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专家访谈
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第十届国际基因组学大会 (ICG-10)第二轮会议通知
由华大基因举办的第十届国际基因组学大会（ICG-10，www.icg-10.org）将于2015年10月22-25日在中国深圳召开。 ICG将迎来十周年庆，自2006年第一届ICG举办至今，ICG已成为组学领域最有影响力的年度会议之一，是科学界最富活力和令人期待的国际盛会。 ICG-10将关注组学领域最新的突破和进展，会...
Illumina面向C端发力！投资消费者基因组学公司Helix
根据合作伙伴的说法，他们成立Helix是为了提供消费者可以负担的，第三方合作伙伴进行的测序和数据库服务。消费者将能够管理他们自己的数据，并进入一个由Helix伙伴提供的应用需求超市，这可以帮助他们了解基因组数据。 “基因组学的成本和知识现在到达了一个拐点，现在我们具有一个重大的机会，来解锁当前个人不能广泛应用的信息，”Illumina CEO Jay Flat...
看看8位大咖眼中基因组学的未来
过去几十年已经彻底改变了遗传学和基因组学，那么，下一个十年呢？《PLOS Biology》请了不同领域的8位牛人科学家，谈谈他们的预测。无一例外，所有预测都指向更大规模和更多类型的数据。当然，这些大牛都很乐观，许了遗传学和基因组学一个光明的未来。 Wellcome Trust Sanger研究院的Chris Tyler-Sm...
美国国立卫生院或资助研究癌症基因组学云项目的测试
近日，来自美国国立卫生研究院宣布了一些资助项目的计划，这些计划将会有效利用国立癌症研究所的癌症基因组云领航（Cancer Genomics Cloud Pilots）项目来帮助评估和开发一些数据管理基础措施。 从传统意义上来讲，基因组数据分析包括将下载的数据存储于多个位置，尝试协调这些数据，随后在当地的硬件上对数据进行计算分析...
这不是天文数字，而是基因数字
伊利诺伊大学香槟分校的研究人员预测，未来十年内，基因组学将产生世界上最大的数据集，最终超过天文学、粒子物理学，甚至是当下流行的网站，如YouTube和Twitter。 研究人员在周二的《PLOS Biology》上发表了他们的报告。这一方面证明了人类基因组的复杂度，另一方面也说明了这个领域的紧迫挑战。随着基因组学以指数速度扩展...
Nature发布比较基因组学研究重要发现
来自杜克大学医学院、Brigham妇女医院和哈佛医学院的研究人员，发现了一个机制可以解释：一些遗传突变在一种基因组中会致病，而在另一种基因组中则为良性的原因。 在发表于6月29日《自然》（Nature）杂志上的研究论文中，研究人员比较了成千上万的人类致病突变与大约100个动物物种的相似序列。他们发现一些非人类基因组携带了在人类中可导致严重疾...
基于基因组学的复杂疾病健康管理事业发展展望
一、复杂疾病的有效防治需求促进复杂疾病基因组导向下健康管理事业的发展 近年来，以心脑血管疾病、恶性肿瘤为代表的重大复杂疾病的发病在我国呈现井喷态势，其所导致的死亡已经占到我国总死亡的85% 左右，导致的疾病负担已占总疾病负担的70% 左右。重大复杂疾病已成为致死致残、因病返贫的重要原因，其早期防治已刻不容缓，如再不加以有效控制，必将会严重制约我国社会、经济的发展[1]。以预测和早...
解决基因组学重要挑战的新工具
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术，可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多，但是，仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列，从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前，去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列，还是一个手动和耗时的过程，为了去除污染序列，就需要有关它们的信息。 为了解决这个障碍...
免费！复旦统计基因组学讲习班开始报名
Lecturers: TPS: Terence Paul Speed (UC Berkeley & WEHI) WW: Wenyi Wang (UT MD Anderson Cancer Center) AT: Andrew Teschendorff (UCL & CAS-MPG PICB) Day 1 (6/24): Statistical methods...
新型N-糖苷酶催生新一代蛋白糖组学
蛋白质糖基化修饰可调节被修饰蛋白的生物学活性和组织分布，具重要生理和病理学意义。因此，继基因组学，蛋白质组学和代谢组学之后，蛋白质糖组学已成为生物医药研究的又一新热点。经数年努力，复旦大学陈力课题组从细菌中发现了一种新型N-糖苷酶F（PNGase F-II），为新一代糖组学研究创造了条件。研究结果于今年三月在国际生物化学研究的顶级杂志JBC上发表后（&...
《转》访代谢组学之父 Jeremy K. Nicholson：人类表型组研究助力精准医疗
5月6日，转化医学网受邀采访了英国代谢组学之父 Jeremy K. Nicholson和沃特世公司表型组学主任Robert Plumb博士。 转化医学网：据了解 “十二五”规划里面也提出了一个表型组人类计划，教授对中国这个领域方面的发展是怎么评价的？ 贵方哪些方面可以和国内建立合作或将要合作？合作对我们有哪些帮助？ Jeremy K. Nicholson：...
