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CDC拨款230万用于开发抵御感染性疾病的新一代测序技术及生物信息学技术
上周,美国CDC宣布他们将在2016财年上拨款230万美元用于支持新一代测序技术及生物信息学技术的开发,旨在帮助改善美国感染性疾病疫情爆发的快速先进的检测诊断。 这项资助将通过流行病学及实验室能力的合作协议来进行分配,这项合作协议的任务就是帮助国家和社区解决那些已知和新发现的传染病。 据CDC生物信息学高级顾问Duncan MacCannell表示,特别是来自C...
N-of-One同领星生物科技签署协议 对中国的新一代测序技术检测进行解读
N-of-One近日宣布,他们已经签署了一项协议,向基于领星生物科技(GenomiCare)的新一代基因组测序的肿瘤学面板在中国的使用提供临床解读。 目前N-of-One公司基于基因组数据提供和特殊癌症病例相关的治疗策略,而位于上海的GenomiCare公司则可利用新一代的测序技术来帮助鉴别肿瘤外显子组的突变及拷贝数变异。 ...
Nature Methods发布新RNA测序技术
Santa Cruz公司和Rochester大学的研究人员开发了一种新的RNA测序技术。他们通过这一技术发现了许多此前未被检测到的调控性小RNA。这一成果发表在八月三日的Nature Methods杂志上。 这个新技术可以在细胞中灵敏检测到带有化学修饰(甲基化)的小RNA。“tRNA是生物体内含量最丰富的小RNA之一,细胞里到处都是tRN...
新一代测序技术连接古今人类关系
新一代测序(NGS)是一种颠覆性的技术,它的出现使得科研工作者能够以较少的经费,测取数以百万计的短DNA序列数来进行各方面的研究应用,这其中既包括对古生物的全基因组测序。 7月24日,science杂志上的一篇短评“New life for old bones”揭示了新一代基因测序技术在古生物DNA检测中的应用。 ...
科学家发明单碱基分辨率测序技术:CeU-Seq
2015年6月15日,北京大学生命科学学院伊成器研究组在《Nature Chemical Biology》杂志在线发表题为“Chemical pulldown reveals dynamic pseudouridylation of the mammalian transcriptome”的研究论文(DOI:10.1038/nchembio.1836)。文章报道了一种通过化...
任兵教授PNAS发表重要测序技术
高等生物的细胞核负责储存基因组DNA,这些DNA环绕着组蛋白形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。染色质结构对于DNA转录、复制和修复非常关键,决定着基因的表达和细胞的生理状态。人们通常使用核酸酶MNase和DNase I进行染色质结构分析,但在某些情况下这样的酶切分析并不能很好的反映真实情况。 ...
测序技术在缺失型脊髓性肌萎缩症(SMA)基因诊断中的应用
近期,天津市儿童医院儿科研究所研究人员发表论文,旨在探索将测序技术应用于缺失型脊髓性肌萎缩症(SMA)基因诊断的可行性。研究指出,测序技术在缺失型SMA患者的基因诊断上优于经典PCR-RFLP法,更方便快捷,结果更明确,建议替代常用的PCR-RFLP法。该文发表在2014年第07期《天津医药》杂志上。 设计2对引物,PCR扩增SMA致病基因运动神经元生存基因(...
基因测序技术侦破“跨国腹泻案”
英国疾控部门一个快速反应小组近日发表论文,还原了他们怎样利用全基因组测序和食品溯源技术,将一场跨国暴发的肠炎沙门氏菌疫情追溯到德国的一家禽蛋生产商。 这次疫情最初发生在2014年5月~9月之间,涉及英国中部、西北部和南部的至少287个病例。同时,肠炎沙门氏菌疫情也在法国和奥地利出现。这三国样本中得到的分离菌经过多位点可变数目串联重复序列分析((MLVA)后,发现属同一种。此后,相似病例出...
NIH:资助推动DNA条码阵列测序技术研发
基因组学公司Centrillion Biosciences本月收到来自美国国立卫生研究院(http://www.nih.gov/)一项为期两年的小企业创新研究资助,以开发DNA条形码阵列全基因组测序技术。 据悉,这项由NIH授予的资助将用于优化DNA芯片的制造工艺并进一步减少芯片的尺寸及厚度,通过调整芯片寡聚核苷酸引物取向增强引物3'末端的扩增活性并提高寡聚核苷酸合成系统的准确性...
科学家利用DNA测序技术追踪耐多药结核病的传播扩散
近期,一项发表于国际杂志Emerg Infect Dis上的研究论文中,来自伦敦大学的研究人员通过研究首次利用DNA测序技术来追踪英国结核病人多重抗药性结核病的传播扩散情况; TB(结核分枝杆菌)的传播扩散是通过吸入感染者散播在空气中的飞沫而致,TB可以长期生活在个体的肺部中而不产生任何症状,这个阶段就称为潜伏感染期。 &ems...
