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专家访谈
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转录组学方介导的多效调控蛋白 SprA 作用机制研究
Applied Microbiology and Biotechnology (AMB)为国际工业微生物领域著名杂 志。近期，浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室研究人员在该期刊上发表了 题 为 “Transcriptome-guided identification of SprA as a pleiotropic regulator in Streptom...
上海伯豪生物技术有限公司与美国AKESOgen公司就跨国基因组学服务达成合作协议
2015年1月13日，上海伯豪生物技术有限公司(SBC)与美国AKESOgen公司就跨国基因组学服务达成企业战略合作联盟。 通过本次合作，可集成上海伯豪生物技术有限公司在基因组学和生物标志物领域的专业服务优势与AKESOgen公司在测序、基因分型、甲基化检测、表达检测、PCR、qPCR、拷贝数检测以及核酸抽提等方面的专...
百健艾迪与哥伦比亚大学签订基因组研究协议
1月9日，百健艾迪公司与哥伦比亚大学医学部签订了3000万美元的研究协议，用于建立合作科研机构，旨在研究疾病基因组学和发现新的药物靶点。 协议内容包括建立一个测序及数据分析机构，以及在哥伦比亚大学设立博士后流动站以促进基因组学研究。该合作将哥伦比亚大学基因组学研究与百健艾迪公司药物研发专长相结合。 &em...
癌症基因组项目(TCGA)完成之反思
经过美国不懈的努力，涉及上万个癌基因的癌基因组项目正式告一段落。该项目在2006年开始，预计花费1亿美元进行研究，并且癌症基因组图谱（TCGA）现在已经成为国际癌症基因组协会最大的组成部分，该项目汇聚了来自16个国家的科学家，并发现了接近10万个与癌症相关的基因突变。 现在的问题是，下一步怎么办。一些研究人员希望继续关注测序；而另...
福布斯：基因组学的一些事，你应该知道
按照（美国）疾病控制和预防中心（CDC）的说法，基因组学是对人基因组上所有基因——那些双链DNA定义了我们是谁和我们由什么组成的——的研究。它建立在经典遗传学上，专注于我们的基因变异、遗传密码、生活的环境和疾病。 基因组学的前景是巨大的。会有一天，它可以帮助我们获得最大限度的个人健康和发现最好的医疗服务。它可以帮助发现新的治疗...
Proove与UNC合作开展疼痛基因组学的临床应用
Proove生物科学今天宣布其已与北卡罗莱纳大学教堂山分校牙科学院签署了独家许可协议，共同探究疼痛感相关的遗传学机制并开发疼痛感相关的诊断测试。 两家机构签署协议，共同致力于基因表达规律的研究以及疼痛相关多样化基因相关知识产权的商业化。两家机构在联合声明中表示，在此项研究的基础上，可以通过对病人疼痛敏感程度的预测来选择合适的止痛药。 ...
石乐明：快乐行走在药物基因组学研究路上
淡泊名利的石乐明非常重视自己国家“千人计划”入选者的身份，他说，这与他参与的大型国际合作研究计划密切相关，在10多个国家100多个单位的近200名科学家参与的MAQC/SEQC大型国际合作研究计划中，作为领衔者，“千人计划”的身份是自己重要的“名片”，更是自己身为中国学者的骄傲。 石乐明的研究成果也一直在为他的“骄傲”加分。近...
Fluidigm携欧洲机构开展单细胞基因组学研究
流体芯片商Fluidigm今天宣布了与威康信托基金会桑格研究所及欧洲生物信息学研究所的一项合作协议，共同开发单细胞基因组数据的新型分析方法。 Fluidigm高级研究人员将在英国斯顿的桑格研究所单细胞基因组学中心实地工作，为该机构提供最新的设备、工作流、基因组学和蛋白质组学的方法研究。 桑格研究所和欧洲分子生物学室验室的资...
NIH：1800万美元奖励疟原虫单细胞基因组学研究
NIH奖励德克萨斯生物医学研究院的科学家Ian Cheeseman 1800万美元，以鼓励其继续进行疟原虫单细胞基因组的研究。 Ian Cheeseman及其研究团队开创了一种新的检测方法，可对单个疟原虫的基因组进行测序，该方法发表在今年五月份的Genome Research杂志上。方法结合了细胞分选、全基因组扩增基因分型以及...
安捷伦与贝勒医学院共同建立代谢组学质谱分析中心
安捷伦科技和贝勒医学院近日宣布，两家机构共在贝勒医学院Alkek研究所成立了安捷伦质谱分析中心，旨在发现于应用药用生物大分子。 安捷伦将为该分析中心提供两个质谱分析系统，用于代谢组学方面的相关工作，这两个系统分别是6495三倍四极管液相色谱-质谱联用仪和拥有可切换GC APCI接口的6550iFunnel QTOF液相色谱-质谱联用仪。 这两套系统将附带安捷...