谢晓亮：当单分子遇上基因组学
当单分子遇上基因组学，它们会擦出什么样的火花？著名华人学者谢晓亮（SunneyXie）博士围绕这个话题，在《美国医学会杂志》（JAMA）上发表了文章。谢博士现任哈佛大学化学及化学生物学系教授，也任北京大学生物动态成像中心主任。 谢博士写道，单分子成像和操作的进步导致了单分子生物学的出现。由于全世界多个实验室的努力，单分子生物学已经改变了解决问题的方式，并产生了许多...
谢晓亮：当单分子遇上基因组学
当单分子遇上基因组学，它们会擦出什么样的火花？著名华人学者谢晓亮（Sunney Xie）博士围绕这个话题，在《美国医学会杂志》（JAMA）上发表了文章。谢博士现任哈佛大学化学及化学生物学系教授，也任北京大学生物动态成像中心主任。 谢博士写道，单分子成像和操作的进步导致了单分子生物学的出现。由于全世界多个实验室的努力，单分子生物学已经改变了解决...
1000个作者的论文长啥样？
现在很多研究领域的科学论文在作者名单上都出现冗长的现象，但当一篇超过1000名作者的有关果蝇的基因组学论文发表后，关于作者含义在网络上引起了广泛的讨论。在《Genes Genomes Genetics》杂志（G3）所发表的这篇论文：写了1014名作者，其中有900多名本科生。来自爱丁堡美国德克萨斯大学的无脊椎动物神经学家Zen Faulkes在他的博客中提出质疑，...
IBM的Watson系统开始用于癌症基因组学分析
Lukas Wartman博士在对抗癌症的基因战争上从零开始。圣路易斯华盛顿大学癌症基因组学的副主任开发了他自己的急性淋巴细胞性白血病。 制定治疗方案时，他的同事看着他的DNA和RNA（将DNA转变成蛋白质的化学信使），试图给他第二次机会。这是一个需要几个月时间的艰巨的过程，并需要一些研究人员的专用脑力，但...
《转》访于福利：从科研到基因组学产业实践的理想
转化医学网：首先，感谢您接受转化医学网的专访，我们了解到其实您在98年的时候就已经离开中国赴美求学，至今为止已经在国外从事了十几年的科学研究，您能不能再详细的为我们分享一下您的学习和科研经历？ 于福利：我是1998年在南开大学完成了生物化学和分子生物学的学士学位，毕业后在美国佛罗里达州立大学化学系的生物化学专业读书，从事酶反...
PLoS Med：新型基因组学工具或可帮助预测癌症患者对疗法的耐受性
近日，刊登在国际杂志PLoS Medicine上的一篇研究论文中，来自俄亥俄州大学癌症研究中的科学家通过研究开发了一种新方法，其可以测定肿瘤内部的遗传改变，这或许可以帮助医生们鉴别那些对疗法容易产生耐受性的恶性癌症患者。 文章中，研究者利用他们开发的名为MATH（mutant-allele tumor heterogeneity，突变体等位基因肿瘤异质性）的新型评分方...
UW团队完成了三阴乳腺癌的大规模蛋白质组学分析
通过20种人衍生的乳腺癌细胞系和4个患者的肿瘤样本，该研究鉴定了各种乳腺癌亚型的蛋白质，并且确定了潜在的治疗靶标，这些结果近日发表在了《Cell Reports》上。 这项工作还强调了TNBC的高异质性和由此导致该疾病治疗的困难性。 乳腺癌通常根据患者的受体状态进行分类-雌激素受体、表皮生长因子受体、孕激素受体的存在与否。这些受体中的一个或者多个在超过80%的乳腺癌患者中表达，因此...
罗氏收购CAPP Medical，拓展肿瘤基因组学领域实力
罗氏收购CAPP Medical，拓展肿瘤基因组学领域实力 近两年来，随着数以十亿计美元的投入，新的肿瘤治疗疗法不断涌现出来。基因疗法、RNAi疗法以及现在火得一塌糊涂的肿瘤免疫疗法都为人类最终解决癌症这一生死大敌做出了重大贡献。然而，面对如此多的新型疗法，医生该如何选择适合患者的疗法？在临床研究中，科学家该如何确定一种...
澳政府将出资1900万美元用于人类疾病新疗法的研究
近日，澳大利亚政府表示，他们将计划奖励一个研究团体1910万美元，鼓励其进行基因组学研究来帮助开发预防、诊断及治疗疾病的新疗法。 这项计划名为“针对性地呼吁澳大利亚进行致力于卫生保健的基因组学革命性研究”，其由澳大利亚国家卫生和医学研究委员会发起，在这项研究计划下，研究小组将接受为期5年的奖励资助来进行研究，用于阐明...