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专家访谈
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修改后的CRISPR筛选鉴定了防止疾病的基因
近日，MIT科学家开发了一种新型的CRISPR / Cas9基因编辑系统，应用这种最新的CRISPR / Cas9基因编辑系统，研究人员有对细胞以防止不同疾病的相关基因进行了有效筛选。 该研究对应文章则发表于最新上线的Molecular Cell杂志，名为“Randomized CRISPR-Cas Transcriptional Perturbation Screening Reveals...
模式生物斑马鱼或将用于筛选癌症患者的初始治疗方案！
早在八年前，生物学家Rita Fior就了解到，当时患有癌症需要接受治疗的母亲仅会根据所选择医院的建议接受不同癌症药物的治疗。 Rita Fior被吓倒了，她对母亲说道：“你不知道服用A或B药物中的哪个会更好，这是一个大问题。”目前她正在解决这个问题，利用模式生物斑马鱼。 本周，Fior和她的同事们宣布：她们已成功将人类肿瘤细胞植入幼体斑马鱼。 斑马鱼或将成为新型癌症研究模型，...
【Nature综述】人群筛选根除幽门螺杆菌感染，“拒绝”胃癌传染
幽门螺旋杆菌对人类来说是一种万分重要的病原体，与多种人类慢性或恶性疾病的发生息息相关。在幽门螺旋杆菌引起的疾病中，尤其以人类世界的第三大癌症杀手--胃癌出众，而由于共餐等因素，幽门螺旋杆菌在东亚地区特别是中国人群中存在着极高的携带比率，使中国人群面临着相比更高的胃癌风险。根除幽门螺旋杆菌引起的消化道溃疡可以对胃癌等一些列消化道癌症起到预防作用，这篇最新上线的Nature综述便从以下几个方面具体阐述...
Nature Medicine：全基因组CRISPR筛选找到“癌中之王”的薄弱环节
胰腺癌生长快而且转移率高，是一种非常致命的恶性疾病，被称为“癌中之王”。胰腺导管腺癌（PDA）是胰腺癌的一个主要类型，它拥有抵御化疗的物理屏障，能诱导多种免疫抑制。多伦多大学的研究人员最近通过全基因组CRISPR–Cas9筛选找到了PDAC细胞的弱点，这项研究于十一月二十一日发表在Nature Medicine杂志上。 规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas...
Nature Medicine：全基因组CRISPR筛选找到“癌中之王”的薄弱环节
胰腺癌生长快而且转移率高，是一种非常致命的恶性疾病，被称为“癌中之王”。胰腺导管腺癌（PDA）是胰腺癌的一个主要类型，它拥有抵御化疗的物理屏障，能诱导多种免疫抑制。多伦多大学的研究人员最近通过全基因组CRISPR–Cas9筛选找到了PDAC细胞的弱点，这项研究于十一月二十一日发表在Nature Medicine杂志上。 规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶C...
蛋白生物标志物的筛选
肿瘤、代谢病和心血管疾病等，尤其是肿瘤，是一个有很多因素参与的病理过程，只对其中的一种或几种蛋白进行检测，无法对疾病进行整个系统的研究。在生物标志物发现初期，应该对多种可能与疾病相关的蛋白或分子进行全面筛选。传统的单因子检测方法已不能满足科学工作者日益增多的筛选需求，而高通量检测工具可同时对多种蛋白或分析物进行检测，实现了高通量筛选和定量的目的，广泛应用于疾病标志物的早期筛查。 为什么...
Nature：CRISPR实施全基因组筛选鉴定肠道病菌感染靶标
10月20日Nature上刊登的一项研究用CRISPR实施全基因组筛选，鉴定了新兴的威胁生命的胃肠道艰难梭菌（Clostridium difficile）感染的关键靶标。美国波士顿儿童医院的Min Dong博士和Liang Tao博士领导的研究小组的工作揭示了这种细菌最强效的毒素如何进入细胞，这是开发抵抗它的疗法的第一步。 艰难梭菌会导致严重腹泻和...
Nat Biotech：MIT研究者借鉴“抗生素敏感性试验”，发现抗癌药物筛选新策略
科学家在患者身上测试治疗白血病药物的敏感性 10月10日，在线发表在《自然生物技术》（Nature Biotechnology）上的一项研究揭示：科学家开发出一种新颖的方法，来测试肿瘤药物的敏感性。据悉，这是一种可以测量单个细胞的装置，基于药物如何影响癌细胞的增长率，来预测某种特定的药物是否会杀死肿瘤细胞。 众所周知，为癌症患者选择最好的治疗方式不是一门精准的科...
英国国家筛查委员会推荐NIPT技术作为国家胎儿异常的部分筛选程序
近日，英国国家筛查委员会推荐引入无创产前筛查检测技术(NIPT)通过评估过程来作为当前英国国家卫生服务胎儿异常筛选程序的一部分，这项建议由英国国家筛查委员会在去年11月19日的会议上提出，他们建议NIPT技术应当作为当前孕妇初筛试验后，随即进行的高风险21三体综合征（唐氏综合征）、18三体综合征（爱德华氏综合征）及13三体综合征（帕陶氏综合征）的额外的...