New Oncology计划研发新的液体活检测序技术
作为德国研究和分析公司Blacefield的一个分支,New Oncology目前主要提供称作NeoPlus的靶向测序技术,该技术能够提供超过70个与癌症相关的点突变,基因扩增,基因融合和其他重排的情况的检测,其主要是通过靶向扩增和测序技术。 在过去的6个月中,New Oncology公司通过一系列合同获得了各种资助,包括与奥斯陆...
第二代测序技术(NGS)推动个性化肿瘤学发展
目前,肿瘤学已经上升到基因组分析的前沿,它可以被用于识别驱动突变和其他标记, 临床医生也可以借此设计疗法,监测病人的反应,而突变和标记可以通过NGS技术(第二代测序技术,一个生成gigabases数据的大规模平行测序技术)显现出来。 何为NGS?它面临着哪些问题? NGS已经成...
澳发明新基因测序技术“捕获测序”有助快速诊断血癌
澳大利亚科学家发明了一种新的基因测序技术,其精度大大高于现有方法。它就像一台倍数更高的显微镜,可用于对基因组进行精细研究,并帮助快速诊断血癌(即白血病)。 这项技术被称为“捕获测序”,由新南威尔士大学和加文医学研究所的科研人员开发,发表在新一期英国《自然·方法学》杂志上。 新南威尔...
Science:新型单细胞基因表达检测技术
发表在最新一期《科学》(Science)杂志上的一篇研究论文,证实了一种新型的大规模平行测序技术可借助于新一代测序(NGS)在单细胞水平上检测基因表达。 论文作者、来自Cellular Research, Inc公司的Christina Fan博士、Glenn Fu博士以及Stephen Fodor博士,描述了这一技术并报告了几项针对人类造血系统细胞的基因表达研究结果。 ...
表观遗传学测序技术助力三阴性乳腺癌患者分层
一组澳大利亚的研究员使用甲基化特异性测序技术发现了三阴性乳腺癌中某些甲基化的差异,这些差异可能具有预后价值。 如果患者缺乏雌激素、孕激素受体,并且HER2基因没有过表达或者扩增,则认为乳腺癌是“三阴性”的。具有三阴性乳腺癌(或TNBC)的患者,可以分成两部分,即癌症进展非常迅速或者进展非常缓慢。因此,这些癌症在临床管理上是具有挑战...
Science:DNA测序技术解析免疫细胞复杂语言
我们机体的免疫系统如何帮助我们抵御外来入侵者,比如病毒、细菌、真菌及肿瘤呢?关键就在于我们机体拥有大量的B淋巴细胞和T淋巴细胞,这两种淋巴细胞都可以表达形成特殊的受体,很多年前解析这一系列复杂的机制被认为是不可能的,如今,发表在国际著名杂志Science上的一篇研究报告中,来自贝林佐纳生物医学研究所(音译,Institute for Research ...
强强联合:在CRISPR/Cas9相关研究中应用新一代测序技术
摘要: CRISPR/Cas9基因组编辑技术和新一代测序技术(也称高通量测序技术),是当今对生命科学研究有重大影响的两项技术。二者并非毫不相干。有效地将二者联用,有时可以大大加速科研进程。两者之间有什么样的联系呢?在哪些研究领域或方向上可以联用呢?本文根据在这两个领域的技术服务经验,对相关内容进行了系统地整理。 一.引言 在分子生物学的发展历史中,人们曾...
卫计委:湖南、河南高通量基因测序技术临床试点单位名单公布
卫计委在12月22日确定第一批高通量基因测序技术临床试点单位后,网络上相继公布了北京和广东地区的试点单位名单。据可靠消息湖南省此次有2个单位在列,分别是:湖南家辉遗传专科医院,和中南大学湘雅医学检验所。 河南省人民医院入选遗传病诊断专业 据悉,河南省人民医院是河南省唯一一家入选首批...
全基因组测序技术可鉴别与癌症相关的基因突变
近日,一篇发表于国际杂志EbioMedicine上的研究报告中,来自美国德州大学西南医学中心(UT Southwestern Medical Center)的研究人员指出,利用全基因组测序技术可以帮助鉴别病人患遗传性癌症的风险,这或许有助于开发出癌症预防及诊断的新型策略。 本研究首次利用全基因组测序技术对258名癌症患者机体的基因组进行了分析,从而为改善诊...
NeoGenomics与生物信息学公司合作,将测序技术投入临床应用
生物信息学公司N-of-One今天宣布与NeoGenomics实验室合作共同对癌症基因诊断公司所提供的诊断测试结果进行分析与注释。 根据协议,莱克星顿的N-of-One公司将对NeoGenomics通过基于新一代测序技术的固体肿瘤基因检测得出数据进行分析与注释,对所进行测试中的多种亚型固态肿瘤细胞的常规性和可操作基因组异常进行分析与评估。 NeoGenomics...