝加哥大学、德克萨斯大学奥斯汀分校的研究人员报告称，他们开发出了一种新方法实现高效定量高通量tRNA测序。这种叫做DM-tRNA-seq的技术适用于在所有生物体中开展tRNA研究。这一重要的研究成果发布在7月27日的《自然方法》（Nature Methods）杂志上。 芝加哥大学生物化学和分子生物学教授潘滔（Tao Pa...
Genome Biology：RNA-seq需要多长的读长？
随着新一代测序（NGS）的读长在不断增长，研究人员也开始纠结：到底多长的读长才合适？双端测序是不是优于单端测序？近日，康奈尔大学维尔医学院的研究人员在《Genome Biology》杂志上发表文章，认为对于差异表达分析而言，读长并非越长越好。不过，双端测序和长的读长无疑能改善剪接的检测。 最初，新一代测序技术只产生25或36...
Genome Biology：RNA-seq需要多长的读长？
随着新一代测序（NGS）的读长在不断增长，研究人员也开始纠结：到底多长的读长才合适？双端测序是不是优于单端测序？近日，康奈尔大学维尔医学院的研究人员在《Genome Biology》杂志上发表文章，认为对于差异表达分析而言，读长并非越长越好。不过，双端测序和长的读长无疑能改善剪接的检测。 最初，新一代测序技术...
GSK牵手苹果ResearchKit，进入个性化“做药”时代
根据Firstword Pharma的最新消息，葛兰素史克(GSK)公司和普渡制药(Purdue Pharma)将应用苹果公司的ResearchKit框架进行药物研发，这是大药厂首次采用健康应用APP进行药物研发。 ResearchKit，是苹果公司今年3月份开发的一款新应用，用户利用苹果的APP上传数据，可以助力医生和科学家更加精准的医疗和健康研究，目前共有涉及哮...
第二军医大学Cell Research发表肝病新成果
肝纤维化（hepatic fibrosis）是肝损伤后的修复反应，许多慢性肝病到晚期都会发生这样的组织学变化，涉及一系列复杂的细胞及分子机制。肝细胞在肝脏内稳态的维持中非常关键，但人们并不清楚肝细胞在肝纤维化中扮演了怎样的角色。 肝细胞核因子1α（HNF1α）是在肝脏中含量丰富的转录因子，对于肝细胞的功能很重要。第二军医大学的研究团队发现，HNF1α调控的反馈回路...
华大基因推出桌面化测序仪
日前，华大基因推出一款桌面化的测序仪系统bgiseq-500，这是继前不久推出完全集成式的“超级测序仪”revolocitytm之后，华大基因第二款基于completegenomics技术的测序系统。与前者的大容量不同，bgiseq-500是一套小巧的集成桌面测序解决方案，可自动进行样本制 备、测序和数据分析，多种检测应用可以一键式操作。 &emsp...
Septin9 基因甲基化检测正式进入《中国早期结直肠癌筛查及内镜诊治指南》
Septin9 基因甲基化检测 正式进入《中国早期结直肠癌筛查及内镜诊治指南》 我国第一部早期结直肠癌诊断与治疗（特别是内镜手术治疗）并兼顾筛查等方面的综合性指南——《中国早期结直肠癌筛查及内镜诊治指南》日前已正式刊登在《中华消化内镜杂志》2015年第6期第32卷341-360页。该指南是由中华医学会消化内镜学分会、中国抗癌协会肿瘤内镜学专业委员会联...
FASEB：唾液酸-解开大脑疾病的关键因素
发表在2015年7月《FASEB》杂志上的一篇文章表明，高等动物包括人类体内发现的一种普通分子会影响大脑结构。这种分子可能在大脑细胞间如何通信上发挥着重要作用，这可能也揭示了患有某些脑部疾病的根本原因。通过小鼠实验研究表明唾液酸如何粘附到细胞表面这个过程会引起大脑结构损伤，运动技能差，多动症，学习困难等症状。 “唾液酸是一种分子生物学术语，细胞可利用它来完成彼此之间...
科学家发明单碱基分辨率测序技术：CeU-Seq
2015年6月15日，北京大学生命科学学院伊成器研究组在《Nature Chemical Biology》杂志在线发表题为“Chemical pulldown reveals dynamic pseudouridylation of the mammalian transcriptome”的研究论文（DOI:10.1038/nchembio.1836）。文章报道了一种通过化...
Cancer Research：牛油果成分可以抗癌
牛油果（鳄梨）是一种营养价值很高的水果，现在科学家们发现它还拥有抗癌的功效。最新研究表明，源自牛油果的分子可以有效治疗一种癌症。 加拿大滑铁卢大学的Paul Spagnuolo教授发现，牛油果中的一种脂质（avocatin B）可以通过靶标白血病干细胞，对抗急性髓系白血病（AML）。这一成果发表在十大肿瘤学期刊之一Cancer Resea...
SeqCap RNA探针组非编码RNA，融合基因都能捕获啦！
转录组测序(RNA-Seq)是了解一个物种或特定细胞在某一功能状态下所有基因表达的直接做法，但是mRNA-Seq往往需要进行rRNA去除或者polyA尾富集实验步骤；目前最热门的lncRNA-Seq则往往需要超过10Gb以上的测序量；全转录组中还有大量未知功能的RNA值得探索和研究。NimbleGen于201...
SeqCap EZ Designs探针组让Choice和Developer定制走向成熟
罗氏NimbleGen拥有高密度叠式探针算法，以及多达420万种探针库，支持各类复杂区域设计。SeqCap EZ Choice Library支持人类0-50Mb范围的外显子和基因组区域定制设计，SeqCap EZ Developer Library全面支持所有物种以及人类超过200Mb的外显子和基因组区域定制。NimbleDesign工具可支持人类基因组定制探针...