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基于高通量组学的肿瘤分子标记物识别方法
随着高通量生物技术的不断发展,多种类型的生物组学数据大量产生,为彻底理解生命分子机理提供了前所未有的新契机。然而,如何有效集成分析这些组学数据破解生命秘密成为摆在生物学家、医学家以及信息科学家面前的一道难题。 最近,中国科学院合肥物质科学研究院智能机械研究所机器智能与计算生物学实验室王红强课题组开发出一种高通量数据meta分析方法。该方法巧妙地将联合矩阵分解技术与基因调控模型相...
J Proteome Res:新型蛋白质组学技术或彻底改变乳腺癌的疗法
基质细胞由结缔组织衍生而成,其会影响肿瘤的生长,然而,近日来自维也纳医科大学等处的研究人员开发了一种新型技术,研究人员利用现代质谱法,通过对针吸活组织样品进行检测就可以探知来自乳腺成纤维细胞中的肿瘤促进活性,相关研究发表于国际杂志Journal of Proteome Research上。 长期以来科学家们熟知基质细胞会促进肿瘤生长,但是研究者们却很难理解是否是疾病间...
Perthera和美国西北大学合作整合癌症治疗的组学数据
个人癌症治疗公司Perthera,与美国西北大学Robert H. Lurie 综合癌症中心 (the Robert H. Lurie Comprehensive Cancer Center)和美国西北大学医学发展治疗研究所( Medicine Developmental Therapeutics Institute )周四共同宣布在整合组学数据上的战略性合作。 ...
基因组学与蛋白质组学两大巨头建立合作
AB Sciex和Illumina公司近日联手推出OneOmicsTM; 计划,其目的是在云计算环境中结合新一代蛋白质组学(NGP)和新一代测序(NGS)的工具。作为此计划的一部分,Illumina的应用商店BaseSpace将托管AB Sciex的SWATHTM; 蛋白质组学云工具,这使得BaseSpace成为基因组学和蛋白质组学“大数据”的一站式中...
人类蛋白质组计划:长风破浪在此时
先扯点儿废话。话说很多人对咱生物信息学领域有俩疑问:1) 你们跟华大有啥区别?2) 华大搞测序,但测序仪是国外买的,这有啥技术含量啊?这事儿甭说各位有疑问,我也是一直搞的晕晕乎乎,所以后来专门请教了北大那位来自天顶星的教授。要不怎么说外星人就是有水平呢,听完明白了。第一,咱跟华大那就像是华山派的气宗和剑宗,无非是武学理念不同,还是同气连枝。不过咱跟华山派不一样的地方是,学...
陈润生院士:生物大数据的核心是基因组数据
在2014年9月26日举行的生物大数据战略研讨会上,中国科学院生物物理研究所陈润生院士发表了精彩演讲。他从自己的研究工作出发,探讨了大数据的重要性及其所能带来的创新。其报告内容整理如下: 生物大数据最核心的部分是组学数据,而组学数据中最基础的数据是基因组数据,有了近年的基因组研究才派生出蛋白质组、代谢组、生物网络,也正是因为基因组的研究,才使得生物大数据实实在在地...
NIH向纽约相关高校投入120万美金 用于培养基因组学人才
美国国立卫生院向Buffalo 地区的高校投入120万美金,用于建立和完善学校的基因组学科建设,以鼓励更多的年轻人投身到生命科学领域。 Buffalo 大学会用这笔奖金SEPA去成立一个西纽约基因组研究中心,为周边的14所高校提供人才培养服务。 计划这笔SEPA奖金每年培训20名大学教师和500名在校大学生,持续5年...
基因组学大牛谈long-read测序
网站近日发布了一个“Long Read测序的崛起(The Rise of Long Read Sequencing)”的系列访谈。主持人Theral Timpson就long-read测序采访了基因组学领域的一些大牛。 第一位受访者是斯坦福大学的Mike Snyder,他最近在《Nature Biotechnology》和...
贝瑞和康应邀出席第十五届植物基因组大会
2014年8月19-22日在安徽合肥顺利召开了第十五届全国植物基因组学大会。会议邀请了国内外植物基因组学研究领域知名科学家作学术研究报告,充分展示了植物基因组研究领域的重大进展,推动了我国植物基因组学研究的深入和农业生物技术产业的快速发展。 贝瑞和康作为基因组学测序服务提供商,应邀举行了为时40分钟的卫星会,向与会的科研工作者介绍公司转录组产品所取...
