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【Cancer Research】通过肿瘤的甲基化模式确定生物标志物,有助预测肿瘤免疫环境的类型和患者预后
《Cancer Research》杂志上的一项新研究“Tumor Expression Quantitative Trait Methylation Screening Reveals Distinct CpG Panels for Deconvolving Cancer Immune Signatures”中,Moffitt癌症中心的研究人员报告了他们根据一类被称为甲基化的基因修饰鉴定出的...
文献速递 | FR+CTC可预测胃癌患者隐匿性腹膜转移和早期复发
据统计,2020年中国胃癌新发病例48万,胃癌死亡病例37万,均位列第三。胃癌复发率相对较高,尤其早期复发也较为普遍,且其预后很差。通过识别风险因子并预测早期复发,有望及时调整患者管理方案并改善预后。此外,腹膜转移(Peritoneal Metastasis,PM)是进展期胃癌常见的转移模式,也与预后不良相关。目前术前诊断PM的常规方法是CT检查,其特异性高,但敏感度低。因此探索新的...
【Nature子刊】大改进!新Cas9模型定位DNA切割位置,预测脱靶概率——朝着更高精度的基因编辑前行!
来自代尔夫特理工大学(TU Delft)的研究人员提出了一个基于物理学的模型,建立了用CRISPR-Cas9进行基因编辑如何工作的定量框架,并允许预测在哪里、有多大概率以及为什么会发生靶向错误(脱靶)。这项已经发表在《Nature Communications》上的研究,题为“A kinetic model predicts SpCas9 activity, improves off-tar...
【PLOS Biology】提前几十年预测!脂质组学分析——确认罹患糖尿病、心血管疾病的风险!
3月3日发表在《PLOS Biology》上的一项新研究表明,同时检测血液中的数十种脂肪("脂质组学")可以预测未来患2型糖尿病(T2D)和心血管疾病(CVD)的风险。这种早期预测可以为在疾病发展之前推荐饮食和生活方式干预提供依据。该研究题为:“Lipidomic risk scores are independent of polygenic risk scores and can pre...
【Nature子刊】人工智能提供了一种更快预测抗生素耐药性的方法,时间可提前长达24小时!
抗生素耐药菌在全世界呈上升趋势——瑞士也不例外。每年,仅在瑞士,由多重耐药菌引起的感染就会导致至少300人死亡。快速的诊断检测和抗生素的靶向使用在遏制这些抗生素耐药性“超级细菌”的传播中起着至关重要的作用。 然而,确定哪些抗生素对特定病原体仍然有效通常需要两天或两天以上的时间,因为来自患者样本的细菌首先必须在诊断实验室中培养。由于这种延迟,许多医生最初用一类被称为...
【Nature】新发现!一种预测心血管疾病的细胞行为模式
西班牙国家心血管病研究中心(CNIC)的Andrés Hidalgo博士领导的科学家发现,免疫系统的循环中性粒细胞在炎症过程中获得不同的行为模式。这项研究发表在《Nature》上,题为“Behavioural immune landscapes of inflammation”,确定了一种与心血管疾病相关的有害中性粒细胞行为。 该研究提供了可能开发新治疗方法的重要信...
【Science子刊】机器学习精准预测抗生素耐药性,有望实现自由控制抗生素耐药性的传播!
基因不仅通过出生而遗传。细菌也有能力通过一种叫做水平基因转移的过程相互传递基因,或者从环境中获取基因,这是抗生素耐药性传播的罪魁祸首。 该研究论文于昨日(10月22日)发表在《Science Advances》上,名为“Functions predict horizontal gene transfer and the emergence of antibiotic...
【突破】人工智能预测阿尔茨海默症,准确率超99%!
阿尔茨海默病(AD)是一种起病隐匿的进行性发展的神经系统退行性疾病。临床上以记忆障碍、失语、失用、失认、视空间技能损害、执行功能障碍以及人格和行为改变等全面性痴呆表现为特征,病因迄今未明。65岁以前发病者,称早老性痴呆;65岁以后发病者称老年性痴呆,它影响着世界上大部分老龄化人口。因此,早期诊断这种疾病以建立有效护理和改善患者生活的必要性再怎么强调也不为过。 立陶宛...
文献解读 | FR+CTC可预测早期NSCLC术后复发和转移
肿瘤转移是非小细胞肺癌(NSCLC)患者死亡的主要原因,这些患者5年生存率仅4%。既往研究证实,大约50% NSCLC患者在术后5年内复发,鉴别术后复发高风险患者将有助于确定术后辅助治疗方案从而改善患者预后。当前主要基于影像学和病理学对肺癌患者进行诊断和分期,无法准确评估患者术后复发或转移的风险。一项长达7年随访的研究证实,术前叶酸受体阳性循环肿瘤细胞(FR+CTC)水平与患者预后密切相关,...
【Science子刊】基于血液样本就可以确定的生物标志物——可预测患者对免疫疗法的反应
近年来,基于免疫的癌症治疗为医生和患者带来了希望。被称为免疫检查点抑制剂的药物为越来越多的患有各种癌症的人提供了救命的益处,包括黑色素瘤、肺癌、膀胱癌等等。尽管围绕这些药物令人兴奋,但令人沮丧的症结在于医生无法预测谁会从中受益,谁不会受益。 2021年8月25日,纪念斯隆·凯特林癌症中心的一组研究人员在《Science Translational Medicine》...
