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Genome Biology:RNA-seq需要多长的读长?

2015-07-22

  随着新一代测序(NGS)的读长在不断增长,研究人员也开始纠结:到底多长的读长才合适?双端测序是不是优于单端测序?近日,康奈尔大学维尔医学院的研究人员在《Genome Biology》杂志上发表文章,认为对于差异表达分析而言,读长并非越长越好。不过,双端测序和长的读长无疑能改善剪接的检测。   最初,新一代测序技术只产生25或36...

陈竺、陈赛娟院士Nature Genetics发表肿瘤研究新成果

1970-01-01

   由上海交通大学领导的一个研究小组报告称,他们采用外显子组测序技术绘制出了自然杀伤/T细胞淋巴瘤(NKTCL)基因组学图谱。这一重要的研究成果发布在7月20日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。   上海交通大学系统生物医学协同创新中心的陈赛娟(Sai-Juan Chen)院士、陈竺(Zhu Chen)院士及...

Genome Biology:RNA-seq需要多长的读长?

1970-01-01

      随着新一代测序(NGS)的读长在不断增长,研究人员也开始纠结:到底多长的读长才合适?双端测序是不是优于单端测序?近日,康奈尔大学维尔医学院的研究人员在《Genome Biology》杂志上发表文章,认为对于差异表达分析而言,读长并非越长越好。不过,双端测序和长的读长无疑能改善剪接的检测。   最初,新一代测序技术...

NBA携手GE医疗推动骨科与体育医学研究

1970-01-01

近日,美国纽约 ? 美国全国篮球协会(NBA)与 GE 医疗集团宣布了一项合作,双方将共同推动骨科和体育医学的研究工作,这一研究将为 NBA 运动员以及更多处于不同水平的普通运动爱好者的身体健康带来福利。这项为期多年的合作,将专注于 NBA 运动员和普通运动爱好者所面临的关节健康和急性运动过量肌肉骨骼损伤等难题进行研究。 NBA 总裁 Adam Silver 表示:...

新研究所将继续马航MH17遇难者Joep Lange的相关HIV研究

2015-07-20

  Joep Lange研究所上周三正式宣布,将会与荷兰阿姆斯特丹的一个医疗中心展开一个新的合作,Joep Lange 曾经在该中心担任教授,并且该计划获得了全球健康与发展中心的资助。新的研究所将会在今年晚些时候在阿姆斯特丹开门,该研究所获得了美国大约2000万美元的各种私人资助。发言人拒绝透露这些捐赠者的名单,但是他说会在今年晚些时候公布相关情况。而Joep Lange Chair and Fe...

Celgene在酝酿一盘大棋牵手CAR-T先驱Juno入主肿瘤免疫

1970-01-01

Celgene公司10亿美元斥巨资争夺CAR-T癌症疗法的制高点:这一大型的生物科技公司预付了1.5亿美元,并以高达93美元/每股的溢价收购了Juno公司910万股,并与其签署了全球合作协议,共同开发和商业化新的肿瘤免疫疗法,期望以这一方式入主全球化的癌症免疫治疗领域。 这一交易(包括了Juno公司在TCR领域的研究成果)使得Celgene公司拥有了Juno公司10...

德国卢森堡大学研究人员因数据造假被撤稿

2015-06-26

  据Retraction Watch网站消息,由于论文的第一作者被调查出有学术不端的行为,《致癌基因》(Oncogene)准备撤销德国卢森堡大学一研究小组的的一篇论文。   该论文主要研究某基因在乳腺癌细胞入侵时发挥的作用。该论文于2010年发表,2012年就经调查确认论文第一作者Guillaume Vetter博士学术不端,但直到现在该稿件还未被撤销。对此,卢森堡大学生...

Oncogene:黑色素瘤病人抵抗BRAF抑制剂新机制

1970-01-01

在过去十年中,靶向药物的开发显著提高了黑色素瘤病人的生存率,但由于这些治疗方法并不能杀死所有肿瘤细胞,癌症复发的情况比较常见,而存活下来的癌细胞会适应治疗药物并产生抗性。最近,来自美国moffitt癌症中心的研究人员进行了相关研究发现了导致黑色素瘤细胞抵抗靶向BRAF的抑制剂药物的新分子机制,并将相关研究结果发表在国际学术期刊oncogene上。 ...

TCR+GeneTherapy=肿瘤治疗新希望?Kite/Bluebird联手开辟新方向

1970-01-01

肿瘤免疫疗法在近几年以其出色的临床效果获得了整个市场的认同。而这其中绝大部分的光芒都被CAR-T疗法占据。而其他的肿瘤免疫疗法似乎只能活在CAR-T的"阴影"中。而试图进入CAR-T领域的生物医药公司也如同过江之鲫一般络绎不绝。不过,最近肿瘤免疫疗法的先驱Kite公司则向外界传递了一则不一样的信息。公司表示将与基因疗法领跑者Bluebird公司合作推动TCR疗法与基因疗法的结...

SaferGene首推Uni-DMX ,使Illumina Xten全基因组数据生产时间缩短至1小时

2015-06-19

  据BBC Research的数据显示,全球基因测序市场总量从2011年的20亿美元增长至2018年的117亿美元,复合年均增长率达21.2%。目前基因数据的生产相对简单,但是对基因组数据的安全、存储、计算及分析已成为该领域最主要的瓶颈。目前基因测序数据分析市场的复合年均增长率为23%,2018年将达到35亿美金。SaferGene的Uni-DMX产品...