MIT和麻省总医院建立新的微生物基因组学研究中心
麻省理工MIT和麻省总医院11月份宣布投资2500万美元创办新的微生物基因组学生物信息和治疗研究中心，旨在为双方的科研人员提供研究平台以探索人类疾病与体内微生物之间的联系。这项研究炎症性肠病的旗帜性项目包含数个小的创新项目，其目的很明确，即开发新的治疗方法并将其带入临床检测应用。 这个项目的创办受到了对微生物基因组学治疗方案拥...
Cell：新型分析方法推动脑内代谢组学研究
历史上的脑代谢的研究往往都基于数量有限的目标代谢物的分析， 而最近美国斯克利普斯研究所提出了一个非产物定向性的基于光谱测定法的代谢组产物分析策略, 在老鼠大脑的解剖区域成功地发现了一系列存在广泛差异的代谢产物。 实验使用IL-2受体伽马缺失（NSG）的免疫突变小鼠模型，这种模型的设计十分人性化，能被应用于大部分的感染性疾病和肿瘤学研究。由亲水相互作用液相色谱和纳米结构成像质谱共同导...
基于高通量组学的肿瘤分子标记物识别方法
随着高通量生物技术的不断发展，多种类型的生物组学数据大量产生，为彻底理解生命分子机理提供了前所未有的新契机。然而，如何有效集成分析这些组学数据破解生命秘密成为摆在生物学家、医学家以及信息科学家面前的一道难题。 最近，中国科学院合肥物质科学研究院智能机械研究所机器智能与计算生物学实验室王红强课题组开发出一种高通量数据meta分析方法。该方法巧妙地将联合矩阵分解技术与基因调控模型相...
J Proteome Res：新型蛋白质组学技术或彻底改变乳腺癌的疗法
基质细胞由结缔组织衍生而成，其会影响肿瘤的生长，然而，近日来自维也纳医科大学等处的研究人员开发了一种新型技术，研究人员利用现代质谱法，通过对针吸活组织样品进行检测就可以探知来自乳腺成纤维细胞中的肿瘤促进活性，相关研究发表于国际杂志Journal of Proteome Research上。 长期以来科学家们熟知基质细胞会促进肿瘤生长，但是研究者们却很难理解是否是疾病间...
Perthera和美国西北大学合作整合癌症治疗的组学数据
个人癌症治疗公司Perthera，与美国西北大学Robert H. Lurie 综合癌症中心 (the Robert H. Lurie Comprehensive Cancer Center)和美国西北大学医学发展治疗研究所( Medicine Developmental Therapeutics Institute )周四共同宣布在整合组学数据上的战略性合作。 ...
基因组学与蛋白质组学两大巨头建立合作
AB Sciex和Illumina公司近日联手推出OneOmicsTM; 计划，其目的是在云计算环境中结合新一代蛋白质组学（NGP）和新一代测序（NGS）的工具。作为此计划的一部分，Illumina的应用商店BaseSpace将托管AB Sciex的SWATHTM; 蛋白质组学云工具，这使得BaseSpace成为基因组学和蛋白质组学“大数据”的一站式中...
人类蛋白质组计划：长风破浪在此时
先扯点儿废话。话说很多人对咱生物信息学领域有俩疑问：1) 你们跟华大有啥区别？2) 华大搞测序，但测序仪是国外买的，这有啥技术含量啊？这事儿甭说各位有疑问，我也是一直搞的晕晕乎乎，所以后来专门请教了北大那位来自天顶星的教授。要不怎么说外星人就是有水平呢，听完明白了。第一，咱跟华大那就像是华山派的气宗和剑宗，无非是武学理念不同，还是同气连枝。不过咱跟华山派不一样的地方是，学...
陈润生院士：生物大数据的核心是基因组数据
在2014年9月26日举行的生物大数据战略研讨会上，中国科学院生物物理研究所陈润生院士发表了精彩演讲。他从自己的研究工作出发，探讨了大数据的重要性及其所能带来的创新。其报告内容整理如下： 生物大数据最核心的部分是组学数据，而组学数据中最基础的数据是基因组数据，有了近年的基因组研究才派生出蛋白质组、代谢组、生物网络，也正是因为基因组的研究，才使得生物大数据实实在在地...
NIH向纽约相关高校投入120万美金 用于培养基因组学人才
美国国立卫生院向Buffalo 地区的高校投入120万美金，用于建立和完善学校的基因组学科建设，以鼓励更多的年轻人投身到生命科学领域。 Buffalo 大学会用这笔奖金SEPA去成立一个西纽约基因组研究中心，为周边的14所高校提供人才培养服务。 计划这笔SEPA奖金每年培训20名大学教师和500名在校大学生，持续5年...
基因组学大牛谈long-read测序
网站近日发布了一个“Long Read测序的崛起（The Rise of Long Read Sequencing）”的系列访谈。主持人Theral Timpson就long-read测序采访了基因组学领域的一些大牛。 第一位受访者是斯坦福大学的Mike Snyder，他最近在《Nature Biotechnology》和...