【JAMA子刊】科学家找到预测儿童白血病新方法!
最近,发表在《JAMA Oncology》上的一项新研究报告称,当两种不同的DNA变化同时发生时,它们似乎可以预测侵袭性儿童白血病。研究人员发表了一篇题为“Association of Combined Focal 22q11.22 Deletion and IKZF1 Alterations With Outcomes in Childhood Acute Lymphoblastic&nb...
【Nature】基因变异可预测更年期的早晚?揭秘基因变异与更年期的关系
在一项对20多万名妇女的研究中显示,数百种基因变异可以帮助确定她们更年期的年龄。290个变异基因中,有许多控制着身体对DNA受损的未成熟卵的反应,强调了这些过程的重要性并表明有一天可以利用这些过程延长人类的自然生殖寿命,或提高体外受精技术的成功率。近期,有研究人员在Nature上发表了一篇题为“Genetic variations could one day help predict tim...
从肺癌患者7年随访数据看FR+CTC检测在肺癌预后预测中的价值
近日,由复旦大学附属肿瘤医院联合格诺生物开展的关于叶酸受体阳性循环肿瘤细胞(FR+CTC) 水平在非小细胞肺癌(NSCLC)患者预后预测中临床价值的研究成果(Preoperative Folate Receptor-Positive Circulating Tumor Cell Level Is a Prognostic Factor of Long T...
【Nature子刊】基因生物标记物可快速准确预测肝毒性和潜在的肝癌!
农用化学和制药公司开发新产品时,必须先进行广泛的潜在毒性测试才能获得监管部门的批准。该测试通常需要冗长而昂贵的动物研究。 近日,伊利诺伊大学研究人员开发了一种基因生物标志物识别技术,并发表在《Scientific Reports》,题目为:“Identification of early liver toxic...
【新进展】科学家开发新型“表观遗传时钟”可洞悉人脑衰老进程 预测疾病风险
人类DNA甲基化数据已被用于开发表征衰老的生物标记物,称为“表观遗传时钟”。但现有的DNA甲基化时钟准确性较低。近日,埃克塞特大学的科学家开发一种新的表观遗传时钟。由于使用了人脑组织样本,因此新时钟比以前的版本要精确得多,可以洞悉大脑中的加速衰老与痴呆症等脑疾病的关系。 该研究于10月28日发表在《大脑》,题为...
【Nature子刊】癌细胞“隐身”怎么办?英美科学家利用数学模型预测癌症进化方向和免疫治疗效果
但癌细胞也不是“吃素”的,癌细胞之所以厉害,就是因为它有“隐身”功能,因此,免疫治疗也并不是对所有的癌症患者都有效。盲目进行免疫治疗不仅成本巨大,还可能适得其反,所以预测癌症的进展和免疫治疗的有效性十分重要。 对此,一个英美研究团队建立了一个数学模型,可以确定免疫系统...
【新突破】心率可预测抑郁风险,结合AI,准确率高达90%!
据世界卫生组织给出的报告:抑郁症的最坏后果是可能导致自杀行为,这是目前15-29岁人群的第二大死亡原因。 根据一项流行病学调查数据,中国抑郁症患者数量或接近一亿人,情况已经不容乐观。因此,全社会急需有效的预测、缓解和治疗抑郁症的方法。 一项新的初步研究发现,通过分析一个人24小时内的心率,预测其抑郁...
【PLOS子刊】AI融合基因组学研究预测阿尔茨海默病的早期分子标记
近年来,深度学习技术不断推动着人工智能(AI)技术革命。受下一代测序(NGS)技术进步的启发,基于组学的研究数据已经变得易于访问和标准化。近日,韩国脑科学研究所的一项研究使用先进的对抗性生成网络(GANs)的深度学习技术分析了阿尔茨海默氏病(AD)小鼠模型的大脑皮质组织数据。结果发现,β淀粉样蛋白在疾病的早期含量增加并改变胆固醇的生物合成。 &...
【Nature子刊】基因检测公司Natera的Signatera ctDNA测试显示出晚期癌症的免疫疗法反应预测能力
Natera的Signatera方法能够个体化设计16种独特的克隆性体细胞变体,随后进行多重PCR(mPCR)和超深度测序(靶标平均> 100,000个reads),用于全血样品纵向ctDNA分析并检测微小残留病变(MRD)。2019年5月,Signater检测产品获得FDA“突破性设备”认定,用于癌症患者术后ctDNA的检测和定量。 ...
【JAMA子刊】提前20年!新血液检测技术准确预测阿尔茨海默症
老年痴呆症的进展有标志性三重特征——淀粉样斑块病变、进行性神经元死亡和神经元内tau蛋白的异常积聚。tau蛋白的异常积聚是其中最为明显的。 tau蛋白的一种特殊形式,p-tau217是最早出现变化的蛋白,这种蛋白聚集在一起,在神经元内形成缠结,导致细胞功能失常,从而导致阿尔茨海默症和认知能力下降。其水平似乎也与淀粉样蛋白有关,淀粉样...