高校发表《Nature Genetics》论文最新排名(2014-2015)

1970-01-01

英国著名杂志《Nature》是世界上最早的国际性科技期刊,也是世界上最权威的科学杂志之一。近期Natureasia公布出版了《自然》增刊《2015自然指数―全球篇》。 从总体水平来看,中国的加权分数式计量(WFT),从2013年到2014年增长了16%,同时中国在东亚及东南亚地区的指数表现居首,其WFT值占本地区的二分之一。中国最主要的论文合作国家是美国、英国和德国...

Oncogene:战胜晚期癌症的克星

1970-01-01

   最近,由美国约诊所肿瘤学家带领的一个国际研究团队,发现了一种新途径,可识别并可能阻止许多晚期癌症的进展,包括膀胱癌、血癌、骨癌、脑癌、肺癌和肾癌。 这项精密医学研究在线发表于六月十五日的国际知名杂志《Oncogene》,集中于肾肿瘤及其转移。最近在其他癌症中对同一表观基因组指纹进行的研究表明,有一个共同的途径,可帮助改善各种肿瘤晚期患者的诊...

PlosPathogens:疱疹病毒和疟原虫或形成致命组合

1970-01-01

疟疾一直是困扰人类的高致死性疾病之一。患上严重疟疾的儿童大约有20%会死亡。实际上,让患上疟疾的情况更加糟糕的是,同时感染了疟原虫和其他致病菌(或寄生虫)。在非洲泛撒哈拉地区,很多婴儿在出生六个月的时候就感染了人类四型疱疹病毒(EBV)。而这个时间正好是婴儿体内来自母亲的抗体开始减弱的时候,这个阶段也很容易感染上疟原虫而患上疟疾。 近期发表在《Plos Patho...

Oncotarget:科学家鉴别出可促进乳腺癌发生转移的特殊靶向基因

1970-01-01

一种特殊的人类基因突变体或可使乳腺癌细胞变得更加具有攻击性,从而使得乳腺癌细胞不仅对化疗产生耐药,而且使得原发性肿瘤开始扩散;近日来自维也纳医科大学的研究人员通过研究发现,名为AF1q的基因或可使得乳腺癌细胞变得更加具有侵略性,同时该基因或许也可以作为一种新型靶点来帮助开发治疗乳腺癌的靶向性疗法。 人类机体的AF1q基因是在染色体异常时发现的,而且该基因被认为是白...

戴尔公司为TGen机构提供300万美元的资金以支持其癌症药物研究

2015-06-15

戴尔公司近日宣布他们将为TGen机构(翻译基因组学研究院)提供300万美元的资金支持,支持其目前正在进行的对于神经母细胞瘤和髓母细胞瘤的研究项目,该项目是与转化型研究联盟合作研究的,该组织主要致力于研究儿童癌症。 戴尔公司称,TGen机构和其合作伙伴将利用最新的这笔投资优化高性能的电脑基础设施,用于分析和储存儿童癌症治疗方案研究的基因组数据,该研究主要针对欧洲和中东地区。 ...

罗氏NimbleGen为您提供从建库至捕获全方位配套试剂

2015-06-11

定向二代测序方法,先进行目标序列捕获富集而后进行二代测序,已成为现今基因组研究方法最主要的方法之一,尤其在疾病相关基因的研究得到非常广泛的应用。二代测序文库制备是整个实验流程的第一步,建库高质量的高低会影响最终的捕获测序结果。尤其在疾病相关研究中,样本种类多、质量参差不齐,也给测序文库制备带来了新的挑战。 罗氏NimbleGen是序列捕获技术领导者之一,而Kapa  ...

SeqCap RNA探针组非编码RNA,融合基因都能捕获啦!

2015-06-11

        转录组测序(RNA-Seq)是了解一个物种或特定细胞在某一功能状态下所有基因表达的直接做法,但是mRNA-Seq往往需要进行rRNA去除或者polyA尾富集实验步骤;目前最热门的lncRNA-Seq则往往需要超过10Gb以上的测序量;全转录组中还有大量未知功能的RNA值得探索和研究。NimbleGen于201...

罗氏 NimbleGen SeqCap EZ外显子组捕获系列产品—助力精准医疗,让遗传病研究Easy to Go

2015-06-11

NimbleGen的外显子捕获产品经过多年的发展与优化,形成了丰富的产品线。在精准医疗日益受到重视的今天,NimbleGen外显子捕获产品越来越多的应用于基础科研及临床研究,帮助研究者定位致病突变,提高诊断精度,让个性化治疗方案造福更多病患成为可能。从2011年起,美国贝勒医学院的专家团队就开始利用NimbleGen人类全外显子组捕获产品结合测序进行遗传病机理挖掘的工作,走在了精准医疗的最前...

Oncogene:microRNA让乳腺癌化疗效果更好

1970-01-01

发生治疗抵抗是系统性癌症治疗的主要缺点。利用传统化疗方法治疗侵袭性三阴性乳腺癌会在很短时间内产生治疗抗性,但其中的机制仍不清楚。近日,来自美国的华人科学家在国际学术期刊oncogene在线发表了一项最新进展,对化疗方法治疗三阴性乳腺癌导致治疗抗性产生的机制进行了深入探讨。 在该项研究中,研究人员发现基因毒性治疗方法能够显著增加三阴性乳腺癌细胞中miR...

Celgene收窄与Bluebird在CAR-T领域合作范围

1970-01-01

随着CAR-T疗法的不断推进,这一领域的光明前景已经逐渐明朗。而与这一趋势相适应的则是众多"错失先机"的生物医药公司纷纷进行合纵联合,试图在这一领域中站稳脚跟。2013年,Celgene与Bluebird两大生物巨头签订了合作协议共同开发CAR-T疗法,整个协议的里程碑金额将达到2亿2千5百万美元之多。而就在最近,Celgene公司突然宣布,将收窄与Bluebird公司在这一领...