EMT相关signatures筛选与功能分析
上皮细胞到间质细胞的转化（EMT）和肿瘤转移密切相关。近年来的研究表明lncRNA作为调控因子参与了复杂的生物学过程和疾病的发生发展。来自重庆中医药大学的研究人员利用lncRNA芯片筛选，找到了肿瘤细胞迁移相关转录因子Twist诱导的EMT过程相关lncRNA和mRNA，为我们更好的理解肿瘤转移过程中Twist通过影响lncRNA而诱导EMT的过程提供...
快速便宜的CRISPR/Cas9突变体筛选方法
新的基因组编辑工具——如ZFNs、TALENs以及最近的CRISPR/Cas9系统，已经大大提高了在不同动物模型中敲除基因的能力，包括斑马鱼。然而，对数量庞大的动物进行筛选，所需的时间和成本，仍然是一个瓶颈。 最近，意大利多恩动物研究所（Stazione zoologica Anton Dohrn）的研究人员，提出了一种快速的、...
【干货】生物标志物从筛选、确定走向临床应用
医学是否能够有效的治疗及治愈癌症直接取决于是否能够在癌症早期阶段对其进行及时的检测。生物标志物作为最直接快速有效的诊断手段，其筛选与获得可在肿瘤诊断、发展、治疗、以及疗效监测等多个方面发挥重要的作用。因此，自该概念的提出，就受到了极大的关注，成为研究的热点及重点。 这些生物标志物可以是DNA的甲基化、具有单核苷酸多态性(SNPs...
如何利用CRISPR来开展全基因组筛选
许多科学家在研究一些遗传原因还不完全清楚的疾病。那么，哪些基因对你的表型很重要？这可能需要大量的实验，来研究各个基因或整个通路在特定疾病中的作用，并协助新疗法的开发。尽管CRISPR/Cas9并非开展正向遗传学筛选实验的首个方法，但无疑是最强大的。在此，Addgene的资深科学家Joel R. McDade将教你如何利用CRISPR文库来开展全基因组的筛...
超高通量药物分子虚拟筛选平台问世
日前，国防科技大学计算机学院联合中科院上海药物研究所、广州超算中心，成功研发出一种超高通量的药物分子虚拟筛选平台，可以利用“天河二号”超级计算机，在一天之内完成对4200多万个化合物的计算评价，相当于把包括现有药物、天然产物和人工合成有机化合物在内的地球上所有可用于药物研发的化合物都计算筛选一遍。这为人类应对暴发性恶性传染病的应急药物快速研发提供了强大的计算模拟保障。 ...
用于癌症免疫疗法的高通量细胞筛选技术
最近，研究人员研制出一种新的方法，可用于癌症免疫疗法中的细胞筛选，可让我们单独研究高性能的免疫系统细胞。来自美国休士顿大学（UH）的工程师，与德克萨斯大学MD安德森癌症中心的医生合作，在国际权威杂志《Bioinformatics》杂志描述了这种方法――Time-lapse Imaging Microscopy in Nanowell Grids（TIM...
Developmental Cell:伯克利大学的科学家通过剪切基因组，构建了Cas9的筛选文库
该研究是由Andrew Lane和Rebecca Heald领导的，科学家们开发了一种从生物体本身的基因组中构建gRNAs的方法，而不是通过合成的方法。“我们推断，任何潜在的DNA序列都能够由酶加工成sgRNAs文库，并且其还可以用于标记染色体区域，”作者在近日发表在《Developmental Cell》上的文章这样写道。 gRNA是能够使CRISPR/Cas9如此灵活且强大的关键技术...
PNAS：新型癌症药物筛选芯片平台助力个体化治疗
尽管癌症干细胞（CSC）已成为一个很有前途的研究对象，但是它们很稀少，而分离起来也相当复杂，这使得它们难以应用于药物筛选。最近，佛罗里达大学的研究人员开发出一种新方法，有望克服这一障碍，在微型芯片平台上实现药物筛选。这一成果于近日在线发表在《美国科学院学报》（PNAS）上。 传统的药物筛选需要大量的细胞，这就为那些涉及到稀有细...
政府或将发文规范细胞治疗 筛选大型医疗机构开展临床研究
一位免疫细胞与干细胞治疗领域专家在券商组织的电话会议上表示，卫计委即将出台细胞治疗规范文件，并选择国内有基础和实力的医疗机构开展细胞治疗的临床研究，实现细胞治疗临床应用规范化。 日前，国务院发布《关于取消非行政许可审批事项的决定》，取消第三类医疗技术临床应用准入审批，取消的审批项目包括原来由国家卫计委负责的造血干细胞移植、...
Nature Biotechnology：利用CRISPR系统筛选癌症药物靶向目标
近日，来自美国冷泉港实验室的研究人员在国际学术期刊nature biotechnology在线发表了一项最新研究进展，他们应用CRISPR-CAS9技术靶向编码蛋白功能性结构域的外显子对癌症药物作用靶点进行大规模筛选，克服了CRISPR-CAS9技术在该方面的技术障碍，对于癌症药物靶点筛选有重要意义。 CRISPR-CAS9基因组编辑技术在发现癌症...
Cell：肿瘤3D生物样本库的建立或可用于开发个体化药物筛选技术
近日，来自韦尔科姆基金会桑格学院研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）的研究者们通过研究表示，由癌症患者机体肿瘤所衍生的类器官或许可以紧密复制原始肿瘤的关键特性；这种类器官的培养基或许可以足够进行大规模的药物筛选来检测和药物敏感性相关的遗传改变，该研究或为开发个体化疗法及优化癌症患者的临床治疗效果提供帮助。 演技组合Mathew ...