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专家访谈
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Broad 研究所携手亚马逊、谷歌、IBM等开展基因组云端分析软件
剑桥Broad研究所带来了它的云端基因组分析工具——与亚马逊、Cloudera、谷歌、IBM、英特尔、微软合作。 这个压缩到GATK的工具包，是由哈佛-麻省理工学院开发的高通量测序数据分析软件。自从去年阿尔法（alpha）在谷歌的基因组学基础上推出后，现在已有全世界3.1万注册用户。 Broad与谷歌基因组的合作，使得GATK作为一个SaaS格式（软...
Illumina出手领投 基因检测公司Human Longevity获2.2亿美元B轮融资
以基因组学为基础技术驱动型美国公司Human Longevity Inc.（HLI），今天宣布完成发行总价值超过2.2亿美元的B轮优先股。此前在2014年上半年，HLI公司获得了8000万美元的A轮融资。 对此，HLI联合创始人及首席执行官Craig Venter博士表示：“HLI之所以能在如此激烈竞争的金融市场中获得数量可观的...
Nature首次揭示年龄如何影响癌症
当随着时间的推移我们的细胞累积损伤并发生慢性炎症时，癌症的风险会随人的年龄而增长。现在由Wistar研究小组领导的一个国际研究小组证实，黑色素瘤中老化的肿瘤细胞与年轻肿瘤细胞表现不同。他们的研究结果发布在4月4日的《自然》（Nature）杂志上。 微环境的改变使得这些老化肿瘤细胞更具转移性，对靶向治疗具有更强的抵抗力。根据这些研究结果，科学家们演示了如何让抗氧化剂作为...
DNA编码分子库为药物发明提供便利
图片来源：KTSDESIGN 随着DNA编码分子库持续扩大以及新的筛选方法不断开拓未知生物学领域，DNA编码分子库将成为制药行业研发新药的支柱之一。 在美国马萨诸塞州沃尔瑟姆市一座混凝土建筑的二楼，一台普通实验室冰箱的塑料盒子里放着一根透明试管，里面则含有天文数字尺度的混合物。这个分子库里冷冻的是由...
Nature子刊：新改良让基因治疗更有效
“睡美人”转座子被人们广泛用于基因组改造，在白血病和淋巴瘤的临床试验中表现出很大的潜力。EMBL的科学家们最近解析了“睡美人”转座子的关键结构，并在此基础上进行改良，大大提升了该转座子插入基因的效率。这项研究发表在3月31日的Nature Communications杂志上。 在白血病和淋巴瘤治疗中，“睡美人”转座子被用来给患...
免疫细胞治疗领域的市场概况梳理
细胞治疗产业包括干细胞治疗和免疫细胞治疗，上次已经介绍过干细胞治疗领域的市场概况，这次仅对免疫细胞治疗领域的市场概况做以处理。 1. 肿瘤治疗领域的“金矿” 免疫细胞治疗是指把病人的细胞从血里面分离出来，在体外用一些细胞因子，使它变成一种杀伤细胞，再回输到血液中去，这种杀...
美国院士挑战DNA编码规则
A、C、G和T——代表四个化学碱基，存储着DNA中的信息。一系列这样的四个碱基，以一种特定的顺序进行重复，定义了一个有机体。在更短的基因组序列中，三字母的密码子代表着20种经常使用的氨基酸当中的一个，64个三字母密码子中有三个终止密码子。这些氨基酸是执行许多功能的蛋白质的构建模块。例如，丙氨酸可以由三字母的密码子GCU表示，半胱氨酸可由三字母的密码子U...
Nature重大发现改写表观遗传理论
传统的观点认为，5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine, 5mC)是哺乳动物中唯一的甲基化形式。发表于3月30日《自然》（Nature）杂志上的一篇新论文将改写这一理论，来自耶鲁大学和其他研究机构的科学家们报告称，他们在小鼠胚胎干细胞(ESCs)中发现了N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenine，N6-mA)。通过这一研究项目，该研究小...
CRISPR先驱 Doudna发表最新研究成果
Argonaute蛋白是真核生物RNAi的关键效应子，它还参与了原核生物的基因组防御。加州大学伯克利分校的研究人员最近在细菌中发现了一种CRISPR相关的非经典Argonaute。研究显示，这种Argonaute蛋白有着与众不同的特异性。 这项研究发表在三月三十日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上，文章的通讯作者是著名CRISPR先驱Jennifer A. Dou...
ASCO：2016美国癌症治疗现状报告
近期，ASCO 在 Journal of Oncology Practice 上发布了美国癌症治疗现状报告2016版。在这项报告中，ASCO 指出了目前美国癌症治疗方面获得的进展与面临的挑战，新型医保法案的成果与不足，高质量治疗模式的开发与应用等问题。 2015年，美国的癌症治疗依旧呈现出一种复杂的局面。死亡率降低，癌症幸存者数...