【组学】加拿大:外显子测序发现146种罕见病致病基因
罕见疾病基因发现中心(Findingof Rare Disease Genes ,FORGE)的研究人员通过对246名罕见病患者进行全基因组外显子测序,发现了引发疾病的146个突变位点和67个异常基因。他们将这一发现发表在《美国人类遗传学杂志 》 上。 四家科研机构——多伦多基因组学应用中心、温哥华基...
Illumina:推出全球首个基因组学孵化器
Illumina公司是生命科学工具和遗传变异及功能分析集成系统的领先的开发商、制造商和销售商。它不仅能为基因分型、拷贝数变异分析、甲基化研究、基因表达分析以及DNA、RNA、蛋白质的低复制率分析等提供创新的排序和基于阵列的解决方案,同时,它还为消费者的基因组学和诊断学研究进展提供工具和服务。Illumina公司的技术和产品加快了基因分析研究及...
悼念:基因组学之父桑格95岁去世 曾两次获得诺贝尔奖
英国剑桥大学今天表示,两度荣获诺贝尔奖的英国生化学家桑格去世,享年95岁。桑格开拓人类基因研究,被尊为“基因学之父”,桑格曾自称“只是个在实验室里乱搞的家伙”,他与同事合作研发的快速为DNA定序,成为绘制人类基因组图谱的先驱。 弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger),OM,CH,CBE(Commander of Bri...
华大基因王俊:基因组学科技 推动4P医学发展
深圳华大基因研究院院长王俊今天在此间表示,基因科学从过去的实验科学逐渐向理论科学和未来的数据科学三级跳的发展过程,将重新把生命科学带向一个新的领域,最终实现“我的基因我知道,我的健康我作主”。 第十五届高交会16日在深圳会展中心开幕,在随后举行的开幕论坛上,...
Cancer Res:肝癌代谢组学研究获进展
日前,中科院大连化学物理研究所研究员许国旺团队与上海东方肝胆医院王红阳院士课题组合作,将基于液相色谱—质谱用于肝癌组织非靶标代谢组学研究并取得了重要进展,相关成果在美国《癌症研究》上在线发表。 肝癌在临床上早诊困难,治疗预后效果差。深入了解肝癌的发病机理对制定治疗方案、改善治疗效果、降低肝癌发病率和死亡率都有重要的意义。组织代谢组学方法是研...
马润林:“悦读”基因组学天书
1998年,作为中科院“百人计划”入选者受邀回国后,马润林在2001年获得国家杰出青年基金,2004年成为“新世纪百千万人才工程”国家级人选,2009年获国务院政府特殊津贴。如今,马润林是中科院遗传发育所研究员 。 “科研需要愉悦的心情,自由和快乐的精神状态才能激发创造力。”享受探究科学问题的美妙过程,是中科院“百人计划”学者、中国科学院遗...
PNAS:从基因组学角度剖析“你幸福吗?”
好的心态会对你的基因产生影响。在首个该类研究中,来自加州大学洛杉矶分校和北卡罗来纳大学的研究人员调查了积极心理状态对于人类基因表达的影响。他们发现,不同类型的快乐对人类基因组的影响有着很大的差异。研究报告在线发表在《PNAS》杂志上。 那些有着高水平实现幸福感(eudaimonic well-being,由深切地感受生活的目标和意义而获得的一种快...
华大基因:与土耳其三所大学合作 共促基因组学研究及应用
2013年6月17日,在由深圳市政府和土耳其政府联合举办的合作签约仪式上,华大基因分别与土耳其伊斯坦布尔海峡大学、Acibadem大学以及Cankiri Karatekin大学建立了合作关系。深圳市市长许勤和伊斯坦布尔市市长Kadir Topba共同见证了合作协议的签署。来自土耳其和中国的众多大学、研究院与企业纷纷参加了本次签约仪式,望进一步促...
医疗新革命:基因组学在临床研究的进展
在近日举行的2013年生物IT世界亚洲会议上,科学家和临床医生讨论他们如何在临床基因组学领域更好地协作,以促使基因组学信息应用于临床研究。 Kinghorn癌症中心Garvan医学研究机构Marcel Dinger称,基因组学将能“彻底改变我们对自身遗传代码的认识”。 基因组学研究从基础做起 就职于新加坡基因组研究所和基因组科学...
基因组学Archon X奖:重赏之下未必有勇夫 千万美元大奖遇冷
今天,基因组学Archon X奖(Archon Genomics X Prize)截止报名。然而,到目前为止,仅有两支队伍报名参与此次大奖的角逐,分别是Life Technologies旗下的Ion Torrent队伍以及哈佛大学Wyss研究所George Church 领导的队伍。1000万美元的奖金,相当丰厚,但重赏之下为何鲜有勇夫?《Natu...