Cell Stem Cell发表单细胞RNA测序新成果
寨卡病毒是一种新出现的蚊媒病毒。2015年5月，巴西开始出现寨卡病毒感染疫情，这种病毒随后在美洲快速蔓延。世界卫生组织称，越来越多的证据表明寨卡病毒与小头畸形之间存有关联。针对这种疾病，目前尚无特异性治疗办法或者疫苗。最佳预防方式是采取保护措施，避免蚊子叮咬。 三月四日，Johns Hopkins大学的宋红军（Hongjun S...
CAR-T细胞疗法商业化 不再遥远
免疫治疗可谓近年来的热门话题，人们高呼着：治愈癌症不是梦。CAR-T细胞疗法的研究日趋白热化，许多制药公司也在纷纷追赶这一狂潮。去年8月份，Terumo BCT公司的专家Tim Taga在GEN网站撰文称，尽管CAR-T疗法表现出惊人的潜力，不过公司在制造这些细胞时仍面临一些重大问题（CAR-T细胞疗法的商业化并非坦途）。 最近，美国Fred Hutchinson癌症...
质谱流式带来开创性革新
现任哈佛大学医学院Dana-Farber癌症研究所流式实验中心负责人的John Daley，从1979年开始接触流式细胞技术至今，已经有36年之久，对这项技术和其发展历史了如指掌。 即便如此，当他第一次接触到质谱流式技术（CyTOF- cytometry by time-of-flight）的瞬间，便被深深地迷住了。“这太令人难以置信了，很难想象有一种方法可以...
Nature医学惊人发现：肠道菌能缓解中风？
中风是世界上第二大致死疾病，每年都有数百万人因为中风而死亡，还有更多的人因为中风永久性残疾。这种毁灭性的疾病常常毫无征兆地发生，令患者突然丧失独立生活的能力。Weill Cornell医学院的研究人员最近发现，特定肠道菌能利用免疫系统减轻中风的严重性。这项研究发表在三月二十八日的Nature Medicine杂志上。 研究人员先用一组抗生素处理小鼠，两周后再诱导小...
干货！一文读懂液态活检研究进展及技术平台
液态活检（liquid biopsy） 液态活检这一概念最早在1974年由Sorrells等提出。液态活检主要检测对象包括：循环肿瘤细胞（CTC）、循环肿瘤DNA（ctDNA）以及肿瘤外泌体（exosome）等，它们来源于肿瘤组织，存在于血液，可以提示肿瘤发展进程及抗药性等信息，指导个体化精准治疗。与现有肿瘤检测方法相比，液态活检无侵入性、可频繁多次检测及快速...
聚焦｜强强联手 + I期临床，TESARO加速肿瘤免疫疗法
继上周完成了1.55亿美元的私募之后，TESARO公司又有了新的动作。作为一家成立于2010年的新兴生物制药公司，TESARO在肿瘤免疫学产品上成绩可圈可点。今天，TESARO的候选药物又取得了新进展。该公司宣布给第一个I期临床病人使用了其研发的抗PD-1单克隆抗体候选药物——TSR-042。TSR-042是TESARO的肿瘤免疫产品组合里面进入临床试验...
单细胞ATAC-seq——肿瘤表观遗传学研究的利器
人类细胞的DNA约有6英尺长，如何将这些DNA装入直径仅为5微米大小的细胞核中是细胞面临的一个巨大的拓扑学挑战。细胞的解决方案是将DNA进行不同层次的折叠形成可以调控的结构，这其中最重要和最基本的结构就是核小体，进一步再由核小体包装形成染色质[1]。 在每个细胞中组成基因组的60亿个碱基中只有小部分具有生物学活性，能与转录元件结合开始合成RNA，而剩下不活跃的DNA则被包装成高度凝聚的染...
单细胞技术新突破：在单细胞水平实现蛋白与RNA的同时检测
单细胞分析技术有很广的范畴，包括进行核酸水平检测的各种单细胞测序及PCR技术，还有进行蛋白水平检测的质谱流式等等。迥异的检测技术手段使我们很难同时对单细胞的核酸和蛋白进行高通量的检测。2015年底，随着《Nature methods》一篇文章的发表，这种情况成为了历史。 引发这一技术突破的是美国斯坦福大学的Garry Nolan实验室，他们成功的将...
专访Dana-farber流式中心负责人John Daley
现任哈佛大学医学院Dana-Farber癌症研究所流式实验中心负责人的John Daley，从1979年开始接触流式细胞技术至今，已经有36年之久，对这项技术和其发展历史了如指掌。 即便如此，当他第一次接触到质谱流式技术（CyTOF- cytometry by time-of-flight）的瞬间，便被深深地迷住了。“这太令人难以置信了，很难想象有...
透视单细胞DNA分析
人物简介： Gajus Worthington，美国Fluidigm公司创始人、CEO。 近年来， 他领导之下的Fluidigm公司将其独特的微流控芯片技术，开发了其包括C1、Biomark、Polaris等在内的单细胞分析产品线，在单细胞分析领域占有重要的一席之地。 Fluidigm公司很早就开始专注单细胞分析这...